Isis-fish-docs-commits
Threads by month
- ----- 2026 -----
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2025 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2024 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2023 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2022 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2021 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2020 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2019 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2018 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2017 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2016 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2015 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2014 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2013 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2012 -----
- December
- November
- October
- September
- August
- July
- June
- May
- April
- March
- February
- January
- ----- 2011 -----
- December
December 2011
- 3 participants
- 20 discussions
Dec. 23, 2011
Author: jruchaud
Date: 2011-12-23 17:34:38 +0100 (Fri, 23 Dec 2011)
New Revision: 67
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/67
Log:
Improve style
Modified:
trunk/src/site/resources/css/site.css
trunk/src/site/resources/images/ifremer.png
Modified: trunk/src/site/resources/css/site.css
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-23 15:03:12 UTC (rev 66)
+++ trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-23 16:34:38 UTC (rev 67)
@@ -73,12 +73,16 @@
#banner {
border: none;
- margin-bottom: 10px;
- margin-top: 5px;
+ background: url(http://wwz.ifremer.fr/var/storage/images/medias-ifremer/medias-institut/illustrations/bandeau/199216-2-fre-FR/bandeau_banner_1024.png) no-repeat 0% 0%;
+ height: 150px;
}
+#bannerLeft {
+ margin-top: 24px;
+}
+
#bannerRight {
- padding-top: 50px;
+ margin-top: 37px;
}
#navcolumn {
Modified: trunk/src/site/resources/images/ifremer.png
===================================================================
(Binary files differ)
1
0
Author: jruchaud
Date: 2011-12-23 16:03:12 +0100 (Fri, 23 Dec 2011)
New Revision: 66
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/66
Log:
Add Ifremer in organization
Modified:
trunk/pom.xml
Modified: trunk/pom.xml
===================================================================
--- trunk/pom.xml 2011-12-23 14:55:37 UTC (rev 65)
+++ trunk/pom.xml 2011-12-23 15:03:12 UTC (rev 66)
@@ -23,10 +23,10 @@
<url>http://maven-site.forge.codelutin.com/isis-fish</url>
<organization>
- <name>CodeLutin</name>
+ <name>CodeLutin, Ifremer</name>
<url>http://www.codelutin.com/</url>
</organization>
-
+
<licenses>
<license>
<name>GPL</name>
1
0
Dec. 23, 2011
Author: jruchaud
Date: 2011-12-23 15:55:37 +0100 (Fri, 23 Dec 2011)
New Revision: 65
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/65
Log:
Fix size for image
Modified:
trunk/src/site/resources/css/site.css
Modified: trunk/src/site/resources/css/site.css
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-16 17:36:08 UTC (rev 64)
+++ trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-23 14:55:37 UTC (rev 65)
@@ -146,6 +146,10 @@
color:#044F90;
}
+#footer {
+ color: white;
+}
+
.section {
padding: 0px;
}
@@ -214,6 +218,6 @@
font-size: 11px;
}
-#footer {
- color: white;
+img {
+ max-width: 699px;
}
1
0
r64 - in trunk: . src/site src/site/resources src/site/resources/css src/site/resources/images
by jruchaud＠users.forge.codelutin.com Dec. 16, 2011
by jruchaud＠users.forge.codelutin.com Dec. 16, 2011
Dec. 16, 2011
Author: jruchaud
Date: 2011-12-16 18:36:08 +0100 (Fri, 16 Dec 2011)
New Revision: 64
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/64
Log:
Improve style
Added:
trunk/src/site/resources/favicon.ico
trunk/src/site/resources/images/ifremer.png
Modified:
trunk/
trunk/src/site/resources/css/site.css
trunk/src/site/resources/images/isislogo.png
trunk/src/site/site_en.xml
trunk/src/site/site_fr.xml
Property changes on: trunk
___________________________________________________________________
Modified: svn:ignore
- .settings
.classpath
.project
*.iml
*.ipr
+ .settings
.classpath
.project
*.iml
*.ipr
target
Modified: trunk/src/site/resources/css/site.css
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-14 10:13:33 UTC (rev 63)
+++ trunk/src/site/resources/css/site.css 2011-12-16 17:36:08 UTC (rev 64)
@@ -26,6 +26,194 @@
display: none;
}
-#Google-AdSense {
+#Google-AdSense, #Google-search, #googleAnalytics {
display: none;
}
+
+body {
+ background: url(http://flotte.ifremer.fr/extension/ifremer-v4/design/skin-ifremer-v4/images/theme_blue/decor/page-background.gif) repeat 0% 0%;
+ width: 960px;
+ font-family: Verdana, 'Lucida Grande', Lucida, Arial, Helvetica, sans-serif;
+ font-size: 0.75em;
+ margin: 0px auto;
+}
+
+#bodyColumn {
+ padding-top: 25px;
+}
+
+#contentBox {
+ background: white;
+ color: dimGray;
+ padding: 1px 1.95em 1.5em;
+ border-radius: 5px;
+}
+
+#breadcrumbs {
+ background: url(http://flotte.ifremer.fr/extension/ifremer-v4/design/skin-ifremer-v4/images/theme_blue/decor/bg-menu.png) repeat 0% 0%;
+ border: none;
+ border-radius: 5px;
+ height: 20px;
+ line-height: 20px;
+ color: white;
+}
+
+#breadcrumbs a:link, #breadcrumbs a:visited, #breadcrumbs a:active {
+ padding-top: 7px;
+ padding-bottom: 8px;
+ color: white;
+ text-shadow: #202020 -1px -1px 1px;
+}
+
+#breadcrumbs a:hover {
+ text-shadow: none;
+ color: #044F90;
+ background: url(http://flotte.ifremer.fr/extension/ifremer-v4/design/skin-ifremer-v4/images/theme_blue/decor/bg-menu-sel.png) repeat-x 0% 0%;
+}
+
+#banner {
+ border: none;
+ margin-bottom: 10px;
+ margin-top: 5px;
+}
+
+#bannerRight {
+ padding-top: 50px;
+}
+
+#navcolumn {
+ border-radius: 10px;
+ background: #00386B;
+ border: none;
+ color: #BCE8FE;
+ margin-bottom: 0px;
+ margin-left: 3px;
+ margin-right: 19px;
+ margin-top: 0px;
+ width: 153px;
+ padding: 0;
+}
+
+#navcolumn h5 {
+ text-align: left;
+ border: none;
+ color: #FFDE01;
+ font-weight: normal;
+ font-size: 12px;
+ padding: 11px 7px 12px;
+ background: url(http://flotte.ifremer.fr/extension/ifremer-v4/design/skin-ifremer-v4/images/theme_blue/decor/bg-menul-top.png) no-repeat 0% 0%;
+}
+
+strong {
+ font-weight: normal;
+ color:#FFE600;
+}
+
+#navcolumn {
+ text-align: right;
+}
+
+#navcolumn > a {
+ margin-right: 5px;
+ font-size: x-small;
+}
+
+#navcolumn ul {
+ text-align: left;
+ padding: 5px 7px;
+}
+
+#navcolumn li {
+ background: url(http://flotte.ifremer.fr/extension/ifremer-v4/design/skin-ifremer-v4/images/theme_blue/decor/bullet-menu-on.png) no-repeat 0% 5px;
+ list-style-type: none;
+ padding: 0px;
+ padding-left: 10px;
+}
+
+#navcolumn a:link, #navcolumn a:visited, #navcolumn a:active {
+ color: #BCE8FE;
+}
+
+#navcolumn a:hover {
+ color:#FFE600;
+}
+
+#contentBox a:link, #contentBox a:visited, #contentBox a:active {
+ color: #044F90;
+}
+
+#contentBox a:hover {
+ color:#044F90;
+}
+
+.section {
+ padding: 0px;
+}
+
+h2, h3, h4 {
+ border: none;
+ background-color: white;
+ color: #044F90;
+ padding: 0px;
+ border-bottom-style: solid;
+ border-bottom-width: 1px;
+ font-weight: normal;
+ line-height: 1.2em;
+ margin: 1.4em 0px 1.4em;
+ text-align: left;
+}
+
+h5 {
+ border: none;
+ background-color: white;
+ color: #044F90;
+ padding: 0px;
+ font-weight: normal;
+ line-height: 1.2em;
+ margin: 1.4em 0px 1.4em;
+ text-align: left;
+}
+
+p {
+ font-size: inherit;
+}
+
+table.bodyTable th, table.bodyTable td {
+ font-size: 12px;
+}
+
+table.option_list, table.bodyTable {
+ background-color: white;
+ border-collapse: collapse;
+}
+
+table.bodyTable tr.b ,table.bodyTable tr.a {
+ background-color: white;
+}
+
+table.bodyTable th {
+ background-color: #E8E8E8;
+ color: #0080CB;
+}
+
+table.bodyTable tr {
+ color: #044F90;
+}
+
+a.externalLink, a.externalLink:link, a.externalLink:visited, a.externalLink:active, a.externalLink:hover {
+ background: none;
+ padding-right: 0;
+}
+
+pre, xmp, plaintext, listing {
+ background-color: #E8E8E8;
+ color: #0080CB;
+ margin :0px;
+ padding: 5px;
+ border-radius : 5px;
+ font-size: 11px;
+}
+
+#footer {
+ color: white;
+}
Added: trunk/src/site/resources/favicon.ico
===================================================================
(Binary files differ)
Property changes on: trunk/src/site/resources/favicon.ico
___________________________________________________________________
Added: svn:mime-type
+ application/octet-stream
Added: trunk/src/site/resources/images/ifremer.png
===================================================================
(Binary files differ)
Property changes on: trunk/src/site/resources/images/ifremer.png
___________________________________________________________________
Added: svn:mime-type
+ application/octet-stream
Modified: trunk/src/site/resources/images/isislogo.png
===================================================================
(Binary files differ)
Modified: trunk/src/site/site_en.xml
===================================================================
--- trunk/src/site/site_en.xml 2011-12-14 10:13:33 UTC (rev 63)
+++ trunk/src/site/site_en.xml 2011-12-16 17:36:08 UTC (rev 64)
@@ -30,10 +30,9 @@
<src>images/isislogo.png</src>
<href>http://www.isis-fish.org</href>
</bannerLeft>
-
+
<bannerRight>
- <src>http://www.codelutin.com/images/lutinorange-codelutin.png</src>
- <href>http://www.codelutin.com</href>
+ <src>images/ifremer.png</src>
</bannerRight>
<body>
Modified: trunk/src/site/site_fr.xml
===================================================================
--- trunk/src/site/site_fr.xml 2011-12-14 10:13:33 UTC (rev 63)
+++ trunk/src/site/site_fr.xml 2011-12-16 17:36:08 UTC (rev 64)
@@ -26,7 +26,9 @@
<project name="Isis-fish">
- <publishDate format="dd/MM/yyyy"/>
+<!-- <publishDate format="dd/MM/yyyy"/>-->
+ <publishDate position="none"/>
+ <version position="none"/>
<bannerLeft>
<src>images/isislogo.png</src>
@@ -34,15 +36,14 @@
</bannerLeft>
<bannerRight>
- <src>http://www.codelutin.com/images/lutinorange-codelutin.png</src>
- <href>http://www.codelutin.com</href>
+ <src>images/ifremer.png</src>
</bannerRight>
<poweredBy>
<logo href="http://argouml.tigris.org/" img="/images/argouml-logo.png" name="ArgoUML"/>
<logo href="http://docutils.sourceforge.net/rst.html" img="/images/restructuredtext-logo.png" name="reStructuredText"/>
<logo href="http://topia.labs.libre-entreprise.org/" img="/images/topia-logo.png" name="ToPIA"/>
- </poweredBy>
+ </poweredBy>
<body>
<links>
1
0
Author: jcouteau
Date: 2011-12-14 11:13:33 +0100 (Wed, 14 Dec 2011)
New Revision: 63
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/63
Log:
Fix broken link
Modified:
trunk/src/site/site_fr.xml
Modified: trunk/src/site/site_fr.xml
===================================================================
--- trunk/src/site/site_fr.xml 2011-12-09 16:39:09 UTC (rev 62)
+++ trunk/src/site/site_fr.xml 2011-12-14 10:13:33 UTC (rev 63)
@@ -72,7 +72,7 @@
<item name="Queue de simulation" href="v4/user/usermanual/queue.html"/>
</item>
<item name="Plan d'analyse - plan d'expérience" href="v4/user/usermanual/analysisPlan.html"/>
- <item name="Analyse de sensibilite" href="download/manuel_sensitivity.pdf"/>
+ <item name="Analyse de sensibilite" href="v4/downloads/manuel_sensitivity.pdf"/>
</item>
<item name="Tutoriaux" href="v4/user/tutorials.html">
<item name="Première utilisation" href="v4/user/tutorials/firstLaunch.html"/>
1
0
Author: jcouteau
Date: 2011-12-09 17:39:09 +0100 (Fri, 09 Dec 2011)
New Revision: 62
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/62
Log:
#405 : Page pr?\195?\169sentation du fonctionnement communaut?\195?\169 isis
Modified:
trunk/src/site/rst/contact.rst
Modified: trunk/src/site/rst/contact.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/contact.rst 2011-12-09 16:32:47 UTC (rev 61)
+++ trunk/src/site/rst/contact.rst 2011-12-09 16:39:09 UTC (rev 62)
@@ -46,6 +46,9 @@
Même si la langue la plus parlée sur ces listes est le français, **vous pouvez
bien-sûr envoyer vos e-mails en anglais**.
+Vous pouvez également effectuer des recherches sur les anciens messages des
+différentes listes à partir de la page d'archive de la liste en question.
+
`Statistiques d utilisation des listes`_
.. _Statistiques d utilisation des listes:: listStats.html
@@ -80,6 +83,10 @@
Pour éviter le spam dans ces outils, vous devrez vous `créer un compte`_ avant
de soumettre quelque chose. Cette inscription ne vous engage absolument à rien.
+N'hésitez pas à nous remonter tous les problèmes que vous rencontrez dans
+l'outils de report de bugs ainsi que vos demandes d'améliorations. Cela nous
+permettra de faire évoluer ISIS-Fish.
+
* `Report de bugs`_ : Il sert à la notification d'un problème lors de
l'utilisation d'ISIS-Fish.
* `Demande d'amélioration`_ : Il sert à ajouter des idées d'amélioration
1
0
Author: jcouteau
Date: 2011-12-09 17:32:47 +0100 (Fri, 09 Dec 2011)
New Revision: 61
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/61
Log:
Page contact
Modified:
trunk/src/site/rst/contact.rst
Modified: trunk/src/site/rst/contact.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/contact.rst 2011-12-09 16:31:09 UTC (rev 60)
+++ trunk/src/site/rst/contact.rst 2011-12-09 16:32:47 UTC (rev 61)
@@ -84,13 +84,13 @@
l'utilisation d'ISIS-Fish.
* `Demande d'amélioration`_ : Il sert à ajouter des idées d'amélioration
ISIS-Fish.
