Gestion de la saisie d'un m��lange d'esp��ces

Dans le cas d'une capture abondante de plusieurs esp��ces dont les individus sont morphologiquement proches (exemple : m��lange de Scomber scombrus et de Scomber colias), le responsable du tri peut prendre la d��cision de ne pas trier ces esp��ces. Le m��lange d'esp��ces et mis en caisses qui sont pes��es. Le tri en esp��ces scientifique se fait dans un second temps �� partir d'un ��chantillon repr��sentatif tir�� de plusieurs caisses r��parties sur toute la dur��e du tri. Si les sous lots ainsi obtenus sont encore trop importants, un nouvel ��chantillonnage peut ��tre r��alis�� avant de mesurer les individus.

Comment saisir cet observation dans le logiciel ?
Exemple :
500 kg de MELAG, on trie 40kg en 15kg Scomber scombrus et 25kg Scomber colias. Ensuite seuls 3.5kg de Scomber scombrus et 2.3kg de Scomber colias sont mesur��s.
La saisie sera :
  1. cr��er les deux lot VRAC Scomber scombrus et Scomber colias sans poids.
  2. saisir dans la colonne "poids sous-��chantillonn��s (kg)" les valeurs 15kg et 25kg.
  3. s��lectionner les deux lignes + clic droit et saisir la valeur du MELAG de 500kg.
  4. modifier les valeurs de la colonne "poids sous-��chantillonn��s (kg)" �� 3.5kg et 2.3kg.
  5. finir en saisissant les valeurs des mensurations.

Sur Thalassa, la gestion du m��lange peut se faire automatiquement via l'import Pupitri. Voir le chapitre sp��cifique sur l'import Pupitri

Gestion du protocole

Associer un protocole de saisie �� une campagne est une ��tape indispensable avant toute saisie. Le protocole permet de configurer les ��crans de saisie, ce qui permet de limiter les risques d'erreurs et de faciliter la saisie (ce qui se traduit par un gain de temps). Cette ��tape doit ��tre r��alis��e id��alement en mode connect�� car cela permet de configurer le protocole avec des r��f��rences �� jour. Le protocole pourra cependant ��tre ajust�� �� tout moment en mer, en cours de saisie.

Il y a trois mani��res de pr��parer un protocole :

Information importante

le logiciel permet une saisie s��par��e des fractions  Esp��ces  et  Benthos . Cette s��paration permet l'enregistrement de taux d'��chantillonnages diff��rents entre ces deux fractions.

Dans le cas o�� le protocole de la campagne entra��ne une observation commune des deux fractions, la saisie des esp��ces et du benthos pourra ��tre r��alis��e sur le m��me tableau. Dans ce dernier cas, ne pas utiliser la notion de benthos dans le logiciel. M��me chose pour les m��duses qui appartiennent normalement au groupe Plancton.

Format des fichiers d'imports dans le logiciel

Afin de conna��tre le format des diff��rents fichier qu'il est possible d'importer dans le logiciel, l'utilisateur est invit�� �� ajouter une ou plusieurs valeurs �� partir des ��crans puis �� exporter le r��sultat. Le fichier ainsi cr���� sera ouvert dans un ��diteur de texte (Libre Office id��alement) pour prendre connaissance du format du fichier. L'utilisateur peut alors modifier le fichier selon son besoin avant de l'importer dans le logiciel.

Manipulation des fichiers d'import/export

Le logiciel g��n��re et importe deux formats de fichiers.

  1. des format propres au logiciel (exemple : export du protocole �� partir du menu ��diter/Exporter en face du champ Protocole de saisie).
    Ces fichiers peuvent ��tre ouverts et modifi��s �� partir d'un ��diteur de type Notepad++).
    La syntaxe est cependant difficilement compr��hensible pour un utilisateur normal du logiciel. Ces fichiers serviront donc le plus souvent d'export/import sans modification du contenu.
  2. des formats .csv. Ces fichiers sont �� ouvrir sous Libre Office et �� sauvegarder en respectant le formatage suivant : Encodage de caract��re UTF8 et s��parateur de champ  ; . Ces fichiers sont facilement compr��hensibles par les utilisateurs et peuvent donc ��tre modifi��s avant import dans le logiciel.

