June 2005 - Isis-fish-bugreport - mailman.cloud.codelutin.com

[ isis-fish-Bugs-474 ] Abondances de préscipt non spécifiées
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 15, 2005

June 15, 2005

Bugs item #474, was opened at 15/06/2005 08:43 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=474&grou… Category: simulation engine Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: preuss (bpreuss) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: Abondances de préscipt non spécifiées Initial Comment: Dans la fenêtre de résultat, on peut visualiser les abondances initiales (dans le préscipt), mais lorsqu'il y a plusieurs populations, il n'est pas spécifié quelle abondance correspond à quelle espèce. ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=474&grou…

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[ isis-fish-Bugs-473 ] Ogive de maturite
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 14, 2005

June 14, 2005

Bugs item #473, was opened at 14/06/2005 09:55 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=473&grou… Category: Interface Saisie/Modification Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: Ogive de maturite Initial Comment: je voudrais mettre une ogive de maturite dans l'equation de repro. Cela suppose de construire un vecteur de dimension le nombre de classe et de pouvoir acceder a ce vecteur dans la boucle sur les clases. comment dois-je le definir? l'initialiser? acceder aux elements? merci ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=473&grou…

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[ isis-fish-Bugs-472 ] Pas de bouton sauver sur interface capturabilite
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 14, 2005

June 14, 2005

Bugs item #472, was opened at 14/06/2005 09:43 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=472&grou… Category: Interface Saisie/Modification Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: Pas de bouton sauver sur interface capturabilite Initial Comment: V2.0.7 ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=472&grou…

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[ isis-fish-Bugs-471 ] echec de la simulation
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 13, 2005

June 13, 2005

Bugs item #471, was opened at 13/06/2005 15:58 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=471&grou… >Category: simulation engine Group: ver-2-0 >Status: Closed >Resolution: Fixed Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) >Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: echec de la simulation Initial Comment: simu avec ISIS 2.0.7 pop = Nephrops Str = NephropsLargeGuilvinec 1 an BD jointe (cree avec ISIS 2.0.6) J'ai integre la nouvelle equation de repro et resauver le mapping repro-recru echec en fin de simu, je ne comprends pas le message d'erreur ---------------------------------------------------------------------- >Comment By: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Date: 13/06/2005 16:55 Message: connecté user_id=102 Re-telecharge la version 2.0.7 ou bien essai de creer un repertoire \tmp a la racine du disque. Les deux solutions devrait solutionner le probleme. ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=471&grou…

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[ isis-fish-Bugs-471 ] echec de la simulation
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 13, 2005

June 13, 2005

Bugs item #471, was opened at 13/06/2005 15:58 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=471&grou… Category: None Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Assigned to: Nobody (None) Summary: echec de la simulation Initial Comment: simu avec ISIS 2.0.7 pop = Nephrops Str = NephropsLargeGuilvinec 1 an BD jointe (cree avec ISIS 2.0.6) J'ai integre la nouvelle equation de repro et resauver le mapping repro-recru echec en fin de simu, je ne comprends pas le message d'erreur ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=471&grou…

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[ isis-fish-Bugs-465 ] affichage du premier mois de simulation
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 13, 2005

June 13, 2005

Bugs item #465, was opened at 08/06/2005 14:29 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=465&grou… Category: simulation engine Group: None >Status: Closed >Resolution: Invalid Priority: 8 Submitted By: preuss (bpreuss) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: affichage du premier mois de simulation Initial Comment: Dans le tableau de résultat le mois de janvier de la première année correspond à l'effectif initial rentré, et l'itération de simulation commence le mois suivant donc en février. Cela créé un décalage d'un mois. Par exemple avec une repro en janvier et un recrutement un mois plus tard, l'apparition du recrutement ne se fait qu'en mars. Ps: dans le graph l'afficahge des mois est toujours en numéro en non en nom de mois. ---------------------------------------------------------------------- Comment By: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Date: 08/06/2005 15:42 Message: connecté user_id=102 Ceci n'est pas vraiment un bug, il faudrait plutot voir avec Dominique et Stephanie, au niveau du modele, le meilleurs moment pour sauver les effectifs ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=465&grou…