- * `Roadmap` : Sert à voir les évolutions plannifiées pour les versions à venir
+ * `Roadmap`_ : Sert à voir les évolutions plannifiées pour les versions à venir
et leur évolution
-.. _créer un compte:http://forge.codelutin.com/account/register
-.. _Report de bugs:http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues?set_filter=1&trac…
-.. _Demande d'amélioration:http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues?set_filte…
-.. _Roadmap:http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap
-.. _isis-fish-devel@list.isis-fish.org:http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel
-.. _isis-fish-bugreport@list.isis-fish.org:http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-bugreport
-.. _isis-fish-commits@list.isis-fish.org:http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-commits
\ No newline at end of file
+.. _créer un compte: http://forge.codelutin.com/account/register
+.. _Report de bugs: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues?set_filter=1&tracker_i…
+.. _Demande d'amélioration :http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues?set_filter=1&tracker_id=2
+.. _Roadmap: http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap
+.. _isis-fish-devel(a)list.isis-fish.org: http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-devel
+.. _isis-fish-bugreport(a)list.isis-fish.org: http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-bugreport
+.. _isis-fish-commits(a)list.isis-fish.org: http://list.isis-fish.org/cgi-bin/mailman/listinfo/isis-fish-commits
\ No newline at end of file
1
0
Dec. 9, 2011
Author: jcouteau
Date: 2011-12-09 17:31:09 +0100 (Fri, 09 Dec 2011)
New Revision: 60
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/60
Log:
Various fixes
Modified:
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst
Modified: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst 2011-12-09 10:33:38 UTC (rev 59)
+++ trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst 2011-12-09 16:31:09 UTC (rev 60)
@@ -85,10 +85,9 @@
Ensuite l'application vous demande le nom du nouveau script à créer.
-.. important:: Le nom du script doit toujours commencer par une majuscule, et ne
- doit contenir que des caractères alphanumérique (ou le caractère
- '_').
+.. important:: Le nom du script doit toujours commencer par une majuscule, et ne doit contenir que des caractères alphanumérique (ou le caractère '\_').
+
Pour l'instant, il n'est pas possible de définir des sous-types de scripts (sauf
pour les formules).
@@ -106,7 +105,7 @@
2. **Sauver** un script
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-sauvegarder localement les modification apportées sur un script.
+Sauvegarder localement les modification apportées sur un script.
Cette action n'est disponible que lorsqu'un script est sélectionné dans
l'éditeur. On la retrouve aussi dans la barre d'action.
@@ -115,30 +114,30 @@
3. **Importer** des scripts
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-permet d'importer des scripts à partir d'une archive de scripts préalablement
+Permet d'importer des scripts à partir d'une archive de scripts préalablement
exportée par IsisFish.
L'application demande un fichier d'import de scripts.
Ensuite un dialogue de confirmation apparaît
+.. image:: script_05_importConfirm.png
+
#. On retrouve ici la liste des scripts trouvés dans le fichier qui sont déjà
présents localement.
#. Vous pouvez sélectionner ou deselectionner les scripts que vous voulez
écraser localement.
#. En bas à droite, on peut effectuer cette opération sur l'ensemble des scripts
de la liste.
-#. indique le chemin du fichier d'import.
-#. pour lancer l'import (seront importer tous les fichiers non présents
+#. Indique le chemin du fichier d'import.
+#. Pour lancer l'import (seront importer tous les fichiers non présents
localement, plus ceux dont vous avez confirmé l'écrasement).
-#. pour ne pas effectuer l'import.
+#. Pour ne pas effectuer l'import.
-.. image:: script_05_importConfirm.png
-
4. **Exporter** des scripts
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-exporter des scripts qui pourront ensuite être importer dans une autre instance
+Exporter des scripts qui pourront ensuite être importer dans une autre instance
d'IsisFish. Cette action n'est disponible que lorsqu'au moins un script est
sélectionné. Pour exporter tous les scripts d'un type, il suffit de
sélectionner le noeud du type de script dans l'arborescence des script.
@@ -172,7 +171,7 @@
6. **Fermer** le gestionnaire
~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-fermer le gestionnaire de scripts.
+Fermer le gestionnaire de scripts.
menu **Edit**
=============
1
0
Author: jcouteau
Date: 2011-12-09 11:33:38 +0100 (Fri, 09 Dec 2011)
New Revision: 59
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/59
Log:
>From scmwebeditor -- test
Modified:
trunk/src/site/rst/index.rst
Modified: trunk/src/site/rst/index.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/index.rst 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
+++ trunk/src/site/rst/index.rst 2011-12-09 10:33:38 UTC (rev 59)
@@ -48,7 +48,6 @@
serveur
- Possibilité de publier une région sur un serveur
-
Ce projet est un projet initié à la demande de l'Ifremer et financé par
celui-ci. L'analyse et la réalisation technique ont été confiées à différents
partenaires:
1
0
r58 - in trunk: . src/site src/site/en/rst src/site/resources/css src/site/resources/images/devel src/site/resources/v4/downloads src/site/rst src/site/rst/history src/site/rst/tools src/site/rst/v1 src/site/rst/v2 src/site/rst/v2/devel src/site/rst/v2/user src/site/rst/v3 src/site/rst/v3/devel src/site/rst/v3/user src/site/rst/v4 src/site/rst/v4/devel src/site/rst/v4/user src/site/rst/v4/user/tutorials src/site/rst/v4/user/usermanual
by jcouteau＠users.forge.codelutin.com Dec. 9, 2011
by jcouteau＠users.forge.codelutin.com Dec. 9, 2011
Dec. 9, 2011
Author: jcouteau
Date: 2011-12-09 11:32:24 +0100 (Fri, 09 Dec 2011)
New Revision: 58
Url: http://forge.codelutin.com/repositories/revision/isis-fish-docs/58
Log:
EOL
Modified:
trunk/LICENSE.txt
trunk/README.txt
trunk/changelog.txt
trunk/pom.xml
trunk/src/site/en/rst/index.rst
trunk/src/site/resources/css/site.css
trunk/src/site/resources/images/devel/AnalysePlanMexico.svg
trunk/src/site/resources/v4/downloads/EffortReduction.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/Exemple_PlanSimulation.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAout.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/Repro_recru0-2_StockOeufs_Spatialisee061107.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/TACfix_Es_Anchois.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/VBGFAnchois.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/Weight_month.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/prixAnchois.java
trunk/src/site/resources/v4/downloads/traitementSorties.R
trunk/src/site/rst/contact.rst
trunk/src/site/rst/download.rst
trunk/src/site/rst/history.rst
trunk/src/site/rst/history/changelog.rst
trunk/src/site/rst/history/history.rst
trunk/src/site/rst/index.rst
trunk/src/site/rst/license.rst
trunk/src/site/rst/listStats.rst
trunk/src/site/rst/news.rst
trunk/src/site/rst/othertools.rst
trunk/src/site/rst/presentation.rst
trunk/src/site/rst/publications.rst
trunk/src/site/rst/research.rst
trunk/src/site/rst/tools/eclipse.rst
trunk/src/site/rst/tools/netbeans.rst
trunk/src/site/rst/v1/changelog.rst
trunk/src/site/rst/v2/changelog.rst
trunk/src/site/rst/v2/devel/index.rst
trunk/src/site/rst/v2/index.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/ECMAScript.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/ECMAScriptEdit.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/FAQ.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/Rules.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/ScriptHilaire.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/SimulationLauncher.rst
trunk/src/site/rst/v2/user/index.rst
trunk/src/site/rst/v3/changeVersion.rst
trunk/src/site/rst/v3/changelog.rst
trunk/src/site/rst/v3/devel/SyntaxeOption.rst
trunk/src/site/rst/v3/devel/index.rst
trunk/src/site/rst/v3/devel/isis-architecture.rst
trunk/src/site/rst/v3/devel/usbkey.rst
trunk/src/site/rst/v3/index.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/AnalysePlan.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/ExternalScriptEditor.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/FAQ.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/Historique.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/Installation.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/Introduction.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/LaunchOption.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/UserInterface.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/addSshKey.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/index.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/inputs.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/isisFishData.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/result.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/scripts.rst
trunk/src/site/rst/v3/user/simulations.rst
trunk/src/site/rst/v4/devel/architecture.rst
trunk/src/site/rst/v4/devel/architectureMexico.rst
trunk/src/site/rst/v4/devel/index.rst
trunk/src/site/rst/v4/index.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/API.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/FAQ.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/caparmor.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/changements40.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/installation.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/installationr.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/isisFishModel.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/migrationv3v4.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/scripts.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/scriptsR.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/firstLaunch.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/parameterising.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/simulationPlan.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/useAPI.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/utilCaparmor.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/GUI.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/analysisPlan.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/inputs.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/introduction.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/launcher.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/queue.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/results.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/sensitivity.rst
trunk/src/site/rst/v4/user/warning.rst
trunk/src/site/site_en.xml
trunk/src/site/site_fr.xml
Property changes on: trunk/LICENSE.txt
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/README.txt
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/changelog.txt
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/pom.xml
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/en/rst/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/resources/css/site.css
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/resources/images/devel/AnalysePlanMexico.svg
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/EffortReduction.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/EffortReduction.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/EffortReduction.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,133 +1,133 @@
-package rules;
-
-import static org.nuiton.i18n.I18n._;
-
-import java.util.List;
-
-import org.apache.commons.logging.Log;
-import org.apache.commons.logging.LogFactory;
-
-import scripts.SiMatrix;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
-import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
-import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
-
-/**
- * EffortReduction.java
- *
- * Created: 3 septembre 2008
- *
- * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
- * @version $Revision: 204 $
- */
-public class EffortReduction extends AbstractRule {
-
- /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
- static private Log log = LogFactory.getLog(EffortReduction.class);
-
- @Doc("Begin date")
- public Date param_beginDate = new Date(0);
- @Doc("End date")
- public Date param_endDate = new Date(59);
-
- @Doc("Pourcentage de reduction d effort applique.")
- public double param_PercentReduction = 0.5;
-
- boolean first = true;
-
- protected String[] necessaryResult = {};
-
- /**
- * @return the necessaryResult
- */
- @Override
- public String[] getNecessaryResult() {
- return this.necessaryResult;
- }
-
- /**
- * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
- * @return L'aide ou la description de la regle
- */
- @Override
- public String getDescription() {
- return _("Reduce monthly effort of each strategy of the percent indicated");
- }
-
- /**
- * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
- * des valeurs.
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- @Override
- public void init(SimulationContext context) throws Exception {
- }
-
- /**
- * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
- */
- @Override
- public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
- throws Exception {
-
- boolean result = true;
- if (date.before(param_beginDate)) {
- result = false;
- } else if (date.after(param_endDate)) {
- result = false;
- }
- if (result)
- System.out.println("condition vraie");
- return result;
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- @Override
- public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
- throws Exception {
- // shinte la boucle metier
- if (first) {
- first = false;
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
- List<Strategy> strs = siMatrix.getStrategies(date);
- for (Strategy str : strs) {
- System.out.println("strategy evaluee : " + str.getName());
-
- /* Dans un premiere temps tant que l inactivit� est un entier on utilise
- * la proportion du nombre de bateaux de la strategie pour reduire l effort
- * ce qu on ferait aussi pour une mesure de reduction du nombre de bateaux mais
- * comme actuellement on ne tient pas compte de l economie... ca revient au meme
- * En fait passer par l inactivit� n est pas la meilleure facon de modifier
- * l effort le mieux serait d agir sur un autre coeff qui est multipli� a
- * l effort (Fstd ou ciblage) car comme ca le code serait generique mais on
- * ne verrait pas que l effort nominal est modifi�...
- */
-
- double propOld = str.getProportionSetOfVessels();
- double newProp = propOld * (1 - param_PercentReduction);
- str.setProportionSetOfVessels(newProp);
- }
- }
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executee apres le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- @Override
- public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
- throws Exception {
- first = true;
- }
-
-}
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import java.util.List;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+
+import scripts.SiMatrix;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Metier;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.Strategy;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
+import fr.ifremer.isisfish.util.Doc;
+
+/**
+ * EffortReduction.java
+ *
+ * Created: 3 septembre 2008
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 204 $
+ */
+public class EffortReduction extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(EffortReduction.class);
+
+ @Doc("Begin date")
+ public Date param_beginDate = new Date(0);
+ @Doc("End date")
+ public Date param_endDate = new Date(59);
+
+ @Doc("Pourcentage de reduction d effort applique.")
+ public double param_PercentReduction = 0.5;
+
+ boolean first = true;
+
+ protected String[] necessaryResult = {};
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ @Override
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ @Override
+ public String getDescription() {
+ return _("Reduce monthly effort of each strategy of the percent indicated");
+ }
+
+ /**
+ * Appele au demarrage de la simulation, cette methode permet d'initialiser
+ * des valeurs.
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ @Override
+ public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
+ throws Exception {
+
+ boolean result = true;
+ if (date.before(param_beginDate)) {
+ result = false;
+ } else if (date.after(param_endDate)) {
+ result = false;
+ }
+ if (result)
+ System.out.println("condition vraie");
+ return result;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
+ throws Exception {
+ // shinte la boucle metier
+ if (first) {
+ first = false;
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ List<Strategy> strs = siMatrix.getStrategies(date);
+ for (Strategy str : strs) {
+ System.out.println("strategy evaluee : " + str.getName());
+
+ /* Dans un premiere temps tant que l inactivit� est un entier on utilise
+ * la proportion du nombre de bateaux de la strategie pour reduire l effort
+ * ce qu on ferait aussi pour une mesure de reduction du nombre de bateaux mais
+ * comme actuellement on ne tient pas compte de l economie... ca revient au meme
+ * En fait passer par l inactivit� n est pas la meilleure facon de modifier
+ * l effort le mieux serait d agir sur un autre coeff qui est multipli� a
+ * l effort (Fstd ou ciblage) car comme ca le code serait generique mais on
+ * ne verrait pas que l effort nominal est modifi�...
