Re: [Isis-fish-users] plan D-opt
J'aurais besoin de savoir comment tu crées le data.frame matcompl pour pouvoir créer le script de sensibilité. Je pensais mettre en paramètres de l'analyse : criterion et approximate, les autres paramètres étants dépendants de ce dernier, je pensais les laisser par défaut et laisser l'utilisateur modifier à la main l'instruction R générée. J'ai peu qu'autrement les utilisateurs ne connaissant pas la méthode ne s'amusent à jouer avec les paramètres, ce qui ferait planter R à chaque fois. L'utilisateur chevronné sachant ce qu'il fait pourrait alors modifier le code R. Est-ce que ça serait bon comme ça ? Sigrid LEHUTA wrote:
Voici celui que j ai utilisé : library(AlgDesign) optD=optFederov(~(fec+effEsp+effPel1+effPel2+effBol1+effBol2+Mc+spat+migD+migC+tac+mpa)^2
,data=matcompl, approximate =FALSE, center=F, criterion = "D",nRepeats=10)
A++
Comment ca c'est pas limpide ?! matcompl (comme son nom l indique ;-) ) c est le plan complet (expand.grid) qui correspond a mes param et leurs modalités (discrètes). J avoue que je ne me rappelle plus a quoi correspondent les options. Si tu veux je peux regarder mais de ce que tu dis ca parait bien comme ca. Jean Couteau a écrit :
J'aurais besoin de savoir comment tu crées le data.frame matcompl pour pouvoir créer le script de sensibilité.
Je pensais mettre en paramètres de l'analyse : criterion et approximate, les autres paramètres étants dépendants de ce dernier, je pensais les laisser par défaut et laisser l'utilisateur modifier à la main l'instruction R générée. J'ai peu qu'autrement les utilisateurs ne connaissant pas la méthode ne s'amusent à jouer avec les paramètres, ce qui ferait planter R à chaque fois. L'utilisateur chevronné sachant ce qu'il fait pourrait alors modifier le code R.
Est-ce que ça serait bon comme ça ?
Sigrid LEHUTA wrote:
Voici celui que j ai utilisé : library(AlgDesign) optD=optFederov(~(fec+effEsp+effPel1+effPel2+effBol1+effBol2+Mc+spat+migD+migC+tac+mpa)^2
,data=matcompl, approximate =FALSE, center=F, criterion = "D",nRepeats=10)
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_______________________________________________ Isis-fish-users mailing list Isis-fish-users@list.isis-fish.org http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-users
-- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 41 23 (interne : 8123)
Sigrid LEHUTA wrote:
Comment ca c'est pas limpide ?! matcompl (comme son nom l indique ;-) ) c est le plan complet (expand.grid) qui correspond a mes param et leurs modalités (discrètes). J avoue que je ne me rappelle plus a quoi correspondent les options. Si tu veux je peux regarder mais de ce que tu dis ca parait bien comme ca.
Ok, merci, comme ça je vais pouvoir regarder.
Jean Couteau a écrit :
J'aurais besoin de savoir comment tu crées le data.frame matcompl pour pouvoir créer le script de sensibilité.
Je pensais mettre en paramètres de l'analyse : criterion et approximate, les autres paramètres étants dépendants de ce dernier, je pensais les laisser par défaut et laisser l'utilisateur modifier à la main l'instruction R générée. J'ai peu qu'autrement les utilisateurs ne connaissant pas la méthode ne s'amusent à jouer avec les paramètres, ce qui ferait planter R à chaque fois. L'utilisateur chevronné sachant ce qu'il fait pourrait alors modifier le code R.
Est-ce que ça serait bon comme ça ?
Sigrid LEHUTA wrote:
Voici celui que j ai utilisé : library(AlgDesign) optD=optFederov(~(fec+effEsp+effPel1+effPel2+effBol1+effBol2+Mc+spat+migD+migC+tac+mpa)^2
,data=matcompl, approximate =FALSE, center=F, criterion = "D",nRepeats=10)
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