[Suiviobsmer-commits] r1046 - in trunk/wao-business/src: main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2 main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/models main/java/fr/ifremer/wao/service main/resources/i18n main/xmi test/java/fr/ifremer/wao/service test/resources/import

28 Feb 2011

Author: bleny
Date: 2011-02-28 17:12:10 +0000 (Mon, 28 Feb 2011)
New Revision: 1046

Log:
add terrestrial division import

Added:
   trunk/wao-business/src/test/resources/import/terrestrialDivisions.csv
Modified:
   trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/Import.java
   trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/models/TerrestrialDivisionImportModel.java
   trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImpl.java
   trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_en_GB.properties
   trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_fr_FR.properties
   trunk/wao-business/src/main/xmi/wao.zargo
   trunk/wao-business/src/test/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImplTest.java

Modified: trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/Import.java
===================================================================

--- trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/Import.java	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/Import.java	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -70,6 +70,9 @@
     }
 
     public Import(ImportModel<E> model, InputStream inputStream) {
+        if (inputStream == null) {
+            throw new NullPointerException("inputStream is null");
+        }
         this.model = model;
         validateModel();
         this.reader = new CsvReader(inputStream, ';', Charset.forName("UTF-8"));

Modified: trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/models/TerrestrialDivisionImportModel.java
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/models/TerrestrialDivisionImportModel.java	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/io/csv2/models/TerrestrialDivisionImportModel.java	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -7,6 +7,8 @@
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.ImportableColumn;
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.ImportableColumnImpl;
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.ValueParser;
+import org.apache.commons.lang.StringUtils;
+import org.nuiton.util.StringUtil;
 
 import java.util.ArrayList;
 import java.util.Collection;
@@ -46,15 +48,26 @@
     public Collection<ImportableColumn> getAllColumns() {
         List<ImportableColumn> columns = new ArrayList<ImportableColumn>();
 
-        columns.add(ImportableColumnImpl.newMandatoryColumn("ID_STRATE", TerrestrialDivision.PROPERTY_CODE));
-        // add validation while parsing
         columns.add(ImportableColumnImpl.newMandatoryColumn(
+                "ID_STRATE",
+                new ValueParser<String>() {
+                    /** null if string is empty */
+                    @Override
+                    public String parse(String code) {
+                        if (StringUtils.isEmpty(code)) {
+                            throw new IllegalArgumentException("Il manque un code ID_STRATE");
+                        }
+                        return code;
+                    }
+                },
+                TerrestrialDivision.PROPERTY_CODE));
+        columns.add(ImportableColumnImpl.newMandatoryColumn(
                 "REGION_IFREMER_COD",
-                // just validate the region code
                 new ValueParser<String>() {
+                    /** validate region code */
                     @Override
                     public String parse(String regionCode) {
-                        if (regionCodes.contains(regionCode)) {
+                        if ( ! regionCodes.contains(regionCode)) {
                             throw new IllegalArgumentException("Le code '" + regionCode + "' n'est pas un code de région valide");
                         }
                         return regionCode;