+ */
+
+ double propOld = str.getProportionSetOfVessels();
+ double newProp = propOld * (1 - param_PercentReduction);
+ str.setProportionSetOfVessels(newProp);
+ }
+ }
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executee apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param context La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ @Override
+ public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier)
+ throws Exception {
+ first = true;
+ }
+
+}
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/EffortReduction.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,304 +1,304 @@
-package rules;
-
-import static org.nuiton.i18n.I18n._;
-
-import org.apache.commons.logging.Log;
-import org.apache.commons.logging.LogFactory;
-
-import scripts.GravityModel;
-import scripts.ResultName;
-import scripts.SiMatrix;
-
-import java.util.Arrays;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.List;
-import java.util.Collection;
-import java.util.Collections;
-import java.util.HashSet;
-import java.util.HashMap;
-import java.util.Map;
-import java.util.Set;
-import java.io.File;
-import java.io.Writer;
-import java.io.FileWriter;
-import java.io.BufferedWriter;
-import java.io.FileReader;
-
-import org.nuiton.math.matrix.*;
-
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
-import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
-import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
-
-import org.nuiton.util.FileUtil;
-
-/**
- * effortObs_MultiSp
- *
- * Created: 26 aout 2008
- *
- * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
- * @version $Revision: 1.2 $
- *
- * Last update: $Date: 2007-07-18 08:59:38 $
- * by : $Author: 2SY- Sigrid+Youen+Stephanie $
- */
-public class Effort_2000_2004_MultiSp extends AbstractRule {
- /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
- static private Log log = LogFactory.getLog(Effort_2000_2004_MultiSp.class);
-
- // fichiers rangpertoire de lancement d'ISIS (la ou se trouve le go) dans rep EffortObs/
- // fichiers mtiers x date
- /*protected String param_nomfichier_EffortBolBretons = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortBolBretons.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortBolBasques = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortBolBasques.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortPelProfil1 = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortPelProf1.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortPelProfil2 = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortPelProf2.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortSpanish = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortSpanish.csv";
- protected String param_nomfichier_Inactivity = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/Inactivity.csv";
- */
-
- protected String param_nomfichier_EffortBolBretons = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortBolProf2.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortBolBasques = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortBolProf1.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortPelProfil1 = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortPelProf1.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortPelProfil2 = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortPelProf2.csv";//yv
- protected String param_nomfichier_EffortSpanish = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortSpanish.csv";
- protected String param_nomfichier_Inactivity = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/Inactivity.csv";
-
- public int param_dateDebut = 0;
-
- protected File EffortBolBasques;
- protected File EffortBolBretons;
- protected File EffortPelProfil1;
- protected File EffortPelProfil2;
- protected File EffortSpanish;
- protected File Inactivity;
-
- protected List<Metier> metiers;
- protected List<Strategy> allStrategies ;
- // interdit de faire des set sur les strategies de la map, il faut recuperer les strategies de la date courante
- //protected Map<String , Strategy> mesStrategies;
-
- protected MatrixND matEffortBolBretons;
- protected MatrixND matEffortBolBasques;
- protected MatrixND matEffortPelProfil1;
- protected MatrixND matEffortPelProfil2;
- protected MatrixND matEffortSpanish;
- protected MatrixND matInactivity;
-
- public String [] necessaryResult = {
- };
-
- public String[] getNecessaryResult() {
- return this.necessaryResult;
- }
-
- /**
- * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
- * @return L'aide ou la description de la regle
- */
- public String getDescription() throws Exception {
- return _("Chaque annee et mois les efforts % et inactivity observ");
-
- }
-
- /**
- * Appel
- * des valeurs
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- public void init(SimulationContext context) throws Exception {
-
- // reccuperation des metiers et strategies
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
-
- Date date = new Date(0);
- List<Date> dates = new ArrayList <Date>();
- for (int i=0; i < 60; i++) {
- dates.add(new Date (i));
- }
-//System.out.println("Dates : "+ dates);
- // reccuperation des metiers et strategies
-
- metiers = siMatrix.getMetiers(date);
- allStrategies = siMatrix.getStrategies(date);
- List<Month> months = Arrays.asList(Month.MONTH);
-
- String[] metiersNomsNous = new String[]{"Espagnols","Autre", "PelProfil1Gironde", "PelProfil1Landes",
- "PelProfil1Nord", "PelProfil1Rochebonne","PelProfil2Gironde", "PelProfil2Landes", "PelProfil2Nord",
- "PelProfil2Rochebonne","BolincheProfil1gir", "BolincheProfil1lan","BolincheProfil2nord",
- "GermonPel1","GermonPel2","SardinePel1","SardinePel2","SardineBol1","SardineBol2",
- "BarPel1_GdG","BarPel2_GdG","BarPel1_Manche","BarPel2_Manche"};
- List<Metier> metiersNous = new ArrayList<Metier>();
- for(String metiersNomCurrent : metiersNomsNous){
- for (Metier met : metiers){
- System.out.println("met.getname : " + met.getName() + "; metiercourant :" + metiersNomCurrent + "; liste:" + metiersNous);
- if(met.getName().equals(metiersNomCurrent)){
- metiersNous.add(met);
- }
- }
- }
-
- Map<String , Strategy> mesStrategies = new HashMap<String, Strategy>();
- for(Strategy str : allStrategies) {
- mesStrategies.put(str.getName(), str);
- }
- List <Strategy> strNous = new ArrayList<Strategy>();
- strNous.add(mesStrategies.get("PelProfil1"));
- strNous.add(mesStrategies.get("PelProfil2"));
- strNous.add(mesStrategies.get("BolBasques"));
- strNous.add(mesStrategies.get("BolBretons"));
- strNous.add(mesStrategies.get("Espagnols"));
-
-
- // load fishing efforts in a matrix for each strategy
- if (param_nomfichier_EffortBolBretons==null || "".equals(param_nomfichier_EffortBolBretons)){
- EffortBolBretons = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 0 csv sparateur ';'");
- EffortBolBasques = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 1 csv sparateur ';'");
- EffortPelProfil1 = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 2 csv sparateur ';'");
- EffortPelProfil2 = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 3 csv parateur ';'");
- EffortSpanish = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 4 csv sparateur ';'");
- Inactivity = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 5 csv sparateur ';'");
- } else {
- EffortBolBretons = new File(param_nomfichier_EffortBolBretons);
- EffortBolBasques = new File(param_nomfichier_EffortBolBasques);
- EffortPelProfil1 = new File(param_nomfichier_EffortPelProfil1);
- EffortPelProfil2 = new File(param_nomfichier_EffortPelProfil2);
- EffortSpanish = new File(param_nomfichier_EffortSpanish);
- Inactivity = new File(param_nomfichier_Inactivity);
-
- }
-
-
- matEffortBolBretons = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matEffortBolBretons",
- new List[]{metiersNous,dates},
- new String[]{"Metiers","Date"});
- matEffortBolBasques = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matEffortBolBasques",
- new List[]{metiersNous,dates},
- new String[]{"Metiers","Date"});
- matEffortPelProfil1 = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matEffortPelProfil1",
- new List[]{metiersNous,dates},
- new String[]{"Metiers","Date"});
- matEffortPelProfil2 = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matEffortPelProfil2",
- new List[]{metiersNous,dates},
- new String[]{"Metiers","Date"});
- matEffortSpanish = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matEffortSpanish",
- new List[]{metiersNous,dates},
- new String[]{"Metiers","Date"});
- matInactivity = MatrixFactory.getInstance().create(
- "matInactivity",
- new List[]{strNous,dates},
- new String[]{"Strategies","Date"});
-
- matEffortBolBretons.importCSV(new FileReader(EffortBolBretons),new int []{0,0});
- matEffortBolBasques.importCSV(new FileReader(EffortBolBasques),new int []{0,0});
- matEffortPelProfil1.importCSV(new FileReader(EffortPelProfil1),new int []{0,0});
- matEffortPelProfil2.importCSV(new FileReader(EffortPelProfil2),new int []{0,0});
- matEffortSpanish.importCSV(new FileReader(EffortSpanish),new int []{0,0});
- matInactivity.importCSV(new FileReader(Inactivity),new int []{0,0});
- /*System.out.println("Chargement de matrice matEffortBolBretons" + matEffortBolBretons);
- System.out.println("Chargement de matrice matEffortBolBasques" + matEffortBolBasques);
- System.out.println("Chargement de matrice matEffortPelProfil1" + matEffortPelProfil1);
- System.out.println("Chargement de matrice matEffortPelProfil2" + matEffortPelProfil2);
- System.out.println("Chargement de matrice matEffortSpanish" + matEffortSpanish);
- System.out.println("Chargement de matrice matInactivity" + matInactivity);
- System.out.println("dim de inactivity" + " " + Arrays.toString(matInactivity.getDim()));*/
-
- }// fin de init
- /**
- * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
- */
- public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- if (date.getYear()+param_dateDebut < 5){
- return true;
- } else return false;
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est execute avant le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- // Booleen permettant que ne boucler que sur un seul metier dans la preaction :
- boolean first = true;
- public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- if (log.isDebugEnabled()) {
- log.debug("first = "+ first + "date:"+ date);
- }
- System.out.println("first = " + first+ " ,on passe dans la preaction ?");
- if (first){ // on passe dans preaction pour la premiere fois
- //System.out.println("Oui, preaction : ");
- double newProp=0;
- int newInactivity = 0;
-
- // Boucle sur les strategies
- //System.out.println("strs dans preaction : " + strs);
- //System.out.println("mesStrategies : " + mesStrategies);
-
- //List<Strategy> mStr = new ArrayList(mesStrategies.values());
- for(Strategy strIndex : allStrategies){
- //for(Strategy strIndex : mStr){
- // interdit de faire des set sur les strategies de la semantique de la matrice, il faut recuperer les strategies de la date courante
- Strategy str = (Strategy)context.getDB().findByTopiaId(strIndex.getTopiaId());
- StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth());
-
- //System.out.println("pour str="+str.getName());
-
- newInactivity = (int) matInactivity.getValue(str,date.getDate()+param_dateDebut);
- smi.setMinInactivityDays(newInactivity);
- //System.out.println("pour la strategy=" + str.getName() +", l'ann: "+ date.getYear() + " et le mois = "+date.getMonth()+": newInactivity= "+ newInactivity);
-
- // on boucle sur les metiers de la strategie pour initialiser les efforts avec matEffort
- Collection<EffortDescription> strMet = str.getSetOfVessels().getPossibleMetiers() ;
- for (EffortDescription ed : strMet){
- Metier strMetier = ed.getPossibleMetiers();
- System.out.println("pour le metier=" + strMetier);
- if (str.getName().equals("BolBretons")){
- newProp = matEffortBolBretons.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
- } else if (str.getName().equals("BolBasques")){
- newProp = matEffortBolBasques.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
- } else if (str.getName().equals("PelProfil1")){
- newProp = matEffortPelProfil1.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
- } else if (str.getName().equals("PelProfil2")){
- newProp = matEffortPelProfil2.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
- } else if (str.getName().equals("Espagnols")){
- newProp = matEffortSpanish.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
- }
- //System.out.println("pour le metier=" + strMetier +" l'anne : "+ date.getYear() + "et le mois = "+date.getMonth()+" newProp= "+ newProp);
- smi.setProportionMetier(strMetier,newProp);
-
- }
- }//fin de boucle sur strategies
- first = false;
- }// fin de first= true
- if (log.isDebugEnabled()) {
- log.debug("fin Effort Anchois Action avant");
- }
- }// fin de pre action
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est strategy=" + str.getName() +", l'anne : "+ date.getYear() + " et le mois = "+date.getMonth()+": newInactivity= "+ newInactivity);
-
- // on boucle sur les metiers de la strategie pour initialiser les efforts avec matEffort
- Collection<EffortDescription> strMet = str.getSetOfVessels().getPossibleMetiers() ;
- for (EffortDescription ed : strMet){
- Metier strMetier = ed.getPossibleMetiers();
- System.out.println("pour le metier=" + strMetier);
-execut©e apres le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- first = true;
- }
-
-}
+package rules;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+
+import scripts.GravityModel;
+import scripts.ResultName;
+import scripts.SiMatrix;
+
+import java.util.Arrays;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.List;
+import java.util.Collection;
+import java.util.Collections;
+import java.util.HashSet;
+import java.util.HashMap;
+import java.util.Map;
+import java.util.Set;
+import java.io.File;
+import java.io.Writer;
+import java.io.FileWriter;
+import java.io.BufferedWriter;
+import java.io.FileReader;
+
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+
+import org.nuiton.util.FileUtil;
+
+/**
+ * effortObs_MultiSp
+ *
+ * Created: 26 aout 2008
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.2 $
+ *
+ * Last update: $Date: 2007-07-18 08:59:38 $
+ * by : $Author: 2SY- Sigrid+Youen+Stephanie $
+ */
+public class Effort_2000_2004_MultiSp extends AbstractRule {
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(Effort_2000_2004_MultiSp.class);
+
+ // fichiers rangpertoire de lancement d'ISIS (la ou se trouve le go) dans rep EffortObs/
+ // fichiers mtiers x date
+ /*protected String param_nomfichier_EffortBolBretons = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortBolBretons.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortBolBasques = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortBolBasques.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortPelProfil1 = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortPelProf1.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortPelProfil2 = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortPelProf2.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortSpanish = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/EffortSpanish.csv";
+ protected String param_nomfichier_Inactivity = "/home1/caparmor/slehuta/Inputs_Anchois/EffortObs_V32/Inactivity.csv";
+ */
+
+ protected String param_nomfichier_EffortBolBretons = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortBolProf2.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortBolBasques = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortBolProf1.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortPelProfil1 = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortPelProf1.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortPelProfil2 = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortPelProf2.csv";//yv
+ protected String param_nomfichier_EffortSpanish = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/EffortSpanish.csv";
+ protected String param_nomfichier_Inactivity = "Inputs_Anchois/EffortObs_MultiSp/Inactivity.csv";
+
+ public int param_dateDebut = 0;
+
+ protected File EffortBolBasques;
+ protected File EffortBolBretons;
+ protected File EffortPelProfil1;
+ protected File EffortPelProfil2;
+ protected File EffortSpanish;
+ protected File Inactivity;
+
+ protected List<Metier> metiers;
+ protected List<Strategy> allStrategies ;
+ // interdit de faire des set sur les strategies de la map, il faut recuperer les strategies de la date courante
+ //protected Map<String , Strategy> mesStrategies;
+
+ protected MatrixND matEffortBolBretons;
+ protected MatrixND matEffortBolBasques;
+ protected MatrixND matEffortPelProfil1;
+ protected MatrixND matEffortPelProfil2;
+ protected MatrixND matEffortSpanish;
+ protected MatrixND matInactivity;
+
+ public String [] necessaryResult = {
+ };
+
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ /**
+ * Permet d'afficher a l'utilisateur une aide sur la regle.
