Le 26/01/2015 12:43, Stephanie MAHEVAS a écrit :
>
> *voilà la conclusion. Est-ce que cela correspond à tes notes?
> *
>
> *GetRecruitment : *migrations et changement de groupe s'opéraient sur les
> oeufs (groupe nul). Il est nécessaire de distinguer deux configurations :
> description d'une reproduction ou d'une relation stock-recrutement*.    *
>
> ·        *groupe 0 : groupe (age ou longueur) dans lequel apparaisse les
> individus qui peuvent subir de la mortalité par pêche, des migrations, des
> changements de classe (c'est à dire normalement le recrutement)*
>
> ·        *on distingue deux équations : ponte (reproduction) et le recrutement*
>
> ·        *ponte : équation appelée à chaque mois de la saison de reproduction,
> elle met à disposition l'abondance à t et retourne le nombre d'oeufs  (matrice
> zone*temps). A chaque pas de temps entre l'instant de ponte et le recrutement,
> cette matrice subit uniqment la mortalité naturelle du groupe null. Au moment
> du recrutement elle subira une migration zoneRepro-zoneRecru.*
>
> ·        *recrutement : équation appelée à chaque pas de temps de la saison
> recrutement (définie par saison de repro, etalement recru et delta), les
> recrues sont récupérées dans la matrice de ponte par défaut. Il est possible
> d'écrire une relation stock-recrutement différente (constante, fonction
> d'autres parametres ou variables). Dans cette équation on accède aussi à
> l'abondance aux instants de la reproduction précédente (t-delta).*
>

Voici comment nous avons implémenté ce que nous avons compris:

 - une équation de recrutement a été ajoutée dans la population
 - le code de recrutement reste inchangé (suite au dernier ajout de Benjamin)
par défaut
 - l’équation de recrutement est appelée à tous les pas de temps

La signature de l’équation est la suivante:
public double compute(SimulationContext context, TimeStep step,
            Population pop, AbundanceAndReproMap abundanceAndRepros, MatrixND
result) throws Exception;

La matrice de recrutement "result" est celle calculée par IsisFish, si
l’équation ne modifie pas cette matrice, l’équation n'a pas d'effet.

Un nouvelle objet "abundanceAndRepros" est disponible, il contient les
abondances et la matrice de production de la saison correspondant au pas de
temps courant (t - delta).

La nouvelle équation a donc normalement toutes les données nécessaire pour
modifier le recrutement par défaut.

Si cela vous convient, je peux faire une version "4.4.0.0-rc1" de IsisFish pour
tester cela.

--
Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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