Hello, :-) Deja good news : ca a tourné sur caparmor j ai une bonne partie de mes simus et en tous cas de quoi bosser, merci !!! niveau performances c est pas fou: 13h30 pour 1088 simus le plus long étant le chargement et le rapatriment des simus. sur les 2176 simus seulement 2 problèmes : l'une a stoppé en février0 les fichiers de simu ont ete supprimés: rien dans le log, je l ai arretee et redemarree l autre est en attente et le log dit ce qui suit : est ce qu il vaut mieux que j arrête et je redemarre ? Merci A+ INFO [main] (IsisFish.java:314) init - Starting Isis-Fish with args : [--option , launch.ui, false, --option, perform.vcsupdate, false, --option, perform.migrat ion, false, --option, perform.cron, false, --simulateRemotelly, sim_planIIFET_10 88_2010-06-29-20-28_1053, /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simulation-sim_planII FET_1088_2010-06-29-20-28_1053-preparation.zip, /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp /simulation-sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_1053-result.zip] INFO [main] (IsisFish.java:315) init - Date: 30/06/10 02:51 INFO [main] (IsisFish.java:316) init - Java version: 1.6.0_20-b02 INFO [main] (IsisFish.java:317) init - Java VM: Java HotSpot(TM) 64-Bit Server VM INFO [main] (IsisFish.java:318) init - System arch: amd64 INFO [main] (IsisFish.java:319) init - R_HOME: null INFO [main] (IsisFish.java:320) init - PATH: /appli/intel/itac/7.2.0.011/bin:/a ppli/intel/impi/3.2.1.009/bin64:/appli/intel/Compiler/11.1/038/bin/intel64:/bin: /usr/bin:/usr/games:/opt/gnome/bin:/opt/kde3/bin:/usr/bin/X11:/opt/c3/bin:/usr/l ib/mit/bin:/usr/lib/mit/sbin:.:/opt/sgi/sbin:/opt/sgi/bin:/usr/diags/bin:/usr/di ags/NPB/SER/bin:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin-:/usr/ucb:/usr/local/bin:/usr/bin/X 11:/export/home/services/bin:.:/home1/caparmor/slehuta:/usr/pbs/bin:/usr/pbs/sbi n:/sbin:/bin:/usr/sbin:/usr/bin:/usr/ucb:/usr/local/bin:/usr/bin/X11:/export/hom e/services/bin:.:/home1/caparmor/slehuta:/usr/pbs/bin:/usr/pbs/sbin INFO [main] (URLConverter.java:68) <init> - org.nuiton.util.URLConverter@432a0f 6c INFO [main] (ConverterUtil.java:163) initConverters - register converter org.nu iton.util.URLConverter@432a0f6c INFO [main] (ConverterUtil.java:163) initConverters - register converter org.nu iton.util.URIConverter@7bc9a690 INFO [main] (ConverterUtil.java:163) initConverters - register converter org.nu iton.util.VersionConverter@584fce71 INFO [main] (ConverterUtil.java:163) initConverters - register converter org.nu iton.util.LocaleConverter@2fdb7df8 INFO [main] (ApplicationConfig.java:1028) parse - Chargement du fichier de conf ig: /home1/caparmor/slehuta/.isis-config-3 INFO [main] (IsisConfig.java:907) parse - Check configuration change INFO [main] (IsisConfig.java:932) parse - Config file migration done INFO [main] (Resource.java:361) getURLs - search URLs pattern: .*i18n/.+\.prope rties in 9 urls in 225,085ms INFO [main] (I18nLoader.java:162) init - 9 bundle(s) found, [18 file(s)] in 7,2 39ms INFO [main] (I18nLoader.java:233) addLanguage - Language <locale: fr_FR,nbStenc es:1325>, nbEntries: 9, nbSentences: 1325 in 27,986ms INFO [main] (IsisFish.java:142) main - after init done in 1.910. INFO [main] (SimulationAction.java:204) simulateRemotellyWithPreScript - Comman d line action : simulateRemotelly INFO [main] (SimulationAction.java:205) simulateRemotellyWithPreScript - simul ation id : sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_1053 INFO [main] (SimulationAction.java:206) simulateRemotellyWithPreScript - simul ation zip : /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simulation-sim_planIIFET_1088_2010- 06-29-20-28_1053-preparation.zip INFO [main] (SimulationAction.java:207) simulateRemotellyWithPreScript - resul t archive : /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simulation-sim_planIIFET_1088_2010- 06-29-20-28_1053-result.zip INFO [main] (SimulationAction.java:208) simulateRemotellyWithPreScript - presc ript file : null INFO [main] (SimulationExecutor.java:72) <init> - SimulationExecutor started wi th 8 thread for dans un sous processus INFO [main] (SimulationExecutor.java:72) <init> - SimulationExecutor started wi th 1 thread for sur le serveur Caparmor INFO [main] (SimulationExecutor.java:72) <init> - SimulationExecutor started wi th 1 thread for dans le même processus INFO [main] (InProcessSimulatorLauncher.java:95) simulate - simulate sim_planII FET_1088_2010-06-29-20-28_1053 with file /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simula tion-sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_1053-preparation.zip INFO [main] (SimulationStorage.java:668) importAndRenameZip - Import simulation file /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simulation-sim_planIIFET_1088_2010-06-29- 20-28_1053-preparation.zip in directory /home1/caparmor/slehuta/isis-database-3/ simulations and rename from ^.