+ * @return L'aide ou la description de la regle
+ */
+ public String getDescription() throws Exception {
+ return _("Chaque annee et mois les efforts % et inactivity observ");
+
+ }
+
+ /**
+ * Appel
+ * des valeurs
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+
+ // reccuperation des metiers et strategies
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+
+ Date date = new Date(0);
+ List<Date> dates = new ArrayList <Date>();
+ for (int i=0; i < 60; i++) {
+ dates.add(new Date (i));
+ }
+//System.out.println("Dates : "+ dates);
+ // reccuperation des metiers et strategies
+
+ metiers = siMatrix.getMetiers(date);
+ allStrategies = siMatrix.getStrategies(date);
+ List<Month> months = Arrays.asList(Month.MONTH);
+
+ String[] metiersNomsNous = new String[]{"Espagnols","Autre", "PelProfil1Gironde", "PelProfil1Landes",
+ "PelProfil1Nord", "PelProfil1Rochebonne","PelProfil2Gironde", "PelProfil2Landes", "PelProfil2Nord",
+ "PelProfil2Rochebonne","BolincheProfil1gir", "BolincheProfil1lan","BolincheProfil2nord",
+ "GermonPel1","GermonPel2","SardinePel1","SardinePel2","SardineBol1","SardineBol2",
+ "BarPel1_GdG","BarPel2_GdG","BarPel1_Manche","BarPel2_Manche"};
+ List<Metier> metiersNous = new ArrayList<Metier>();
+ for(String metiersNomCurrent : metiersNomsNous){
+ for (Metier met : metiers){
+ System.out.println("met.getname : " + met.getName() + "; metiercourant :" + metiersNomCurrent + "; liste:" + metiersNous);
+ if(met.getName().equals(metiersNomCurrent)){
+ metiersNous.add(met);
+ }
+ }
+ }
+
+ Map<String , Strategy> mesStrategies = new HashMap<String, Strategy>();
+ for(Strategy str : allStrategies) {
+ mesStrategies.put(str.getName(), str);
+ }
+ List <Strategy> strNous = new ArrayList<Strategy>();
+ strNous.add(mesStrategies.get("PelProfil1"));
+ strNous.add(mesStrategies.get("PelProfil2"));
+ strNous.add(mesStrategies.get("BolBasques"));
+ strNous.add(mesStrategies.get("BolBretons"));
+ strNous.add(mesStrategies.get("Espagnols"));
+
+
+ // load fishing efforts in a matrix for each strategy
+ if (param_nomfichier_EffortBolBretons==null || "".equals(param_nomfichier_EffortBolBretons)){
+ EffortBolBretons = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 0 csv sparateur ';'");
+ EffortBolBasques = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 1 csv sparateur ';'");
+ EffortPelProfil1 = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 2 csv sparateur ';'");
+ EffortPelProfil2 = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 3 csv parateur ';'");
+ EffortSpanish = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 4 csv sparateur ';'");
+ Inactivity = FileUtil.getFile(".*.csv", "fichier 5 csv sparateur ';'");
+ } else {
+ EffortBolBretons = new File(param_nomfichier_EffortBolBretons);
+ EffortBolBasques = new File(param_nomfichier_EffortBolBasques);
+ EffortPelProfil1 = new File(param_nomfichier_EffortPelProfil1);
+ EffortPelProfil2 = new File(param_nomfichier_EffortPelProfil2);
+ EffortSpanish = new File(param_nomfichier_EffortSpanish);
+ Inactivity = new File(param_nomfichier_Inactivity);
+
+ }
+
+
+ matEffortBolBretons = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matEffortBolBretons",
+ new List[]{metiersNous,dates},
+ new String[]{"Metiers","Date"});
+ matEffortBolBasques = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matEffortBolBasques",
+ new List[]{metiersNous,dates},
+ new String[]{"Metiers","Date"});
+ matEffortPelProfil1 = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matEffortPelProfil1",
+ new List[]{metiersNous,dates},
+ new String[]{"Metiers","Date"});
+ matEffortPelProfil2 = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matEffortPelProfil2",
+ new List[]{metiersNous,dates},
+ new String[]{"Metiers","Date"});
+ matEffortSpanish = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matEffortSpanish",
+ new List[]{metiersNous,dates},
+ new String[]{"Metiers","Date"});
+ matInactivity = MatrixFactory.getInstance().create(
+ "matInactivity",
+ new List[]{strNous,dates},
+ new String[]{"Strategies","Date"});
+
+ matEffortBolBretons.importCSV(new FileReader(EffortBolBretons),new int []{0,0});
+ matEffortBolBasques.importCSV(new FileReader(EffortBolBasques),new int []{0,0});
+ matEffortPelProfil1.importCSV(new FileReader(EffortPelProfil1),new int []{0,0});
+ matEffortPelProfil2.importCSV(new FileReader(EffortPelProfil2),new int []{0,0});
+ matEffortSpanish.importCSV(new FileReader(EffortSpanish),new int []{0,0});
+ matInactivity.importCSV(new FileReader(Inactivity),new int []{0,0});
+ /*System.out.println("Chargement de matrice matEffortBolBretons" + matEffortBolBretons);
+ System.out.println("Chargement de matrice matEffortBolBasques" + matEffortBolBasques);
+ System.out.println("Chargement de matrice matEffortPelProfil1" + matEffortPelProfil1);
+ System.out.println("Chargement de matrice matEffortPelProfil2" + matEffortPelProfil2);
+ System.out.println("Chargement de matrice matEffortSpanish" + matEffortSpanish);
+ System.out.println("Chargement de matrice matInactivity" + matInactivity);
+ System.out.println("dim de inactivity" + " " + Arrays.toString(matInactivity.getDim()));*/
+
+ }// fin de init
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+ public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ if (date.getYear()+param_dateDebut < 5){
+ return true;
+ } else return false;
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est execute avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ // Booleen permettant que ne boucler que sur un seul metier dans la preaction :
+ boolean first = true;
+ public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ if (log.isDebugEnabled()) {
+ log.debug("first = "+ first + "date:"+ date);
+ }
+ System.out.println("first = " + first+ " ,on passe dans la preaction ?");
+ if (first){ // on passe dans preaction pour la premiere fois
+ //System.out.println("Oui, preaction : ");
+ double newProp=0;
+ int newInactivity = 0;
+
+ // Boucle sur les strategies
+ //System.out.println("strs dans preaction : " + strs);
+ //System.out.println("mesStrategies : " + mesStrategies);
+
+ //List<Strategy> mStr = new ArrayList(mesStrategies.values());
+ for(Strategy strIndex : allStrategies){
+ //for(Strategy strIndex : mStr){
+ // interdit de faire des set sur les strategies de la semantique de la matrice, il faut recuperer les strategies de la date courante
+ Strategy str = (Strategy)context.getDB().findByTopiaId(strIndex.getTopiaId());
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth());
+
+ //System.out.println("pour str="+str.getName());
+
+ newInactivity = (int) matInactivity.getValue(str,date.getDate()+param_dateDebut);
+ smi.setMinInactivityDays(newInactivity);
+ //System.out.println("pour la strategy=" + str.getName() +", l'ann: "+ date.getYear() + " et le mois = "+date.getMonth()+": newInactivity= "+ newInactivity);
+
+ // on boucle sur les metiers de la strategie pour initialiser les efforts avec matEffort
+ Collection<EffortDescription> strMet = str.getSetOfVessels().getPossibleMetiers() ;
+ for (EffortDescription ed : strMet){
+ Metier strMetier = ed.getPossibleMetiers();
+ System.out.println("pour le metier=" + strMetier);
+ if (str.getName().equals("BolBretons")){
+ newProp = matEffortBolBretons.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
+ } else if (str.getName().equals("BolBasques")){
+ newProp = matEffortBolBasques.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
+ } else if (str.getName().equals("PelProfil1")){
+ newProp = matEffortPelProfil1.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
+ } else if (str.getName().equals("PelProfil2")){
+ newProp = matEffortPelProfil2.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
+ } else if (str.getName().equals("Espagnols")){
+ newProp = matEffortSpanish.getValue(strMetier,date.getDate()+param_dateDebut);
+ }
+ //System.out.println("pour le metier=" + strMetier +" l'anne : "+ date.getYear() + "et le mois = "+date.getMonth()+" newProp= "+ newProp);
+ smi.setProportionMetier(strMetier,newProp);
+
+ }
+ }//fin de boucle sur strategies
+ first = false;
+ }// fin de first= true
+ if (log.isDebugEnabled()) {
+ log.debug("fin Effort Anchois Action avant");
+ }
+ }// fin de pre action
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est strategy=" + str.getName() +", l'anne : "+ date.getYear() + " et le mois = "+date.getMonth()+": newInactivity= "+ newInactivity);
+
+ // on boucle sur les metiers de la strategie pour initialiser les efforts avec matEffort
+ Collection<EffortDescription> strMet = str.getSetOfVessels().getPossibleMetiers() ;
+ for (EffortDescription ed : strMet){
+ Metier strMetier = ed.getPossibleMetiers();
+ System.out.println("pour le metier=" + strMetier);
+execut©e apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ first = true;
+ }
+
+}
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Exemple_PlanSimulation.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,16 +1,16 @@
-// Adult migration coefficients {2000,...,2008,mean}
-double [] gir = {0.2523304,0.2086467,0.5008767,0.1155539,0.1063631,0.5764831,0.2469257,0.2556178,0.3414639,0.289};
-double [] lc = {0.05400881,0.16173449,0.04129422,0.14009017,0.29670246,0.00000000,0.30205351,0.14407688,0.19059324,0.148};
-double [] ll = {0.138540813,0.184829055,0.252067222,0.108165542,0.363177244,0.299495371,0.002653738,0.112834679,0.151165424,0.179};
-double [] ro = {0.4937572,0.3623039,0.1978877,0.4360312,0.2149993,0.1233157,0.4476018,0.4413241,0.3155026,0.337};
-double [] no = { 0.0613627737,0.0824858520,0.0078741776,0.2001591791,0.0187579836,0.0007059103,0.0007652638,0.0461465156,0.0012747868,0.047};
-// hindcast model
-int y = context.getSimulationControl().getDate().getYear();
-// prediction model : mean
-//int y = 9;
-if(group.getId() > 14 && "MigHiver".equals(departureZone.getName())){
- if("gironde".equals(arrivalZone.getName()))return gir[y];
- else if("Rochebonne".equals(arrivalZone.getName())) return ro[y];
- else if("LandesCote".equals(arrivalZone.getName())) return lc[y];
- else if("LandesLarge".equals(arrivalZone.getName())) return ll[y];
+// Adult migration coefficients {2000,...,2008,mean}
+double [] gir = {0.2523304,0.2086467,0.5008767,0.1155539,0.1063631,0.5764831,0.2469257,0.2556178,0.3414639,0.289};
+double [] lc = {0.05400881,0.16173449,0.04129422,0.14009017,0.29670246,0.00000000,0.30205351,0.14407688,0.19059324,0.148};
+double [] ll = {0.138540813,0.184829055,0.252067222,0.108165542,0.363177244,0.299495371,0.002653738,0.112834679,0.151165424,0.179};
+double [] ro = {0.4937572,0.3623039,0.1978877,0.4360312,0.2149993,0.1233157,0.4476018,0.4413241,0.3155026,0.337};
+double [] no = { 0.0613627737,0.0824858520,0.0078741776,0.2001591791,0.0187579836,0.0007059103,0.0007652638,0.0461465156,0.0012747868,0.047};
+// hindcast model
+int y = context.getSimulationControl().getDate().getYear();
+// prediction model : mean
+//int y = 9;
+if(group.getId() > 14 && "MigHiver".equals(departureZone.getName())){
+ if("gironde".equals(arrivalZone.getName()))return gir[y];
+ else if("Rochebonne".equals(arrivalZone.getName())) return ro[y];
+ else if("LandesCote".equals(arrivalZone.getName())) return lc[y];
+ else if("LandesLarge".equals(arrivalZone.getName())) return ll[y];
}return 0;
\ No newline at end of file
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAout.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAout.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAout.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,17 +1,17 @@
- if (group.getId() == 1 && "SudGolfe".equals(arrivalZone.getName()) ) return 1;
- else if(group.getId() ==3 && "SudGolfe".equals(departureZone.getName()) && "Recru".equals(arrivalZone.getName()) ) return 1;
- else if((group.getId() == 16 || group.getId() == 17) && "MigHiver".equals(arrivalZone.getName()) ){
-
- if("gironde".equals(departureZone.getName()) ||
- "Rochebonne".equals(departureZone.getName()) ||
- "LandesCote".equals(departureZone.getName()) ||
- "LandesLarge".equals(departureZone.getName()) ){
- MatrixND Ngr = N.getSubMatrix(0,group,1) ;
- double tot = Ngr.sumAll() ;
- if(tot != 0){
- double coeff = (0.65*tot - N.getValue(group,arrivalZone)) / (tot-N.getValue(group,arrivalZone));
- return coeff ;
- }else {return 0;}
- }
- }
-return 0;
+ if (group.getId() == 1 && "SudGolfe".equals(arrivalZone.getName()) ) return 1;
+ else if(group.getId() ==3 && "SudGolfe".equals(departureZone.getName()) && "Recru".equals(arrivalZone.getName()) ) return 1;
+ else if((group.getId() == 16 || group.getId() == 17) && "MigHiver".equals(arrivalZone.getName()) ){
+
+ if("gironde".equals(departureZone.getName()) ||
+ "Rochebonne".equals(departureZone.getName()) ||
+ "LandesCote".equals(departureZone.getName()) ||
+ "LandesLarge".equals(departureZone.getName()) ){
+ MatrixND Ngr = N.getSubMatrix(0,group,1) ;
+ double tot = Ngr.sumAll() ;
+ if(tot != 0){
+ double coeff = (0.65*tot - N.getValue(group,arrivalZone)) / (tot-N.getValue(group,arrivalZone));
+ return coeff ;
+ }else {return 0;}
+ }
+ }
+return 0;
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MigrationAout.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,34 +1,34 @@
-//test survies martin
-Date date = context.getSimulationControl().getDate();
-
-// aov survie contrast = sum pour month et year / ref = north(5) / Megg=pert Madults = 1.49
-/*double [] Gir = { 108.157079907313,104.040441019196,114.867357631927,102.775218050167,95.5102675884572,97.4002336900792,97.6896434553373,95.698434692503 };
- double[] Lc = { 1000,160.131882990035,1000,149.685042379658,119.942294122065,125.499807305511,126.431453048777,120.459876791989 };
- double[] Ll = { 127.063329543669,118.855448855865,145.161762228118,116.576747614374,104.931458169551,107.770091172289,108.214891158855,105.209212529286 };
- double[] Ro = { 103.573871689489,100.116829822123,108.991227355935,99.0360699306787,92.6833694996939,94.3585183099993,94.6137091311044,92.8508073480452 };
- double[] No = { 110.499702421585,106.002939231345,118.004634498226,104.634276240226,96.8752699349442,98.8790216414094,99.1866992785972,97.0743501369063 };
-*/
-// aov survie contrast = sum pour month et year / ref = north(5) / Megg=gdg Madults = 2.84
-double [] Gir = { 83.2167553797197,80.0493868483888,88.3796863724735,79.0759161296458,73.4862163528401,74.9403684701997,75.1630422115824,73.630993337216 };
-double[] Lc = { 1000,123.206504342530,1000,115.168637747853,92.2843752641238,96.5603617783932,97.2771760265618,92.6826067110963 };
-double[] Ll = { 97.763345880174,91.4481495012754,111.688396803782,89.6949020582122,80.7349411949353,82.9190037491769,83.2612357297987,80.948647192079 };
-double[] Ro = { 79.6904053946439,77.0305350684429,83.8585538106882,76.1989914322092,71.3111827171539,72.6000530240379,72.7963984889233,71.4400104784017 };