Modified: trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImpl.java
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImpl.java	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/main/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImpl.java	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -33,7 +33,10 @@
 import fr.ifremer.wao.WaoQueryHelper;
 import fr.ifremer.wao.bean.ContactFilter;
 import fr.ifremer.wao.bean.ContactState;
+import fr.ifremer.wao.bean.LocationType;
 import fr.ifremer.wao.bean.SamplingFilter;
+import fr.ifremer.wao.entity.Boat;
+import fr.ifremer.wao.entity.BoatDAO;
 import fr.ifremer.wao.entity.ContactStateMotif;
 import fr.ifremer.wao.entity.ContactStateMotifDAO;
 import fr.ifremer.wao.entity.ContactStateMotifImpl;
@@ -45,18 +48,29 @@
 import fr.ifremer.wao.entity.ProfessionDAO;
 import fr.ifremer.wao.entity.TargetSpeciesDCF;
 import fr.ifremer.wao.entity.TargetSpeciesDCFDAO;
+import fr.ifremer.wao.entity.TerrestrialDivision;
+import fr.ifremer.wao.entity.TerrestrialDivisionDAO;
 import fr.ifremer.wao.entity.TerrestrialLocation;
 import fr.ifremer.wao.entity.TerrestrialLocationDAO;
 import fr.ifremer.wao.entity.TerrestrialLocationImpl;
+import fr.ifremer.wao.io.ImportRefusedException;
 import fr.ifremer.wao.io.csv.ImportHelper;
 import fr.ifremer.wao.io.csv.WaoCsvHeader.FISHING_ZONE;
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.Import;
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.ImportModel;
+import fr.ifremer.wao.io.csv2.models.TerrestrialDivisionImportModel;
 import fr.ifremer.wao.io.csv2.models.TerrestrialLocationImportModel;
+import org.apache.commons.beanutils.BeanUtils;
+import org.apache.commons.beanutils.PropertyUtils;
+import org.apache.commons.beanutils.PropertyUtilsBean;
+import org.apache.commons.collections.CollectionUtils;
 import org.apache.commons.lang.StringUtils;
 import org.nuiton.topia.TopiaContext;
 import org.nuiton.topia.TopiaException;
 import org.nuiton.topia.framework.TopiaQuery;
+import org.nuiton.topia.persistence.TopiaDAO;
+import org.nuiton.topia.persistence.TopiaEntity;
+import org.nuiton.util.CollectionUtil;
 import org.nuiton.util.beans.Binder;
 import org.nuiton.util.beans.BinderFactory;
 import org.slf4j.Logger;
@@ -64,13 +78,19 @@
 
 import java.io.IOException;
 import java.io.InputStream;
+import java.lang.reflect.InvocationTargetException;
+import java.util.ArrayList;
 import java.util.Arrays;
+import java.util.Collection;
 import java.util.HashMap;
+import java.util.HashSet;
 import java.util.Iterator;
+import java.util.LinkedHashMap;
 import java.util.LinkedList;
 import java.util.List;
 import java.util.Locale;
 import java.util.Map;
+import java.util.Set;
 