*?/(.*)$ to sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_10 53/$1 ERROR [main] (InProcessSimulatorLauncher.java:142) simulate - Can't do simulatio n sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_1053 java.io.IOException: Interrupted system call at java.io.FileOutputStream.close0(Native Method) at java.io.FileOutputStream.close(FileOutputStream.java:279) at java.io.FilterOutputStream.close(FilterOutputStream.java:143) at org.nuiton.util.ZipUtil.uncompressAndRename(ZipUtil.java:130) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.importAndRenameZip(Si mulationStorage.java:671) at fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage.importAndRenameZip(Si mulationStorage.java:634) at fr.ifremer.isisfish.simulator.launcher.InProcessSimulatorLauncher.sim ulate(InProcessSimulatorLauncher.java:116) at fr.ifremer.isisfish.actions.SimulationAction.simulateRemotellyWithPre Script(SimulationAction.java:233) at fr.ifremer.isisfish.actions.SimulationAction.simulateRemotelly(Simula tionAction.java:179) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl. java:39) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAcces sorImpl.java:25) at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:597) at org.nuiton.util.ObjectUtil.call(ObjectUtil.java:171) at org.nuiton.util.ApplicationConfig$Action.doAction(ApplicationConfig.j ava:365) at org.nuiton.util.ApplicationConfig.doAction(ApplicationConfig.java:522 ) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.main(IsisFish.java:146) INFO [main] (SimulationAction.java:238) simulateRemotellyWithPreScript - Compre ssing simulation as zip : /home1/caparmor/slehuta/isis-tmp/simulation-sim_planII FET_1088_2010-06-29-20-28_1053-result.zip ERROR [main] (IsisFish.java:158) main - Global IsisFish exception java.lang.reflect.InvocationTargetException at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke0(Native Method) at sun.reflect.NativeMethodAccessorImpl.invoke(NativeMethodAccessorImpl. java:39) at sun.reflect.DelegatingMethodAccessorImpl.invoke(DelegatingMethodAcces sorImpl.java:25) at java.lang.reflect.Method.invoke(Method.java:597) at org.nuiton.util.ObjectUtil.call(ObjectUtil.java:171) at org.nuiton.util.ApplicationConfig$Action.doAction(ApplicationConfig.j ava:365) at org.nuiton.util.ApplicationConfig.doAction(ApplicationConfig.java:522 ) at fr.ifremer.isisfish.IsisFish.main(IsisFish.java:146) Caused by: java.lang.NullPointerException at fr.ifremer.isisfish.actions.SimulationAction.simulateRemotellyWithPre Script(SimulationAction.java:244) at fr.ifremer.isisfish.actions.SimulationAction.simulateRemotelly(Simula tionAction.java:179) ... 8 more service4>60% -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)
Hello, :-) Deja good news : ca a tourné sur caparmor j ai une bonne partie de mes simus et en tous cas de quoi bosser, merci !!!
niveau performances c est pas fou: 13h30 pour 1088 simus le plus long étant le chargement et le rapatriment des simus.
sur les 2176 simus seulement 2 problèmes : l'une a stoppé en février0 les fichiers de simu ont ete supprimés: rien dans le log, je l ai arretee et redemarree l autre est en attente et le log dit ce qui suit : est ce qu il vaut mieux que j arrête et je redemarre ?
ERROR [main] (InProcessSimulatorLauncher.java:142) simulate - Can't do simulatio n sim_planIIFET_1088_2010-06-29-20-28_1053 java.io.IOException: Interrupted system call at java.io.FileOutputStream.close0(Native Method) at java.io.FileOutputStream.close(FileOutputStream.java:279)
Vu l'erreur, oui, il vaut mieux la relancer. Il y a eu une erreur au lancement due à caparmor. -- Éric Chatellier
participants (2)
-
Eric Chatellier -
Sigrid LEHUTA