-double[] No = { 85.0191842626395,81.5593456397455,90.793527442933,80.5062875003543,74.5364579686243,76.0781574647785,76.3148866247337,74.6896315609755 };
-
-
-int y = date.getYear();
-if (group == null){ return 0;
-} else if (group.getId() == 0 ){
- if(y < 8){
-
-// script effet annee * zones
- if ("gironde".equals(zone.getName())){return Gir[y];}else if ("Rochebonne".equals(zone.getName())) {return Ro[y];}else if ("LandesCote".equals(zone.getName())){return Lc[y];}else if ("LandesLarge".equals(zone.getName())){return Ll[y];}else if ("MigHiver".equals(zone.getName())){return No[y];}else return 0;
-
- }else return 102.9699;
-//return 102.9699;
-} else if (group.getId() == 1 ){ return 0 ;
-//Mpert 1.49
-//} else if (group.getId() == 2 ){ return 9.13896671274146 ; } else if (group.getId() == 3 ){ return 6.52011321674013 ; } else if (group.getId() == 4 ){ return 5.07483463318751 ; } else if (group.getId() == 5 ){ return 4.15653572014739 ; } else if (group.getId() == 6 ){ return 3.5208050737082 ; } else if (group.getId() == 7 ){ return 3.05436780362196 ; } else if (group.getId() == 8 ){ return 2.69743614913744 ; } else if (group.getId() == 9 ){ return 2.41544170418373 ; } else if (group.getId() == 10 ){ return 2.18699518587283 ; } else if (group.getId() == 11 ){ return 1.99814758538767 ; } else if (group.getId() == 12 ){ return 1.83941167360153 ; } else if (group.getId() == 13 ){ return 1.70410904289053 ; } else if (group.getId() == 14 ){ return 1.58740166718328 ; } else if (group.getId() == 15 ){ return 1.49 ; } else if (group.getId() == 16 ){ return 1.39 ; } else if (group.getId() == 17 ){ return 1.49 ; }else return 0;
-
-//Mgdg 2.84
+//test survies martin
+Date date = context.getSimulationControl().getDate();
+
+// aov survie contrast = sum pour month et year / ref = north(5) / Megg=pert Madults = 1.49
+/*double [] Gir = { 108.157079907313,104.040441019196,114.867357631927,102.775218050167,95.5102675884572,97.4002336900792,97.6896434553373,95.698434692503 };
+ double[] Lc = { 1000,160.131882990035,1000,149.685042379658,119.942294122065,125.499807305511,126.431453048777,120.459876791989 };
+ double[] Ll = { 127.063329543669,118.855448855865,145.161762228118,116.576747614374,104.931458169551,107.770091172289,108.214891158855,105.209212529286 };
+ double[] Ro = { 103.573871689489,100.116829822123,108.991227355935,99.0360699306787,92.6833694996939,94.3585183099993,94.6137091311044,92.8508073480452 };
+ double[] No = { 110.499702421585,106.002939231345,118.004634498226,104.634276240226,96.8752699349442,98.8790216414094,99.1866992785972,97.0743501369063 };
+*/
+// aov survie contrast = sum pour month et year / ref = north(5) / Megg=gdg Madults = 2.84
+double [] Gir = { 83.2167553797197,80.0493868483888,88.3796863724735,79.0759161296458,73.4862163528401,74.9403684701997,75.1630422115824,73.630993337216 };
+double[] Lc = { 1000,123.206504342530,1000,115.168637747853,92.2843752641238,96.5603617783932,97.2771760265618,92.6826067110963 };
+double[] Ll = { 97.763345880174,91.4481495012754,111.688396803782,89.6949020582122,80.7349411949353,82.9190037491769,83.2612357297987,80.948647192079 };
+double[] Ro = { 79.6904053946439,77.0305350684429,83.8585538106882,76.1989914322092,71.3111827171539,72.6000530240379,72.7963984889233,71.4400104784017 };
+double[] No = { 85.0191842626395,81.5593456397455,90.793527442933,80.5062875003543,74.5364579686243,76.0781574647785,76.3148866247337,74.6896315609755 };
+
+
+int y = date.getYear();
+if (group == null){ return 0;
+} else if (group.getId() == 0 ){
+ if(y < 8){
+
+// script effet annee * zones
+ if ("gironde".equals(zone.getName())){return Gir[y];}else if ("Rochebonne".equals(zone.getName())) {return Ro[y];}else if ("LandesCote".equals(zone.getName())){return Lc[y];}else if ("LandesLarge".equals(zone.getName())){return Ll[y];}else if ("MigHiver".equals(zone.getName())){return No[y];}else return 0;
+
+ }else return 102.9699;
+//return 102.9699;
+} else if (group.getId() == 1 ){ return 0 ;
+//Mpert 1.49
+//} else if (group.getId() == 2 ){ return 9.13896671274146 ; } else if (group.getId() == 3 ){ return 6.52011321674013 ; } else if (group.getId() == 4 ){ return 5.07483463318751 ; } else if (group.getId() == 5 ){ return 4.15653572014739 ; } else if (group.getId() == 6 ){ return 3.5208050737082 ; } else if (group.getId() == 7 ){ return 3.05436780362196 ; } else if (group.getId() == 8 ){ return 2.69743614913744 ; } else if (group.getId() == 9 ){ return 2.41544170418373 ; } else if (group.getId() == 10 ){ return 2.18699518587283 ; } else if (group.getId() == 11 ){ return 1.99814758538767 ; } else if (group.getId() == 12 ){ return 1.83941167360153 ; } else if (group.getId() == 13 ){ return 1.70410904289053 ; } else if (group.getId() == 14 ){ return 1.58740166718328 ; } else if (group.getId() == 15 ){ return 1.49 ; } else if (group.getId() == 16 ){ return 1.39 ; } else if (group.getId() == 17 ){ return 1.49 ; }else return 0;
+
+//Mgdg 2.84
} else if (group.getId() == 2 ){ return 11.6872477676121 ; } else if (group.getId() == 3 ){ return 8.99134625041905 ; } else if (group.getId() == 4 ){ return 7.39969983293818 ; } else if (group.getId() == 5 ){ return 6.33559260446452 ; } else if (group.getId() == 6 ){ return 5.56804905759846 ; } else if (group.getId() == 7 ){ return 4.98515455624756 ; } else if (group.getId() == 8 ){ return 4.52564872475113 ; } else if (group.getId() == 9 ){ return 4.15299824047493 ; } else if (group.getId() == 10 ){ return 3.84398003597826 ; } else if (group.getId() == 11 ){ return 3.5830824617687 ; } else if (group.getId() == 12 ){ return 3.35952602350689 ; } else if (group.getId() == 13 ){ return 3.16557278228505 ; } else if (group.getId() == 14 ){ return 2.99551574007537 ; } else if (group.getId() == 15 ){ return 2.84 ; } else if (group.getId() == 16 ){ return 2.74 ; } else if (group.getId() == 17 ){ return 2.84 ; }else return 0;
\ No newline at end of file
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Repro_recru0-2_StockOeufs_Spatialisee061107.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/Repro_recru0-2_StockOeufs_Spatialisee061107.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/Repro_recru0-2_StockOeufs_Spatialisee061107.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,76 +1,76 @@
-//Equation de repro du modele en longueur v3//
-//////////////////////////////////////////
-/*hypothese : il existe une taille minimum et un declencheur (temp etc)
-la dur�e de repro depend de la taille en avril
-Le declencheur a lieu en avril sauf pour rochebonne en mai*/
-
-double ind = 1;
-double tot = 0.0;
-//boucle pour implementer le recrutement observ�
-if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() < 3){
-double coeffR = 0;
-double recru = 0;
- for (Zone zr : zoneRepro) {
- double R = 0 ;
- if ("gironde".equals(zr.getName())){
- if (Month.APRIL.equals(month)) { coeffR = 0.111;
- }else if (Month.MAY.equals(month)) { coeffR = 0.272 ;
- }else if (Month.JUNE.equals(month)) { coeffR = 0.317;
- }else if (Month.JULY.equals(month)) { coeffR = 0.226 ;
- }else if (Month.AUGUST.equals(month)) { coeffR = 0.0745;
- }
- if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 0){
- recru = 2.405172e14;
- }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 1){
- recru = 2.04885e14;
- }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 2){
- recru = 3.860327e+14;
- }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 3){
- recru = 4.69e+13;
- }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 4){
- recru = 3.196e+14;
- }
- R = recru*coeffR ;
- }
-result.setValue(zr,R);
- }
-}else{
-for(Zone zr : zoneRepro){
- String nomZone = zr.getName();
- tot = 0;
- for (PopulationGroup cr : groups){
- ind = 1;
-
- if (Month.APRIL.equals(month) && "Rochebonne".equals(nomZone)) {
- ind = 0;
- }else if (Month.JUNE.equals(month)&&!"Rochebonne".equals(nomZone)&&cr.getId() < 13){ //hyp orange A
- //}else if (Month.JUNE.equals(month)&&!"Rochebonne".equals(nomZone)&&cr.getId() < 14){//hyp orange B
- ind = 0;
-
- }else if (Month.JULY.equals(month)){
- if (!"Rochebonne".equals(nomZone)){
- if (cr.getId() < 15) ind =0;
- }else {
- if (cr.getId() <13 ) ind = 0 ; //hyp orange A
- //if (cr.getId() <14 ) ind = 0 ; //hyp orange B
- }
- }else if (Month.AUGUST.equals(month)){
- if (!"Rochebonne".equals(nomZone)){
- ind =0;
- }else {
- if (cr.getId() <15 ) ind = 0 ;
- }
- }
-double fec = cr.getReproductionRate();
-//if(context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 5 || context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 6){
-//fec = fec*0.8 ;
-//}
-
-tot += fec*cr.getMeanWeight()*N.getValue(cr,zr)/2.0*ind;
- }// fin de la boucle sur les classes
-
- result.setValue(zr,tot);
-
-} // end of boucle for (areas)
-}// end of condition on year
-return 0;
+//Equation de repro du modele en longueur v3//
+//////////////////////////////////////////
+/*hypothese : il existe une taille minimum et un declencheur (temp etc)
+la dur�e de repro depend de la taille en avril
+Le declencheur a lieu en avril sauf pour rochebonne en mai*/
+
+double ind = 1;
+double tot = 0.0;
+//boucle pour implementer le recrutement observ�
+if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() < 3){
+double coeffR = 0;
+double recru = 0;
+ for (Zone zr : zoneRepro) {
+ double R = 0 ;
+ if ("gironde".equals(zr.getName())){
+ if (Month.APRIL.equals(month)) { coeffR = 0.111;
+ }else if (Month.MAY.equals(month)) { coeffR = 0.272 ;
+ }else if (Month.JUNE.equals(month)) { coeffR = 0.317;
+ }else if (Month.JULY.equals(month)) { coeffR = 0.226 ;
+ }else if (Month.AUGUST.equals(month)) { coeffR = 0.0745;
+ }
+ if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 0){
+ recru = 2.405172e14;
+ }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 1){
+ recru = 2.04885e14;
+ }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 2){
+ recru = 3.860327e+14;
+ }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 3){
+ recru = 4.69e+13;
+ }else if (context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 4){
+ recru = 3.196e+14;
+ }
+ R = recru*coeffR ;
+ }
+result.setValue(zr,R);
+ }
+}else{
+for(Zone zr : zoneRepro){
+ String nomZone = zr.getName();
+ tot = 0;
+ for (PopulationGroup cr : groups){
+ ind = 1;
+
+ if (Month.APRIL.equals(month) && "Rochebonne".equals(nomZone)) {
+ ind = 0;
+ }else if (Month.JUNE.equals(month)&&!"Rochebonne".equals(nomZone)&&cr.getId() < 13){ //hyp orange A
+ //}else if (Month.JUNE.equals(month)&&!"Rochebonne".equals(nomZone)&&cr.getId() < 14){//hyp orange B
+ ind = 0;
+
+ }else if (Month.JULY.equals(month)){
+ if (!"Rochebonne".equals(nomZone)){
+ if (cr.getId() < 15) ind =0;
+ }else {
+ if (cr.getId() <13 ) ind = 0 ; //hyp orange A
+ //if (cr.getId() <14 ) ind = 0 ; //hyp orange B
+ }
+ }else if (Month.AUGUST.equals(month)){
+ if (!"Rochebonne".equals(nomZone)){
+ ind =0;
+ }else {
+ if (cr.getId() <15 ) ind = 0 ;
+ }
+ }
+double fec = cr.getReproductionRate();
+//if(context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 5 || context.getSimulationControl().getDate().getYear() == 6){
+//fec = fec*0.8 ;
+//}
+
+tot += fec*cr.getMeanWeight()*N.getValue(cr,zr)/2.0*ind;
+ }// fin de la boucle sur les classes
+
+ result.setValue(zr,tot);
+
+} // end of boucle for (areas)
+}// end of condition on year
+return 0;
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Repro_recru0-2_StockOeufs_Spatialisee061107.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/TACfix_Es_Anchois.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/TACfix_Es_Anchois.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/TACfix_Es_Anchois.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,228 +1,228 @@
-package rules;
-
-import java.util.HashSet;
-import java.util.List;
-import java.util.Set;
-import java.util.ArrayList;
-import java.util.Collection;
-import java.util.Collections;
-import java.util.Iterator;
-
-import static org.nuiton.i18n.I18n._;
-
-import org.apache.commons.logging.Log;
-import org.apache.commons.logging.LogFactory;
-import org.nuiton.math.matrix.*;
-
-import scripts.ResultName;
-import scripts.RuleUtil;
-import scripts.SiMatrix;
-
-import fr.ifremer.isisfish.IsisFishDAOHelper;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
-import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
-import org.nuiton.topia.*;// pour pouvoir utiliser la methode StringUtil.toDouble()
-import org.nuiton.util.*;// pour pouvoir utiliser la methode StringUtil.toDouble()
-
-import scripts.ResultName;
-import java.io.*;
-import java.util.*;
-import org.nuiton.math.matrix.*;
-import fr.ifremer.isisfish.*;
-import fr.ifremer.isisfish.types.*;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
-import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
-import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
-import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationParameter;
-import fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage;
-import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
-
-/**
- * TAC.java
- *partage TQC entre frqncqis et espqgnols
- * Created: 7 septembre 2006
- *
- * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
- * @version $Revision: 1.3 $
- *
- * Last update: $Date: 2007/01/24 18:25:34 $
- * by : $Author: bpoussin $
- */
-
-/**
- *
- */
-public class TACfix_Es_Anchois extends AbstractRule {
-
- /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
- static private Log log = LogFactory.getLog(TACfix_Es_Anchois.class);
-
- public Population param_pop = null ;
- public Date param_beginDate = new Date(6);
- public Date param_endDate = new Date(119);
- public Month param_beginMonth = Month.JULY;
- public Month param_endMonth = Month.JUNE;
- /** TAC in tonne */
- public double param_allocCountries = 0.5;
- public double param_TAC = 33000000;
-
- protected double SSBmay = 0;
-
- protected String [] necessaryResult = {
- ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP,
- ResultName.MATRIX_BIOMASS,
- };
-
- /**
- * @return the necessaryResult
- */
- public String[] getNecessaryResult() {
- return this.necessaryResult;
- }
-
- public String getDescription() {
- return _("TAC fix ou nul si biomasse < 21000t et partage Fr/Es , context contient TACesp et catchEsp in kg ");
- }
-
- /**
- * AppelÃ
- * des valeurs
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- public void init(SimulationContext context) throws Exception {
- }
-
- /**
- * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
- */
-
- public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- boolean result = false;
-
- if(date.before(param_beginDate)) {
- return false;
- } else if(date.after(param_endDate)) {
- return false;
- } else {
- int ny = date.getYear() ;
- boolean firstSemester = date.getMonth().before(param_beginMonth);
- ResultStorage matResult = context.getSimulationStorage().getResultStorage();
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
-
- //year in which to consider biomass in may ?