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[ isis-fish-Bugs-466 ] probleme calcul des effectifs, ordre des process pour chaque pas de temps
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 13, 2005

June 13, 2005

Bugs item #466, was opened at 09/06/2005 14:19 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=466&grou… Category: simulation engine Group: ver-2-0 >Status: Closed >Resolution: Fixed Priority: 5 Submitted By: youen vermard (yvermard) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: probleme calcul des effectifs, ordre des process pour chaque pas de temps Initial Comment: En essayant de recalculer les effectifs de chaque mois, on ne retrouve pas les mêmes en utilisant la chronologie décrite dans l'article. Par exemple: POPULATION EN LONGUEUR Essai avec une pop définie par: Repro en janvier, repro constante=10000 Recrutement décalé d'un mois. Croissance: P(1/0)=1, P(2/1)=1 ? dans le premier exemple P(1/0)=.1 P(0/0)=.9 dans le deuxième exemple MortalitéNaurelleClasseNaissance=10 MortalitéClasse0=3 MortalitéClasse1=0.6 le premier recrutement qui arrive dans la classe 0 n'est pas compté (l'effectif reste nul), puis l'effectif qui arrive dans la classe 1 le mois suivant est égale à: EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse1 La mortalité de la classe 0 ne semble jamais être appliquée. Ce que l on devrait avoir en mars pour la classe 1 si le comptage se fait au début de la période : EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse0 ce que l on devrait avoir en mars pour la classe 1 si le comptage se fait a la fin de la période: EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse0*MortalitéClasse1 Peux tu redefinir les ordres de ces évènements ainsi que le moment auquel est réalisé le comptage et voir pourquoi la mortalité de la classe zéro ne s'applique pas? En piece jointe les sorties des résultats pour les deux exemples. ---------------------------------------------------------------------- >Comment By: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Date: 13/06/2005 15:25 Message: connecté user_id=102 corriger, le recrutement des pops en longueur ne fait plus de changement de classe ---------------------------------------------------------------------- Comment By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Date: 10/06/2005 14:51 Message: connecté user_id=254 Chronologie actuelle des evenements pour les naissances (dixit echanges avec Youen + communication telephonique ce matin avec stephanie): le vecteur des naissances (de taille le nombre de zones repro) subit a chaque pas de temps des le debut de la reproduction la mortalite naturelle naissance: ok a chaque pas de temps des le debut du recrutement un changement de classe : ok pour le modele en age (si le changement de classe a bien lieu uniquement au mois de janvier), pas ok pour le modele en longueur, dans ce cas il ne doit pas y avoir de croissance les individus nés commencent toujours le recrutement dans la premiere classe (classe 0) une migration des zones de repro vers les zones de recrutement : ok ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=466&grou…

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[ isis-fish-Bugs-468 ] simulation echouee
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 13, 2005

June 13, 2005

Bugs item #468, was opened at 09/06/2005 16:15 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=468&grou… Category: Interface Simulation Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: simulation echouee Initial Comment: V2.0.6 Base : golfe de gascogne simu : 1 an, pop=Nephrops, str= NephropsLargeGuilvinec ---------------------------------------------------------------------- >Comment By: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Date: 13/06/2005 15:09 Message: connecté user_id=102 L'equation de reproduction n'est pas bonne. L'equation suivante n'est pas correcte // il n'est plus necessaire d'encapsuler les classes depuis // la version 2.0.6 var goodClasses = new Packages.java.util.ArrayList(classes); var compt=0; // les indices de collection commence à 0 et non pas à 1 for(var z=1; z<=zoneRepro.size();z++){ compt=0; for(var c=1;c<=goodClasses.size();c++){ var cf=goodClasses.get(c).getCoefficientFecondite(); compt+=N.getValue(c,z)*cf; } result.setValue(z,compt*prepro); } 0; Il faut plutot l'ecrire: var compt=0; for(var zi=zoneRepro.iterator(); zi.hasNext();){ var zone = zi.next(); compt=0; for(var ci=classes.iterator();ci.hasNext();){ var classe = ci.next(); var cf=classe.getCoefficientFecondite(); compt+=N.getValue(classe, zone)*cf; } result.setValue(zone, compt*prepro); } 0; Dans cette equation, j'utilise plutot les iterators car l'evaluateur ecmascript se perd entre les entier et les objets et appelle la mauvaise methode. Le remplacement de l'ECMAScript par BSH, supprimera cette erreur. Dans la base, il y a aussi un probleme dans le mapping, zone repro/zone recru, il suffit de resauver la page de mapping pour corriger le probleme. En fichier attacher la base corrigée. ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=468&grou…