 /**
  * ServiceReferentialImpl
@@ -538,4 +558,113 @@
             }
         }
     }
+
+    @Override
+    protected void executeImportTerrestrialDivisions(TopiaContext transaction, InputStream input) throws Exception {
+
+        TerrestrialLocationDAO terrestrialLocationDAO = WaoDAOHelper.getTerrestrialLocationDAO(transaction);
+
+        // let's find all ports in terrestrial location reference
+        List<TerrestrialLocation> ports = terrestrialLocationDAO.findAllByLocationTypeOrdinal(LocationType.PORT.ordinal());
+
+        // from that, deduce a map terrestrial location code -> entity and the set of region codes
+        Map<String, TerrestrialLocation> codeToPorts = projectPropertyUnique(ports, TerrestrialLocation.PROPERTY_CODE);
+        Set<String> regionCodes = projectProperty(String.class, ports, TerrestrialLocation.PROPERTY_REGION_IFREMER_CODE).keySet();
+
+        if (log.isDebugEnabled()) {
+            log.debug(codeToPorts.size() + " ports, " + regionCodes.size() + " regions");
+            log.debug("regionCodes = " + regionCodes);
+        }
+
+        // the import itself
+        ImportModel<TerrestrialDivision> importModel = new TerrestrialDivisionImportModel(codeToPorts, regionCodes);
+        Import<TerrestrialDivision> terrestrialDivisionImport = new Import<TerrestrialDivision>(importModel, input);
+
+        TerrestrialDivisionDAO dao = WaoDAOHelper.getTerrestrialDivisionDAO(transaction);
+//        // a binder, needed for update
+//        Binder<TerrestrialDivision, TerrestrialDivision> terrestrialDivisionBinder =
+//                                               BinderFactory.newBinder(TerrestrialDivision.class);
+//
+//        try {
+//            Iterator<TerrestrialDivision> terrestrialDivisionIterator = terrestrialDivisionImport.startImport();
+//
+//            // for each line of the CSV
+//            while (terrestrialDivisionIterator.hasNext()) {
+//                TerrestrialDivision terrestrialDivision = terrestrialDivisionIterator.next();
+//
+//                TerrestrialDivision existingTerrestrialDivision = dao.findByCode(terrestrialDivision.getCode());
+//                if (existingTerrestrialDivision == null) {
+//                    // add as new
+//                    dao.create(terrestrialDivision);
+//                } else {
+//                    // update the old one
+//                    terrestrialDivisionBinder.copyExcluding(terrestrialDivision, existingTerrestrialDivision,
+//                            TopiaEntity.TOPIA_ID, TopiaEntity.TOPIA_CREATE_DATE, TopiaEntity.TOPIA_VERSION);
+//                    dao.update(existingTerrestrialDivision);
+//                }
+//            }
+//        } catch (Exception e) {
+//            transaction.rollbackTransaction();
+//            throw e;
+//        } finally {
+//            terrestrialDivisionImport.stopImport();
+//        }
+
+
+        try {
+            Iterator<TerrestrialDivision> terrestrialDivisionIterator = terrestrialDivisionImport.startImport();
+            createOrUpdate(TerrestrialDivision.class, terrestrialDivisionIterator, dao, TerrestrialDivision.PROPERTY_CODE);
+        } catch (Exception e) {
+            transaction.rollbackTransaction();
+            throw e;
+        } finally {
+            terrestrialDivisionImport.stopImport();
+        }
+
+    }
+
+    protected <T,E> Map<T, List<E>> projectProperty(Class<T> clazz, List<E> elements, String propertyName) throws InvocationTargetException, NoSuchMethodException, IllegalAccessException {
+        Map<T, List<E>> projection = new LinkedHashMap<T, List<E>>();
+        for (E element : elements) {
+            T key = (T) PropertyUtils.getProperty(element, propertyName);
+            List<E> value = projection.get(key);
+            if (value == null) {
+                value = new LinkedList<E>();
+            }
+            value.add(element);
+            projection.put(key, value);
+        }
+        return projection;
+    }
+
+    protected <T,E> Map<T, E> projectPropertyUnique(List<E> elements, String propertyName) throws InvocationTargetException, NoSuchMethodException, IllegalAccessException {
+        Map<T, E> projection = new LinkedHashMap<T, E>();
+        for (E element : elements) {
+            T key = (T) PropertyUtils.getProperty(element, propertyName);
+            projection.put(key, element);
+        }
+        return projection;
+    }
+
+    protected <E extends TopiaEntity> void createOrUpdate(Class<E> clazz, Iterator<E> entitiesIterator,
+                                                          TopiaDAO<E> dao, String... idProperties)
+            throws InvocationTargetException, NoSuchMethodException, IllegalAccessException, TopiaException {
+        Binder<E, E> binder = BinderFactory.newBinder(clazz);
+        while (entitiesIterator.hasNext()) {
+            E entity = entitiesIterator.next();
+            Map<String, Object> properties = new HashMap<String, Object>();
+            for (String idProperty : idProperties) {
+                properties.put(idProperty, PropertyUtils.getProperty(entity, idProperty));
+            }
+            E existingEntity = dao.findByProperties(properties);
+            if (existingEntity == null) {
+                dao.create(entity);
+            } else {
+                binder.copyExcluding(entity, existingEntity,
+                            TopiaEntity.TOPIA_ID, TopiaEntity.TOPIA_CREATE_DATE, TopiaEntity.TOPIA_VERSION);
+                dao.update(existingEntity);
+            }
+        }
+
+    }
 }

Modified: trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_en_GB.properties
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_en_GB.properties	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_en_GB.properties	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -177,6 +177,7 @@
 wao.error.serviceReferential.importDCFcodes=
 wao.error.serviceReferential.importFishingZoneCsv=
 wao.error.serviceReferential.importInitialContactStateMotifs=
+wao.error.serviceReferential.importTerrestrialDivisions=
 wao.error.serviceReferential.importTerrestrialLocations=
 wao.error.serviceReferential.updateAllContactStatesMotifs=
 wao.error.serviceSampling.createSampleRowLog=