- int year = 0;
- if(firstSemester & ny > 0) year = ny - 1;
- else year = ny ;
-
- // Biomass in may
- for (Date dat = new Date(0); dat.before(date); dat = dat.next()) {
- if (dat.getYear() == year & dat.getMonth().equals(Month.JUNE)){
- MatrixND matB = matResult.getMatrix(dat, param_pop, ResultName.MATRIX_BIOMASS);
- SSBmay = matB.sumAll();
- }
- }
-
- double TACvalue = param_TAC;
-System.out.println("SSBmay : " + SSBmay);
-System.out.println("tac avant la biom "+ TACvalue);
- /* fermeture si SSB < 21000T*/
- if(SSBmay < 21000000) {
-System.out.println("la biom est inf a 21000t");
- TACvalue = 0 ;
- }
-System.out.println("tac apres la biom "+ TACvalue);
-System.out.println("paramTacInKg_esp : "+TACvalue*param_allocCountries);
- context.setValue("TACesp",TACvalue * param_allocCountries);
-
- // Quantit pechee entre juillet et juin
- double CatchEspTot = 0;
- List<Strategy> strategies = siMatrix.getStrategies(new Date(0));
- for (Date dat = new Date(0); dat.before(date); dat = dat.next()) {
- if( (dat.getYear() == year & dat.getMonth().after(param_endMonth)) ||
- (firstSemester & dat.getYear() == ny) ){
-
- MatrixND mat = matResult.getMatrix(dat, param_pop,
- ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP);
- // pour les espagnols
- int comp = 0;
- for(Strategy str : strategies){
- if("Espagnols".equals(str.getName())){
- MatrixND Esp = mat.copy().getSubMatrix(0,comp,1);
- Esp = Esp.sumOverDim(1); // sum metiers
- Esp = Esp.sumOverDim(2); // sum groups
- Esp = Esp.sumOverDim(3); // sum zones
- Esp = Esp.reduce();
- double CatchEsp = Esp.getValue(0);
- CatchEspTot += CatchEsp;
- }// if esp
- comp += 1;
- }//for strategy
- }//if year
- }//for date
- System.out.println("capture espagnole : "+ CatchEspTot);
- context.setValue("CatchEsp",CatchEspTot);
-
- if (CatchEspTot >= TACvalue * param_allocCountries) {
- result = true ;
- System.out.println("CAPTURE ESPAGNOLE DEPASSEE");
- }
- //}//if ts
- }
- return result;
- }
-
-
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executée avant le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(date.getMonth()).getSpeciesTargetSpecies(param_pop.getSpecies());
- if(ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
- // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
-
- //récupere toutes les stratégies pratiquant le métier et pour lesquelles la proportion !=0
- SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
- Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
- for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(date)) {
- double prop = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth()).getProportionMetier(metier);
- if (str.getName().equals("Espagnols")){
- if (prop != 0) {
- strs.add(str);
- }
- }
- }
-
- for (Strategy str : strs){
- StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth());
-
- MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
- MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(date,
- ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY,
- siMatrix.getStrategies(date),
- siMatrix.getMetiers(date));
- mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
- smi.setProportionMetier(metier, 0);
- }
- }
- }
-
- /**
- * Si la condition est vrai alors cette action est executée apres le pas
- * de temps de la simulation.
- * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
- */
- public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
- }
-
-}
+package rules;
+
+import java.util.HashSet;
+import java.util.List;
+import java.util.Set;
+import java.util.ArrayList;
+import java.util.Collection;
+import java.util.Collections;
+import java.util.Iterator;
+
+import static org.nuiton.i18n.I18n._;
+
+import org.apache.commons.logging.Log;
+import org.apache.commons.logging.LogFactory;
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+
+import scripts.ResultName;
+import scripts.RuleUtil;
+import scripts.SiMatrix;
+
+import fr.ifremer.isisfish.IsisFishDAOHelper;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.rule.AbstractRule;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.MetierMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.PopulationMonitor;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Month;
+import org.nuiton.topia.*;// pour pouvoir utiliser la methode StringUtil.toDouble()
+import org.nuiton.util.*;// pour pouvoir utiliser la methode StringUtil.toDouble()
+
+import scripts.ResultName;
+import java.io.*;
+import java.util.*;
+import org.nuiton.math.matrix.*;
+import fr.ifremer.isisfish.*;
+import fr.ifremer.isisfish.types.*;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationContext;
+import fr.ifremer.isisfish.types.Date;
+import fr.ifremer.isisfish.entities.*;
+import fr.ifremer.isisfish.simulator.SimulationParameter;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.SimulationStorage;
+import fr.ifremer.isisfish.datastore.ResultStorage;
+
+/**
+ * TAC.java
+ *partage TQC entre frqncqis et espqgnols
+ * Created: 7 septembre 2006
+ *
+ * @author anonymous <anonymous(a)labs.libre-entreprise.org>
+ * @version $Revision: 1.3 $
+ *
+ * Last update: $Date: 2007/01/24 18:25:34 $
+ * by : $Author: bpoussin $
+ */
+
+/**
+ *
+ */
+public class TACfix_Es_Anchois extends AbstractRule {
+
+ /** to use log facility, just put in your code: log.info("..."); */
+ static private Log log = LogFactory.getLog(TACfix_Es_Anchois.class);
+
+ public Population param_pop = null ;
+ public Date param_beginDate = new Date(6);
+ public Date param_endDate = new Date(119);
+ public Month param_beginMonth = Month.JULY;
+ public Month param_endMonth = Month.JUNE;
+ /** TAC in tonne */
+ public double param_allocCountries = 0.5;
+ public double param_TAC = 33000000;
+
+ protected double SSBmay = 0;
+
+ protected String [] necessaryResult = {
+ ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP,
+ ResultName.MATRIX_BIOMASS,
+ };
+
+ /**
+ * @return the necessaryResult
+ */
+ public String[] getNecessaryResult() {
+ return this.necessaryResult;
+ }
+
+ public String getDescription() {
+ return _("TAC fix ou nul si biomasse < 21000t et partage Fr/Es , context contient TACesp et catchEsp in kg ");
+ }
+
+ /**
+ * AppelÃ
+ * des valeurs
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ public void init(SimulationContext context) throws Exception {
+ }
+
+ /**
+ * La condition qui doit etre vrai pour faire les actions
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ * @return vrai si on souhaite que les actions soit faites
+ */
+
+ public boolean condition(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ boolean result = false;
+
+ if(date.before(param_beginDate)) {
+ return false;
+ } else if(date.after(param_endDate)) {
+ return false;
+ } else {
+ int ny = date.getYear() ;
+ boolean firstSemester = date.getMonth().before(param_beginMonth);
+ ResultStorage matResult = context.getSimulationStorage().getResultStorage();
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+
+ //year in which to consider biomass in may ?
+ int year = 0;
+ if(firstSemester & ny > 0) year = ny - 1;
+ else year = ny ;
+
+ // Biomass in may
+ for (Date dat = new Date(0); dat.before(date); dat = dat.next()) {
+ if (dat.getYear() == year & dat.getMonth().equals(Month.JUNE)){
+ MatrixND matB = matResult.getMatrix(dat, param_pop, ResultName.MATRIX_BIOMASS);
+ SSBmay = matB.sumAll();
+ }
+ }
+
+ double TACvalue = param_TAC;
+System.out.println("SSBmay : " + SSBmay);
+System.out.println("tac avant la biom "+ TACvalue);
+ /* fermeture si SSB < 21000T*/
+ if(SSBmay < 21000000) {
+System.out.println("la biom est inf a 21000t");
+ TACvalue = 0 ;
+ }
+System.out.println("tac apres la biom "+ TACvalue);
+System.out.println("paramTacInKg_esp : "+TACvalue*param_allocCountries);
+ context.setValue("TACesp",TACvalue * param_allocCountries);
+
+ // Quantit pechee entre juillet et juin
+ double CatchEspTot = 0;
+ List<Strategy> strategies = siMatrix.getStrategies(new Date(0));
+ for (Date dat = new Date(0); dat.before(date); dat = dat.next()) {
+ if( (dat.getYear() == year & dat.getMonth().after(param_endMonth)) ||
+ (firstSemester & dat.getYear() == ny) ){
+
+ MatrixND mat = matResult.getMatrix(dat, param_pop,
+ ResultName.MATRIX_CATCH_WEIGHT_PER_STRATEGY_MET_PER_ZONE_POP);
+ // pour les espagnols
+ int comp = 0;
+ for(Strategy str : strategies){
+ if("Espagnols".equals(str.getName())){
+ MatrixND Esp = mat.copy().getSubMatrix(0,comp,1);
+ Esp = Esp.sumOverDim(1); // sum metiers
+ Esp = Esp.sumOverDim(2); // sum groups
+ Esp = Esp.sumOverDim(3); // sum zones
+ Esp = Esp.reduce();
+ double CatchEsp = Esp.getValue(0);
+ CatchEspTot += CatchEsp;
+ }// if esp
+ comp += 1;
+ }//for strategy
+ }//if year
+ }//for date
+ System.out.println("capture espagnole : "+ CatchEspTot);
+ context.setValue("CatchEsp",CatchEspTot);
+
+ if (CatchEspTot >= TACvalue * param_allocCountries) {
+ result = true ;
+ System.out.println("CAPTURE ESPAGNOLE DEPASSEE");
+ }
+ //}//if ts
+ }
+ return result;
+ }
+
+
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executée avant le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ public void preAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ TargetSpecies ts = metier.getMetierSeasonInfo(date.getMonth()).getSpeciesTargetSpecies(param_pop.getSpecies());
+ if(ts != null && ts.getPrimaryCatch()) {
+ // recupere tous les metiers qui ont l'espece en capture principale =>metiers vises
+
+ //récupere toutes les stratégies pratiquant le métier et pour lesquelles la proportion !=0
+ SiMatrix siMatrix = SiMatrix.getSiMatrix(context);
+ Set<Strategy> strs = new HashSet<Strategy>();
+ for (Strategy str : siMatrix.getStrategies(date)) {
+ double prop = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth()).getProportionMetier(metier);
+ if (str.getName().equals("Espagnols")){
+ if (prop != 0) {
+ strs.add(str);
+ }
+ }
+ }
+
+ for (Strategy str : strs){
+ StrategyMonthInfo smi = str.getStrategyMonthInfo(date.getMonth());
+
+ MetierMonitor metierMon = context.getMetierMonitor();
+ MatrixND mat = metierMon.getOrCreateNoActivity(date,
+ ResultName.MATRIX_NO_ACTIVITY,
+ siMatrix.getStrategies(date),
+ siMatrix.getMetiers(date));
+ mat.setValue(str, metier, smi.getProportionMetier(metier));
+ smi.setProportionMetier(metier, 0);
+ }
+ }
+ }
+
+ /**
+ * Si la condition est vrai alors cette action est executée apres le pas
+ * de temps de la simulation.
+ * @param simulation La simulation pour lequel on utilise cette regle
+ */
+ public void postAction(SimulationContext context, Date date, Metier metier) throws Exception {
+ }
+
+}
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/TACfix_Es_Anchois.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/VBGFAnchois.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/VBGFAnchois.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/VBGFAnchois.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,6 +1,6 @@
-// Parameters to input
-double Linf = 18.77;
-double K = 1.25;
-double t0 = -0.17;
-
-return (Linf*(1.0-Math.exp((-K*((age/12)-t0)))));
+// Parameters to input
+double Linf = 18.77;
+double K = 1.25;
+double t0 = -0.17;
+
+return (Linf*(1.0-Math.exp((-K*((age/12)-t0)))));
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/VBGFAnchois.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Weight_month.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/Weight_month.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/Weight_month.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,30 +1,30 @@
-//Weight equation
-
-/*Based on legth-weight key based on PelGas survey 2000-2005
-W = 0.004184069 * L ^ 3.200812
-for Spring and summer and juveniles (group <15)*/
-
-Date date = context.getSimulationControl().getDate();
-if(group.getId() == 0){ return 0;
-}else if (group.getId() < 15){
- double Poids = (0.004184069 * Math.pow((group.getMaxLength() + group.getMinLength())/2 , 3.200812))*0.001;
- return Poids ;
-
-}else if(Month.JULY.equals(date.getMonth()) || Month.AUGUST.equals(date.getMonth())){
- if(group.getId() == 15) return 0.02655; //(Pelgas for group 14)
- else if(group.getId() == 16) return 0.03294; // Pelgas for group 15
- else if(group.getId() == 17) return 0.04268; // Pelgas for group 16
-
-/* based on market sampling in Autumn and winter */
-}else if (date.getMonth().after(Month.AUGUST) & date.getMonth().before(Month.MARCH)){
- if(group.getId()==15){ return 0.018;
- }else if(group.getId()== 16){ return 0.031;
- }else if(group.getId()== 17){ return 0.040;
- }else return 0;
-
-} else {
-
-double Poids = (0.004184069 * Math.pow((group.getMaxLength() + group.getMinLength())/2 , 3.200812))*0.001;
- return Poids ;
-}
-return 0;
+//Weight equation
+
+/*Based on legth-weight key based on PelGas survey 2000-2005
+W = 0.004184069 * L ^ 3.200812
+for Spring and summer and juveniles (group <15)*/
+
+Date date = context.getSimulationControl().getDate();
+if(group.getId() == 0){ return 0;
+}else if (group.getId() < 15){
+ double Poids = (0.004184069 * Math.pow((group.getMaxLength() + group.getMinLength())/2 , 3.200812))*0.001;
+ return Poids ;
+
+}else if(Month.JULY.equals(date.getMonth()) || Month.AUGUST.equals(date.getMonth())){
+ if(group.getId() == 15) return 0.02655; //(Pelgas for group 14)
+ else if(group.getId() == 16) return 0.03294; // Pelgas for group 15
+ else if(group.getId() == 17) return 0.04268; // Pelgas for group 16
+
+/* based on market sampling in Autumn and winter */
+}else if (date.getMonth().after(Month.AUGUST) & date.getMonth().before(Month.MARCH)){
+ if(group.getId()==15){ return 0.018;
+ }else if(group.getId()== 16){ return 0.031;
+ }else if(group.getId()== 17){ return 0.040;
+ }else return 0;
+
+} else {
+
+double Poids = (0.004184069 * Math.pow((group.getMaxLength() + group.getMinLength())/2 , 3.200812))*0.001;
+ return Poids ;
+}
+return 0;
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/Weight_month.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/prixAnchois.java
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/prixAnchois.java 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/prixAnchois.java 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,20 +1,20 @@
-Date date = context.getSimulationControl().getDate() ;
-Population pop = group.getPopulation() ;
-String name = "matrixCatchWeightPerStrategyMetPerZonePop" ;
-MatrixND landing = context.getResultManager().getMatrix(date,pop,name).copy();
-MatrixND land = landing.getSubMatrix(0,1,4);
-Double landingSum = land.sumAll();
-
-double[] Coef10 = {0,-0.275977,-0.093828,-2.89188,-2.437983,2.528421,0.194449,1.10878,0.529903,0.527172,1.503888,1.410975};
-double[] Coef20 = {-0.268437,-0.427446,-0.482732,-1.824395,-1.41204,0.203052,-0.550787,-0.28221,-0.236633,-0.385919,-0.342456,-1.918256};
-double[] Coef30 = {-0.808865,-0.804389,-1.133971,-2.13875,-1.91298,-0.643282,-1.324481,-0.641541,-0.543603,-0.830526,-0.486578,-4.372755};
-double[] Coef40 = {-1.824897,-0.43577,-1.155683,-3.574861,-2.3858,-0.977611,-0.949024,-0.233802,-0.412412,0.392487,-0.321009,-0.413922};
-if (group.getMeanWeight() <12/1000){
-coeff= Coef40;
-}else if(group.getMeanWeight() <20/1000){
-coeff= Coef30;
-}else if(group.getMeanWeight() <33/1000){
-coeff= Coef20;
-}else { coeff= Coef40;}
- double prix = -0.356622*Math.log(landingSum)+ coeff[date.getMonth().getMonthNumber()];
+Date date = context.getSimulationControl().getDate() ;
+Population pop = group.getPopulation() ;
+String name = "matrixCatchWeightPerStrategyMetPerZonePop" ;
+MatrixND landing = context.getResultManager().getMatrix(date,pop,name).copy();
+MatrixND land = landing.getSubMatrix(0,1,4);
+Double landingSum = land.sumAll();
+
+double[] Coef10 = {0,-0.275977,-0.093828,-2.89188,-2.437983,2.528421,0.194449,1.10878,0.529903,0.527172,1.503888,1.410975};
+double[] Coef20 = {-0.268437,-0.427446,-0.482732,-1.824395,-1.41204,0.203052,-0.550787,-0.28221,-0.236633,-0.385919,-0.342456,-1.918256};
+double[] Coef30 = {-0.808865,-0.804389,-1.133971,-2.13875,-1.91298,-0.643282,-1.324481,-0.641541,-0.543603,-0.830526,-0.486578,-4.372755};
+double[] Coef40 = {-1.824897,-0.43577,-1.155683,-3.574861,-2.3858,-0.977611,-0.949024,-0.233802,-0.412412,0.392487,-0.321009,-0.413922};
+if (group.getMeanWeight() <12/1000){
+coeff= Coef40;
+}else if(group.getMeanWeight() <20/1000){
+coeff= Coef30;
+}else if(group.getMeanWeight() <33/1000){
+coeff= Coef20;
+}else { coeff= Coef40;}
+ double prix = -0.356622*Math.log(landingSum)+ coeff[date.getMonth().getMonthNumber()];
return prix;
\ No newline at end of file
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/prixAnchois.java
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/resources/v4/downloads/traitementSorties.R
===================================================================
--- trunk/src/site/resources/v4/downloads/traitementSorties.R 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/resources/v4/downloads/traitementSorties.R 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,106 +1,106 @@
-# Un script R pour le traitement des resultats de simulation.