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[ isis-fish-Bugs-470 ] changement de classe
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 10, 2005

June 10, 2005

Bugs item #470, was opened at 10/06/2005 14:53 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=470&grou… Category: Interface Saisie/Modification Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: changement de classe Initial Comment: Pour le modele en age, il faut desactiver la coche changement de classe dans l'onglet saison. ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=470&grou…

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[ isis-fish-Bugs-466 ] probleme calcul des effectifs, ordre des process pour chaque pas de temps
by noreply＠labs.libre-entreprise.org June 10, 2005

June 10, 2005

Bugs item #466, was opened at 09/06/2005 14:19 You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=466&grou… Category: simulation engine Group: ver-2-0 Status: Open Resolution: None Priority: 5 Submitted By: youen vermard (yvermard) Assigned to: Benjamin POUSSIN (bpoussin) Summary: probleme calcul des effectifs, ordre des process pour chaque pas de temps Initial Comment: En essayant de recalculer les effectifs de chaque mois, on ne retrouve pas les mêmes en utilisant la chronologie décrite dans l'article. Par exemple: POPULATION EN LONGUEUR Essai avec une pop définie par: Repro en janvier, repro constante=10000 Recrutement décalé d'un mois. Croissance: P(1/0)=1, P(2/1)=1 ? dans le premier exemple P(1/0)=.1 P(0/0)=.9 dans le deuxième exemple MortalitéNaurelleClasseNaissance=10 MortalitéClasse0=3 MortalitéClasse1=0.6 le premier recrutement qui arrive dans la classe 0 n'est pas compté (l'effectif reste nul), puis l'effectif qui arrive dans la classe 1 le mois suivant est égale à: EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse1 La mortalité de la classe 0 ne semble jamais être appliquée. Ce que l on devrait avoir en mars pour la classe 1 si le comptage se fait au début de la période : EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse0 ce que l on devrait avoir en mars pour la classe 1 si le comptage se fait a la fin de la période: EffectifRecrutement*MortalitéNaurelleClasseNaissance*CoeffChangement declasse*MortalitéClasse0*MortalitéClasse1 Peux tu redefinir les ordres de ces évènements ainsi que le moment auquel est réalisé le comptage et voir pourquoi la mortalité de la classe zéro ne s'applique pas? En piece jointe les sorties des résultats pour les deux exemples. ---------------------------------------------------------------------- Comment By: Stéphanie Mahévas (smahevas) Date: 10/06/2005 14:51 Message: connecté user_id=254 Chronologie actuelle des evenements pour les naissances (dixit echanges avec Youen + communication telephonique ce matin avec stephanie): le vecteur des naissances (de taille le nombre de zones repro) subit a chaque pas de temps des le debut de la reproduction la mortalite naturelle naissance: ok a chaque pas de temps des le debut du recrutement un changement de classe : ok pour le modele en age (si le changement de classe a bien lieu uniquement au mois de janvier), pas ok pour le modele en longueur, dans ce cas il ne doit pas y avoir de croissance les individus nés commencent toujours le recrutement dans la premiere classe (classe 0) une migration des zones de repro vers les zones de recrutement : ok ---------------------------------------------------------------------- You can respond by visiting: http://labs.libre-entreprise.org/tracker/?func=detail&atid=113&aid=466&grou…

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