Sauvegarde du protocole dans Harmonie

Avant synchronisation vers Harmonie, exporter le protocole de la campagne et l'importer comme pi��ce jointe associ�� au premier trait de la campagne afin de le sauvegarder.
Cela vous permettra de le r��cup��rer l'ann��e suivante pour initialiser la nouvelle campagne et/ou corriger les donn��es.

Vrac / Hors Vrac : d��finitions

HORS VRAC
cat��gorie associ��e �� un lot ou un individu qui a ��t�� pr��lev�� directement sur la capture sans passer par le pesage automatique ni le tri.
Cas 1
Cette notion est utile dans les cas de capture abondante o�� seule une fraction de la capture va ��tre observ��e. Dans cette configuration, les lots (cat��goris��s �� VRAC) observ��s dans l'��chantillon seront ��lev��s (facteur d'��l��vation) pour obtenir les poids et nombre totaux dans la capture.
Cas 2
Les individus rares ou atypiques qui auront ��t�� extraits de la capture avant ��chantillonnage ne devront pas ��tre ��lev��s car leur facteur d'��l��vation = 1.
Cas 3
par convention, lorsque la totalit�� de la capture est observ��e (pes��e et tri��e), on cat��gorise tous les lots �� VRAC.

Saisie multi-ordinateurs

L'applicatif permet d'envisager la saisie des informations sur plusieurs ordinateurs en parall��le. Par exemple, pour acc��l��rer le temps de saisie, il est possible de saisir la composition du benthos sur un ordinateur et toutes les autres informations (les esp��ces, les macro-d��chets etc.) sur un autre ordinateur. Il faut cependant d��cider �� l'avance quel sera l'ordinateur dit  ma��tre  et le(s) ordinateur(s)  satellites . L'ordinateur  ma��tre  centralisera toutes les donn��es alors que les ordinateurs  satellites  ne seront utilis��s que pour saisir une parties des fractions de la capture.

Pour cela il faut initialiser la saisie sur le poste  ma��tre  (d��finir la s��rie, la campagne et le protocole). Exporter la base dans le menu Fichier/Gestionnaire de base...Exporter. Sur les postes  satellites , lancer l'installation de l'applicatif en pointant sur la base ainsi export��e.

Pour la saisie sur les postes  satellites , cr��er les traits en ne compl��tant que les trois champs  Code station ,  Num��ro de trait  et  date de d��but de tra��ne . Compl��ter les donn��es sur l'onglet appropri�� (exemple Benthos).

En haut �� gauche de l'��cran utiliser l'option  exporter les ... .

Enregistrer le fichier sur le r��seau ou sur une clef usb.

Sur le poste  ma��tre , se positionner sur le bon trait et l'onglet que vous souhaitez importer.

En haut �� droite de l'��cran cliquer sur  Importer des ... , pointer sur le fichier pr��c��demment g��n��r��.

Toutes les donn��es saisie sur le poste satellite sont rapatri��es sur le poste  ma��tre .

Fonctionnement de l'import de donn��es : seuls les champs non renseign��s dans l'��cran d'import peuvent ��tre compl��t��s par les donn��es du fichier import��.

Les poids saisis dans l'��cran d'import et les esp��ces saisies dans l'��cran ne pourront pas ��tre ��cras��s par le fichier import��.

Les donn��es non import��es seront list��es. Ainsi, les donn��es saisies sur le poste  ma��tre  sont prioritaires sur les importations des postes  satellites  et ne seront donc pas ��cras��es.

Sauvegarde r��guli��re de la base

L'application utilise une base de donn��es qui peut ��tre sensible �� des erreurs machine. Il est donc n��cessaire de r��aliser des sauvegardes r��guli��res (tous les soirs) de la base afin de se pr��munir de toutes pertes de donn��es. Pour cela utiliser l'option "Exorter" du menu "Fichier/Gestionnaire de base". Le r��pertoire de sauvegarde de la base est d��fini dansle menu "Fichier/Configuration/Technique/R��pertoire de sauvegarde de base".