-# Auteur : Hussein
-# objectif du programme : importations des resultats des plans d'analyse (issus
-# de 256 simulations) "l'analyse de sensibilite", avec ce programme R, on peut
-# importer les 256 resultats
-# des simulations (Biomasse Finale, Abondance finale, les captures cumulees de
-# la derniere annee, les captures cumulees au cours de 5 dernieres annees de
-# simulation, Effort de peche
-# cumule sur toute la duree de simulation) en meme temps. Et en fin renvoyer
-# tous les resultats dans une meme matrice.
-
-#-------------
-
-#----Import des fichiers de simulation ---------
-
-FILES<-list.files(path="C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations") #pour recuperer les noms des repertoires des simulations
-
-# Import du Fichier 1 : Biomasse Finale " BF" = la biomasse du mois de decembre
-# de la derniere annee de simulation (soit 10 ans de simulation)
-#-------------
-
-Biomasse<-list()
-
-for (i in 1:length(FILES))
-{
-Biomasse[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\Biomasses.csv",sep=""),sep=";")
-}
-
-BF<-matrix(nrow=256, ncol=1)
-
-for (i in 1:nrow(BF))
-{
-BF[i,]<-sum(subset(Biomasse[[i]][,-c(1,2,3,4)],Biomasse[[i]][,4]==119))
-}
-
-#-----------------------------------------------------------------------
-# Import du Fichier 2 : Abondance finale "AF" = l'abondance du mois de decembre
-de la derniere annee de simulation
-#-------------
-Abondance<-list()
-
-for (i in 1:length(FILES))
-{
-Abondance[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\Abondances.csv",sep=""),sep=";")
-}
-
-AF<-matrix(nrow=256, ncol=1)
-
-for (i in 1:nrow(AF))
-{
-AF[i,]<-sum(subset(Abondance[[i]][,-c(1,2,3,4)],Abondance[[i]][,4]==119))
-}
-
-
-#-------------
-# Import du Fichier 3 : les captures cumulees de la derniere annee "CaptCumDerAn"
-#-------------
-Captures<-list()
-
-for (i in 1:length(FILES))
-{
-Captures[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\CapturesPoids.csv",sep=""),sep=";")
-}
-
-CaptCumDerAn<-matrix(nrow=256, ncol=1)
-
-for (i in 1:nrow(CaptCumDerAn))
-{
-CaptCumDerAn[i,]<-sum(subset(Captures[[i]][,-c(1,2,3,4,5)],Captures[[i]][,5]>107))
-}
-
-
-
-#-------------
-# Calcul des captures cumulees au cours des 5 dernieres annees de simulation "CaptCum5Der"
-#-------------------------
-CaptCum5Der<-matrix(nrow=256, ncol=1)
-
-for (i in 1:nrow(CaptCum5Der))
-{
-CaptCum5Der[i,]<-sum(subset(Captures[[i]][,-c(1,2,3,4,5)],Captures[[i]][,5]>59))
-}
-
-
-
-#-------------
-# Import du Fichier 4 : Effort cummule sur toute la duree de la simulation "Effortcumule"
-#-------------
-Effort<-list()
-
-for (i in 1:length(FILES))
-{
-Effort[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\EffortsMetier.csv",sep=""),sep=";")
-}
-
-Effortcumule<-matrix(nrow=256, ncol=1)
-
-for (i in 1:nrow(Effortcumule))
-{
-Effortcumule[i,]<-sum(Effort[[i]][,4])
-}
-
-#----------------------------------------
-AS<-cbind(BF,AF,CaptCumDerAn,CaptCum5Der,Effortcumule) # pour creer une matrice des 5 indicateurs
-dimnames(AS)[[2]]<-c("BF","AF","CaptCumDerAn","CaptCum5Der","Effortcumule")# pour donner les nomes de chaque colonne
-
+# Un script R pour le traitement des resultats de simulation.
+# Auteur : Hussein
+# objectif du programme : importations des resultats des plans d'analyse (issus
+# de 256 simulations) "l'analyse de sensibilite", avec ce programme R, on peut
+# importer les 256 resultats
+# des simulations (Biomasse Finale, Abondance finale, les captures cumulees de
+# la derniere annee, les captures cumulees au cours de 5 dernieres annees de
+# simulation, Effort de peche
+# cumule sur toute la duree de simulation) en meme temps. Et en fin renvoyer
+# tous les resultats dans une meme matrice.
+
+#-------------
+
+#----Import des fichiers de simulation ---------
+
+FILES<-list.files(path="C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations") #pour recuperer les noms des repertoires des simulations
+
+# Import du Fichier 1 : Biomasse Finale " BF" = la biomasse du mois de decembre
+# de la derniere annee de simulation (soit 10 ans de simulation)
+#-------------
+
+Biomasse<-list()
+
+for (i in 1:length(FILES))
+{
+Biomasse[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\Biomasses.csv",sep=""),sep=";")
+}
+
+BF<-matrix(nrow=256, ncol=1)
+
+for (i in 1:nrow(BF))
+{
+BF[i,]<-sum(subset(Biomasse[[i]][,-c(1,2,3,4)],Biomasse[[i]][,4]==119))
+}
+
+#-----------------------------------------------------------------------
+# Import du Fichier 2 : Abondance finale "AF" = l'abondance du mois de decembre
+de la derniere annee de simulation
+#-------------
+Abondance<-list()
+
+for (i in 1:length(FILES))
+{
+Abondance[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\Abondances.csv",sep=""),sep=";")
+}
+
+AF<-matrix(nrow=256, ncol=1)
+
+for (i in 1:nrow(AF))
+{
+AF[i,]<-sum(subset(Abondance[[i]][,-c(1,2,3,4)],Abondance[[i]][,4]==119))
+}
+
+
+#-------------
+# Import du Fichier 3 : les captures cumulees de la derniere annee "CaptCumDerAn"
+#-------------
+Captures<-list()
+
+for (i in 1:length(FILES))
+{
+Captures[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\CapturesPoids.csv",sep=""),sep=";")
+}
+
+CaptCumDerAn<-matrix(nrow=256, ncol=1)
+
+for (i in 1:nrow(CaptCumDerAn))
+{
+CaptCumDerAn[i,]<-sum(subset(Captures[[i]][,-c(1,2,3,4,5)],Captures[[i]][,5]>107))
+}
+
+
+
+#-------------
+# Calcul des captures cumulees au cours des 5 dernieres annees de simulation "CaptCum5Der"
+#-------------------------
+CaptCum5Der<-matrix(nrow=256, ncol=1)
+
+for (i in 1:nrow(CaptCum5Der))
+{
+CaptCum5Der[i,]<-sum(subset(Captures[[i]][,-c(1,2,3,4,5)],Captures[[i]][,5]>59))
+}
+
+
+
+#-------------
+# Import du Fichier 4 : Effort cummule sur toute la duree de la simulation "Effortcumule"
+#-------------
+Effort<-list()
+
+for (i in 1:length(FILES))
+{
+Effort[[i]]<-read.table(paste("C:\\Documents and Settings\\nom\\isis-database-3\\simulations\\",FILES[i],"\\resultExports\\EffortsMetier.csv",sep=""),sep=";")
+}
+
+Effortcumule<-matrix(nrow=256, ncol=1)
+
+for (i in 1:nrow(Effortcumule))
+{
+Effortcumule[i,]<-sum(Effort[[i]][,4])
+}
+
+#----------------------------------------
+AS<-cbind(BF,AF,CaptCumDerAn,CaptCum5Der,Effortcumule) # pour creer une matrice des 5 indicateurs
+dimnames(AS)[[2]]<-c("BF","AF","CaptCumDerAn","CaptCum5Der","Effortcumule")# pour donner les nomes de chaque colonne
+
Property changes on: trunk/src/site/resources/v4/downloads/traitementSorties.R
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/contact.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/download.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/history/changelog.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/history/history.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/history.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/rst/index.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/index.rst 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/rst/index.rst 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,58 +1,58 @@
-.. -
-.. * #%L
-.. * IsisFish
-.. *
-.. * $Id: index.rst 3124 2010-11-29 18:14:09Z chatellier $
-.. * $HeadURL$
-.. * %%
-.. * Copyright (C) 1999 - 2010 Ifremer, Code Lutin
-.. * %%
-.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
-.. * it under the terms of the GNU General Public License as
-.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
-.. * License, or (at your option) any later version.
-.. *
-.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
-.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
-.. * GNU General Public License for more details.
-.. *
-.. * You should have received a copy of the GNU General Public
-.. * License along with this program. If not, see
-.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
-.. * #L%
-.. -
-=========
-ISIS-Fish
-=========
-
-ISIS-Fish est un simulateur de pêcherie complexe. Il est entièrement écrit en
-Java. Dans sa version 2, Le langage de script utilisé était ECMAScript, depuis
-la version 3 on utilise directement du Java, ce qui permet de faire des
-vérification syntaxique et indiquer à l'utilisateur la ligne en erreur.
-
-Pour utiliser ISIS-Fish il vous faut Java d'installé sur votre machine.
-
-Les caractéristiques sont:
-
-- Base de données embarquée
-- Création d'autant de régions de pêches, contenant autant de populations que
- l'on souhaite
-- Création de mesures de gestion en langage de script
-- Possibilité de modifier la façon de simuler en langage de script
-- Possibilité d'éxecuter une suite de simulations en modifiant une ou des
- données de simulation
-- Possibilité d'envoyer les simulations se faire sur une autre machine
-- Affichage des résultats spatialement (carte) ou temporellement (graph)
-- Possibilité de publier les résultats d'une simulation sur un
- serveur
-- Possibilité de publier une région sur un serveur
-
-
-Ce projet est un projet initié à la demande de l'Ifremer et financé par
-celui-ci. L'analyse et la réalisation technique ont été confiées à différents
-partenaires:
-
-- Irin (Institut de Recherche en Informatique de Nantes)
-- Cogitec (http://www.cogitec.fr)
-- Code Lutin (http://www.codelutin.com)
+.. -
+.. * #%L
+.. * IsisFish
+.. *
+.. * $Id: index.rst 3124 2010-11-29 18:14:09Z chatellier $
+.. * $HeadURL$
+.. * %%
+.. * Copyright (C) 1999 - 2010 Ifremer, Code Lutin
+.. * %%
+.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+.. * it under the terms of the GNU General Public License as
+.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+.. * License, or (at your option) any later version.
+.. *
+.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+.. * GNU General Public License for more details.
+.. *
+.. * You should have received a copy of the GNU General Public
+.. * License along with this program. If not, see
+.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+.. * #L%
+.. -
+=========
+ISIS-Fish
+=========
+
+ISIS-Fish est un simulateur de pêcherie complexe. Il est entièrement écrit en
+Java. Dans sa version 2, Le langage de script utilisé était ECMAScript, depuis
+la version 3 on utilise directement du Java, ce qui permet de faire des
+vérification syntaxique et indiquer à l'utilisateur la ligne en erreur.
+
+Pour utiliser ISIS-Fish il vous faut Java d'installé sur votre machine.
+
+Les caractéristiques sont:
+
+- Base de données embarquée
+- Création d'autant de régions de pêches, contenant autant de populations que
+ l'on souhaite
+- Création de mesures de gestion en langage de script
+- Possibilité de modifier la façon de simuler en langage de script
+- Possibilité d'éxecuter une suite de simulations en modifiant une ou des
+ données de simulation
+- Possibilité d'envoyer les simulations se faire sur une autre machine
+- Affichage des résultats spatialement (carte) ou temporellement (graph)
+- Possibilité de publier les résultats d'une simulation sur un
+ serveur
+- Possibilité de publier une région sur un serveur
+
+
+Ce projet est un projet initié à la demande de l'Ifremer et financé par
+celui-ci. L'analyse et la réalisation technique ont été confiées à différents
+partenaires:
+
+- Irin (Institut de Recherche en Informatique de Nantes)
+- Cogitec (http://www.cogitec.fr)
+- Code Lutin (http://www.codelutin.com)
Property changes on: trunk/src/site/rst/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/license.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/listStats.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/news.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/othertools.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/presentation.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/publications.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/research.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/tools/eclipse.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/tools/netbeans.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v1/changelog.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/changelog.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/devel/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/ECMAScript.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/ECMAScriptEdit.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/FAQ.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/Rules.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/ScriptHilaire.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/SimulationLauncher.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v2/user/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/changeVersion.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/changelog.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/devel/SyntaxeOption.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/devel/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/devel/isis-architecture.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/devel/usbkey.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/AnalysePlan.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/ExternalScriptEditor.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/FAQ.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/Historique.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/Installation.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/Introduction.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/LaunchOption.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/UserInterface.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/addSshKey.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/inputs.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/isisFishData.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/result.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/scripts.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v3/user/simulations.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/devel/architecture.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/devel/architectureMexico.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/devel/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/index.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/rst/v4/user/API.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/v4/user/API.rst 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/rst/v4/user/API.rst 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,48 +1,48 @@
-.. -
-.. * #%L
-.. * IsisFish
-.. *
-.. * $Id$
-.. * $HeadURL$
-.. * %%
-.. * Copyright (C) 1999 - 2011 Ifremer, Code Lutin, Chatellier Eric
-.. * %%
-.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
-.. * it under the terms of the GNU General Public License as
-.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
-.. * License, or (at your option) any later version.
-.. *
-.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
-.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
-.. * GNU General Public License for more details.