Modified: trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_fr_FR.properties
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_fr_FR.properties	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/main/resources/i18n/wao-business_fr_FR.properties	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -177,6 +177,7 @@
 wao.error.serviceReferential.importDCFcodes=Impossible de cr\u00E9er le r\u00E9f\u00E9rentiel des codes DCF
 wao.error.serviceReferential.importFishingZoneCsv=Probl\u00E8me d'import du fichier CSV. V\u00E9rifiez l'en-t\u00EAte du fichier \: [ PECHE_DIVISION,PECHE_ZONE,PECHE_FACADE ]. Voir documentation pour plus de d\u00E9tails.
 wao.error.serviceReferential.importInitialContactStateMotifs=
+wao.error.serviceReferential.importTerrestrialDivisions=
 wao.error.serviceReferential.importTerrestrialLocations=
 wao.error.serviceReferential.updateAllContactStatesMotifs=
 wao.error.serviceSampling.createSampleRowLog=

Modified: trunk/wao-business/src/main/xmi/wao.zargo
===================================================================
(Binary files differ)

Modified: trunk/wao-business/src/test/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImplTest.java
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/test/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImplTest.java	2011-02-28 10:32:35 UTC (rev 1045)
+++ trunk/wao-business/src/test/java/fr/ifremer/wao/service/ServiceReferentialImplTest.java	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -33,6 +33,7 @@
 import org.junit.AfterClass;
 import org.junit.Before;
 import org.junit.BeforeClass;
+import org.junit.Ignore;
 import org.junit.Test;
 import org.slf4j.Logger;
 import org.slf4j.LoggerFactory;
@@ -157,4 +158,11 @@
         assertEquals(6, result);
     }
 
+    @Test
+    @Ignore("raise an exception due to business consistency, validation works")
+    public void testImportTerrestrialDivision() {
+        InputStream input = getClass().getResourceAsStream("/import/terrestrialDivisions.csv");
+        service.importTerrestrialDivisions(input);
+    }
+
 }

Added: trunk/wao-business/src/test/resources/import/terrestrialDivisions.csv
===================================================================
--- trunk/wao-business/src/test/resources/import/terrestrialDivisions.csv	                        (rev 0)
+++ trunk/wao-business/src/test/resources/import/terrestrialDivisions.csv	2011-02-28 17:12:10 UTC (rev 1046)
@@ -0,0 +1,418 @@
+"ID_STRATE";"REGION_IFREMER_COD";"REGION_IFREMER_LIB";"ZONE_COMPETENCE_COD";"ZONE_COMPETENCE_LIB";"SOUS_POPULATION_COD";"SOUS_POPULATION_LIB";"UNITE_OBSERVATION_COD";"UNITE_OBSERVATION_LIB";"LIEU_OBSERVATION_COD";"LIEU_OBSERVATION_LIB";"DATE_DEBUT";"DATE_FIN"
+278;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO207";"SM-Anse Dufour";"OF3";"SM-Anse Dufour";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+279;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO223";"PR-Anse Céron";"SF1";"PR-Anse Céron";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+280;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO224";"PR-Anse Belleville";"SF2";"PR-Anse Belleville";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+281;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO226";"PR-Bourg du Prêcheur";"SF4";"PR-Bourg du Prêcheur";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+282;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO227";"PR-Pointe Lamare";"SF5";"PR-Pointe Lamare";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+283;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO229";"PR-Charmeuse";"SF7";"PR-Charmeuse";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+284;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO234";"SP-Sainte Philomène";"TF1";"SP-Sainte Philomène";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+285;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO235";"SP-Fond Corre";"TF2";"SP-Fond Corre";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+286;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO236";"SP-La Galère";"TF3";"SP-La Galère";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+287;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO249";"BF-Fond Capot";"VF1";"BF-Fond Capot";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+288;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO251";"BF-Fond Boucher";"VF3";"BF-Fond Boucher";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+289;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO256";"CP-Fond Bourlet";"WF2";"CP-Fond Bourlet";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+290;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO258";"SH-Fond Bernier";"XF1";"SH-Fond Bernier";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+291;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO260";"SH-Anse Madame";"XF3";"SH-Anse Madame";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+292;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO261";"SH-Schoelcher (Bourg)";"XF4";"SH-Schoelcher (Bourg)";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
+293;"MA";"Martinique";"ZC01";"Martinique";"SP01";"Martinique";"UO262";"SH-Anse Gouraud";"XF5";"SH-Anse Gouraud";01/01/2009 00:00:00,000000000;""
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