-.. *
-.. * You should have received a copy of the GNU General Public
-.. * License along with this program. If not, see
-.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
-.. * #L%
-.. -
-Documentation des APIs
-======================
-
-* `Le modele de donnees`_
-* `Javadoc ISIS-Fish`_ ( `src`_ )
-* `Javadoc JAVA`_
-
-Librairies
-----------
-
-* `Javadoc ToPIA`_ (accès base de données)
-* `Javadoc Nuiton-Matrix`_ et plus particulièrement `MatrixND`_
-* `Javadoc Nuiton-Utils`_ (ensemble de méthodes couramment utilisées)
-* `Javadoc Nuiton-j2r`_ (interface entre IsisFish et R)
-
-.. _Le modele de donnees: isisFishModel.html
-.. _Javadoc ISIS-Fish: ../../apidocs/index.html
-.. _src: ../../xref/index.html
-.. _Javadoc JAVA: http://java.sun.com/javase/6/docs/api/
-.. _Javadoc ToPIA: http://maven-site.nuiton.org/topia/topia-persistence/apidocs/index.html
-.. _Javadoc Nuiton-Matrix: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix/apidocs/index.html
-.. _MatrixND: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix/apidocs/org/nuiton/math/matrix/M…
-.. _Javadoc Nuiton-Utils: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-utils/nuiton-utils/apidocs/index.html
+.. -
+.. * #%L
+.. * IsisFish
+.. *
+.. * $Id$
+.. * $HeadURL$
+.. * %%
+.. * Copyright (C) 1999 - 2011 Ifremer, Code Lutin, Chatellier Eric
+.. * %%
+.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+.. * it under the terms of the GNU General Public License as
+.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+.. * License, or (at your option) any later version.
+.. *
+.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+.. * GNU General Public License for more details.
+.. *
+.. * You should have received a copy of the GNU General Public
+.. * License along with this program. If not, see
+.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+.. * #L%
+.. -
+Documentation des APIs
+======================
+
+* `Le modele de donnees`_
+* `Javadoc ISIS-Fish`_ ( `src`_ )
+* `Javadoc JAVA`_
+
+Librairies
+----------
+
+* `Javadoc ToPIA`_ (accès base de données)
+* `Javadoc Nuiton-Matrix`_ et plus particulièrement `MatrixND`_
+* `Javadoc Nuiton-Utils`_ (ensemble de méthodes couramment utilisées)
+* `Javadoc Nuiton-j2r`_ (interface entre IsisFish et R)
+
+.. _Le modele de donnees: isisFishModel.html
+.. _Javadoc ISIS-Fish: ../../apidocs/index.html
+.. _src: ../../xref/index.html
+.. _Javadoc JAVA: http://java.sun.com/javase/6/docs/api/
+.. _Javadoc ToPIA: http://maven-site.nuiton.org/topia/topia-persistence/apidocs/index.html
+.. _Javadoc Nuiton-Matrix: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix/apidocs/index.html
+.. _MatrixND: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-matrix/apidocs/org/nuiton/math/matrix/M…
+.. _Javadoc Nuiton-Utils: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-utils/nuiton-utils/apidocs/index.html
.. _Javadoc Nuiton-j2r: http://maven-site.nuiton.org/nuiton-j2r/apidocs/index.html
\ No newline at end of file
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/API.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/FAQ.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/caparmor.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/changements40.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/installation.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/installationr.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/isisFishModel.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/migrationv3v4.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Modified: trunk/src/site/rst/v4/user/scripts.rst
===================================================================
--- trunk/src/site/rst/v4/user/scripts.rst 2011-12-09 10:27:08 UTC (rev 57)
+++ trunk/src/site/rst/v4/user/scripts.rst 2011-12-09 10:32:24 UTC (rev 58)
@@ -1,148 +1,148 @@
-.. -
-.. * #%L
-.. * IsisFish
-.. *
-.. * $Id$
-.. * $HeadURL$
-.. * %%
-.. * Copyright (C) 1999 - 2010 Ifremer, Code Lutin
-.. * %%
-.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
-.. * it under the terms of the GNU General Public License as
-.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
-.. * License, or (at your option) any later version.
-.. *
-.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
-.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
-.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
-.. * GNU General Public License for more details.
-.. *
-.. * You should have received a copy of the GNU General Public
-.. * License along with this program. If not, see
-.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
-.. * #L%
-.. -
-Page de dépôt de scripts
-========================
-
-Cette page a pour vocation d'accueillir des scripts non génériques des
-utilisateurs qui souhaitent les partager.
-Merci d'indiquer
- * l'auteur,
- * la version pour laquelle le script fonctionne,
- * la région,
- * de préciser, pour les plans d'analyse, de quel type ils sont (exploration, analyse de sensibilité,...)
- * et de produire un descriptif de l'action du script.
-
-Plans de simulation
--------------------
-
-P_As_planFactFractV-12param sur la pêcherie Anchois
-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-
-Sigrid V3.1.3, Plan d'analyse : pour l'analyse de sensibilité sur la pêcherie
-Anchois du GdG:
-
-Méthode de groupe screening, les facteurs de l'analyse sont 12 groupes de
-paramètres (facteurs de standardisation, mortalité naturelle adulte, mortalité
-naturelle juvénile, valeurs de capturabilité,valeurs de fécondité, coefficients
-de migration, bornes des classes de longueur,équations de sélectivité,équations
-des facteurs de ciblage, valeur d'inactivité, valeur du TAC (français et
-espagnol), paramètres de l'aire marine protegee), le plan est un plan factoriel
-fractionnaire de résolution V (256 simulations).
-
-`Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice`_
-
-.. _Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice: ../downloads/P_As_planFactFract_12param_Anchois.zip
-
-Calibration du paramètre de capturabilité
-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-
-Sigrid V 3.3.0.2, Plan d'analyse : pour la calibration d un parametre de
-capturabilité : algorithme décrit dans Walters, F.H., Parker, L.R., Morgan, S.L.
-and Deming, S.N. 1991. Sequential Simplex optimization: a technique for
-improving quality and productivity in reasearch, development, and manufacturing
-(Chemometrics series). B.R. CRC Press LLC. 402 pp. On spécifie 5 valeurs
-initiales séparées d'un meme pas, puis l'algorithme trouve la valeur qui
-minimise la fonction objectif en explorant le voisinage de la meilleure valeur
-avec un pas de plus en plus petit. `Plan d'analyse`_
-
-.. _Plan d'analyse: ../downloads/P_Calibration_1param.zip
-
-Plan qui modifie les regles de gestion / modifying management rules
-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-
-Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles
-de gestion a chaque simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_
-
-.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanModifRules.zip
-
-Plan qui modifie regle de gestion et parametres / modify rules and parameters
-~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
-
-Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles
-de gestion, et des parametres (equations et nb de jours d'inactivite) a chaque
-simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_
-
-.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanRulesParam.zip
-
-Règles de gestion
------------------
-
-Sigrid V3.3.0.4, Règle de gestion : modification du script de TAC pour qu'il
-s'applique de juillet à juin, pour qu'il ne concerne qu'une stratégie et que la
-pêcherie soit fermée si la biomasse passe sous un seuil defini. `TAC modifie`_
-
-.. _TAC modifie: ../downloads/TACfix_Es_Anchois.java
-
-Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : Effort Reduction en modifiant le temps
-d'inactivite. `Effort reduction`_
-
-.. _Effort reduction: ../downloads/EffortReduction.java
-
-Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : le pourcentage d'effort par metier chaque
-mois est force a des valeurs lues dans un fichier `% Effort`_
-
-.. _% Effort: ../downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java
-
-A venir:
-
-* regle implementant un RUM (modele de comportement de peche)
-* regle de gestion incluant RUM et gestion par TAC
-* HCR : TAC definit annuellement en fonction de la Biomasse du stock
-
-Exports
--------
-
-Analyses de sensibilité
------------------------
-
-Exports pour analyse de sensibilité
------------------------------------
-
-Simulateurs
------------
-
-Équations
----------
-
-Quelques exemples d'equations compliquees pour donner des idees du possible (Sigrid, Anchois)
-
-* `Equation de croissance simple VBGF`_
-* `Equation de Poids qui change selon le mois`_
-* `Equation de mortalite naturelle spatialisee`_ et variant chaque annee pour le premier groupe
-* `Equation de reproduction`_ qui force la valeur les trois premieres annees puis la calcule
-* `Equation de migration densite dependante`_
-* `Equation de migration`_ dont les coefficients sont forces aux valeurs observees tous les ans
-* `Equation de prix en fonction des debarquements`_
-
-.. _Equation de croissance simple VBGF: ../downloads/VGBFAnchois.java
-.. _Equation de Poids qui change selon le mois: ../downloads/Weight_month.java
-.. _Equation de mortalite naturelle spatialisee: ../downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java
-.. _Equation de reproduction: ../downloads/Repro_recru0-2_StocksOeufs_Spatialisee061107.java
-.. _Equation de migration densite dependante: ../downloads/MigrationAout.java
-.. _Equation de migration: ../downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java
-.. _Equation de prix en fonction des debarquements: ../downloads/prixAnchois.java
-
-Scripts
--------
+.. -
+.. * #%L
+.. * IsisFish
+.. *
+.. * $Id$
+.. * $HeadURL$
+.. * %%
+.. * Copyright (C) 1999 - 2010 Ifremer, Code Lutin
+.. * %%
+.. * This program is free software: you can redistribute it and/or modify
+.. * it under the terms of the GNU General Public License as
+.. * published by the Free Software Foundation, either version 2 of the
+.. * License, or (at your option) any later version.
+.. *
+.. * This program is distributed in the hope that it will be useful,
+.. * but WITHOUT ANY WARRANTY; without even the implied warranty of
+.. * MERCHANTABILITY or FITNESS FOR A PARTICULAR PURPOSE. See the
+.. * GNU General Public License for more details.
+.. *
+.. * You should have received a copy of the GNU General Public
+.. * License along with this program. If not, see
+.. * <http://www.gnu.org/licenses/gpl-2.0.html>.
+.. * #L%
+.. -
+Page de dépôt de scripts
+========================
+
+Cette page a pour vocation d'accueillir des scripts non génériques des
+utilisateurs qui souhaitent les partager.
+Merci d'indiquer
+ * l'auteur,
+ * la version pour laquelle le script fonctionne,
+ * la région,
+ * de préciser, pour les plans d'analyse, de quel type ils sont (exploration, analyse de sensibilité,...)
+ * et de produire un descriptif de l'action du script.
+
+Plans de simulation
+-------------------
+
+P_As_planFactFractV-12param sur la pêcherie Anchois
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+
+Sigrid V3.1.3, Plan d'analyse : pour l'analyse de sensibilité sur la pêcherie
+Anchois du GdG:
+
+Méthode de groupe screening, les facteurs de l'analyse sont 12 groupes de
+paramètres (facteurs de standardisation, mortalité naturelle adulte, mortalité
+naturelle juvénile, valeurs de capturabilité,valeurs de fécondité, coefficients
+de migration, bornes des classes de longueur,équations de sélectivité,équations
+des facteurs de ciblage, valeur d'inactivité, valeur du TAC (français et
+espagnol), paramètres de l'aire marine protegee), le plan est un plan factoriel
+fractionnaire de résolution V (256 simulations).
+
+`Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice`_
+
+.. _Plan d analyse et Fichiers Parametres et matrice: ../downloads/P_As_planFactFract_12param_Anchois.zip
+
+Calibration du paramètre de capturabilité
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+
+Sigrid V 3.3.0.2, Plan d'analyse : pour la calibration d un parametre de
+capturabilité : algorithme décrit dans Walters, F.H., Parker, L.R., Morgan, S.L.
+and Deming, S.N. 1991. Sequential Simplex optimization: a technique for
+improving quality and productivity in reasearch, development, and manufacturing
+(Chemometrics series). B.R. CRC Press LLC. 402 pp. On spécifie 5 valeurs
+initiales séparées d'un meme pas, puis l'algorithme trouve la valeur qui
+minimise la fonction objectif en explorant le voisinage de la meilleure valeur
+avec un pas de plus en plus petit. `Plan d'analyse`_
+
+.. _Plan d'analyse: ../downloads/P_Calibration_1param.zip
+
+Plan qui modifie les regles de gestion / modifying management rules
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+
+Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles
+de gestion a chaque simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_
+
+.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanModifRules.zip
+
+Plan qui modifie regle de gestion et parametres / modify rules and parameters
+~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~~
+
+Sigrid V 3.3.0.8 , Plan d'analyse pour la pecherie anchois : modifie les regles
+de gestion, et des parametres (equations et nb de jours d'inactivite) a chaque
+simulation `Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan`_
+
+.. _Dossier contenant tous les fichiers nécessaires à ce plan: ../downloads/PlanRulesParam.zip
+
+Règles de gestion
+-----------------
+
+Sigrid V3.3.0.4, Règle de gestion : modification du script de TAC pour qu'il
+s'applique de juillet à juin, pour qu'il ne concerne qu'une stratégie et que la
+pêcherie soit fermée si la biomasse passe sous un seuil defini. `TAC modifie`_
+
+.. _TAC modifie: ../downloads/TACfix_Es_Anchois.java
+
+Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : Effort Reduction en modifiant le temps
+d'inactivite. `Effort reduction`_
+
+.. _Effort reduction: ../downloads/EffortReduction.java
+
+Sigrid V3.3.0.8, Regle de gestion : le pourcentage d'effort par metier chaque
+mois est force a des valeurs lues dans un fichier `% Effort`_
+
+.. _% Effort: ../downloads/Effort_2000_2004_MultiSp.java
+
+A venir:
+
+* regle implementant un RUM (modele de comportement de peche)
+* regle de gestion incluant RUM et gestion par TAC
+* HCR : TAC definit annuellement en fonction de la Biomasse du stock
+
+Exports
+-------
+
+Analyses de sensibilité
+-----------------------
+
+Exports pour analyse de sensibilité
+-----------------------------------
+
+Simulateurs
+-----------
+
+Équations
+---------
+
+Quelques exemples d'equations compliquees pour donner des idees du possible (Sigrid, Anchois)
+
+* `Equation de croissance simple VBGF`_
+* `Equation de Poids qui change selon le mois`_
+* `Equation de mortalite naturelle spatialisee`_ et variant chaque annee pour le premier groupe
+* `Equation de reproduction`_ qui force la valeur les trois premieres annees puis la calcule
+* `Equation de migration densite dependante`_
+* `Equation de migration`_ dont les coefficients sont forces aux valeurs observees tous les ans
+* `Equation de prix en fonction des debarquements`_
+
+.. _Equation de croissance simple VBGF: ../downloads/VGBFAnchois.java
+.. _Equation de Poids qui change selon le mois: ../downloads/Weight_month.java
+.. _Equation de mortalite naturelle spatialisee: ../downloads/MzonesAnneeMpertMgdg.java
+.. _Equation de reproduction: ../downloads/Repro_recru0-2_StocksOeufs_Spatialisee061107.java
+.. _Equation de migration densite dependante: ../downloads/MigrationAout.java
+.. _Equation de migration: ../downloads/MigrationAdultsAvrilHistoric.java
+.. _Equation de prix en fonction des debarquements: ../downloads/prixAnchois.java
+
+Scripts
+-------
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/scripts.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/scriptsR.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/firstLaunch.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/parameterising.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/simulationPlan.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/useAPI.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials/utilCaparmor.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/tutorials.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/GUI.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/analysisPlan.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/inputs.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/introduction.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/launcher.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/queue.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/results.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/scripts.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual/sensitivity.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/usermanual.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/rst/v4/user/warning.rst
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/site_en.xml
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
Property changes on: trunk/src/site/site_fr.xml
___________________________________________________________________
Added: svn:eol-style
+ native
1
0