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February 2014

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Re: [Cantharella-devel] Stockage des documents
by Adrien Cheype 06 May '14

06 May '14

Bonjour, Éternel débat : stockage des fichiers dans la base ou le système de fichier ? http://wiki.postgresql.org/wiki/BinaryFilesInDB Si vous préférez stocker les fichiers dans la base, je n'y vois pas d'inconvénient. J'ai personnellement toujours enregistré les fichiers à part dans le système de fichier mais dans le contexte de Cantharella, le stockage dans la base suivrait une certaine logique. L'autre question qui se pose alors est : en bytea ou en BLOB (oid) ? Dans notre cas de fichier peu volumineux (cf. limitation de taille définie dans les spécs.), les deux alternatives peuvent convenir. La principale différence étant que pour bytea, les données restent dans une colonne de la table tandis que pour les BLOB, les données sont externalisées dans une table système et référencées par un oid. D'un côté, Bytea semblent être plus facile à mettre en place mais pourrait engendrer certains problèmes de performance lors de requête sur l'ensemble des documents (preload), de l'autre BLOB semble garder toujours de bonnes performances (on demand) même avec des données plus volumineuses mais nécessite de mettre en place un système de suppression automatique des BLOB lorsque la référence (oid) est supprimé (trigger, rule). Adrien Le 14/02/2013 03:23, Eric Chatellier a écrit : > Bonjour, > > Je viens de mettre à jour le serveur avec le début des > interfaces de gestion et visualisation des documents (seulement > pour les molécules avant de le généraliser). > > Concernant le stockage des fichiers attachés, peut-on > les stocker directement dans la base de données ? > > Cela simplifierais la gestion et la cohérence pour l'ajout > et la suppression. > > Techniquement, le modèle de données serait typé en byte[] > voire en InputStream (voire si vraiment ca ne fonctionne pas > en java.sql.Blob) et annoté en @Lob > -- Adrien Cheype Ingénieur en Systèmes d'Information Service « Informatique Scientifique et Appui aux Partenaires du Sud » Direction du Système d'Information (DSI) http://www.ird.fr/dsi/ http://www.ird.fr/informatique-scientifique/ INSTITUT DE RECHERCHE POUR LE DEVELOPPEMENT BP A5 - 98848 Nouméa - Nouvelle Calédonie Tél. +687 260 789

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CR Réunion Cantharella 11 février 2014
by Eric Chatellier 11 Feb '14

11 Feb '14

CR Réunion Cantharella 11 février 2014 ====================================== Import données -------------- L'import consiste à importer des fichiers Excel ayant une structure déjà définie proche des interfaces de liste actuelle. Il est constitué de plusieurs onglets correspondant respectivement au Campagne, Stations, Spécimens, Échantillon, Extractions, Tests biologiques, Molécules. La structure comporte toujours un champs ayant une contrainte d'unicité et permettant d'identifier une ligne dans la base de données. Un squelette de fichier vide sera fournit par l'application Cantharella. Lors de l'import, si la ligne est déjà présente en base de données, elle doit être ignorée, seule les nouvelles lignes sont importées. Un rapport est affiché à l'utilisateur lui indiquant, le nombre de ligne ajoutée, ignorée, en erreur. Pour chaque erreur un message plus spécifique est affiché avec la référence de la ligne. Les molécules ne contiendront pas de formule des molécules. Le format excel devra correspondre à plusieurs version d'Excel et devra donc être compatible (xls, mais pas de xlsx). Au niveau de la campagne ------------------------ Il devra être possible de définir un utilisateur non admin comme "administrateur de campagne" pour donner des droits à la campagne sans passer par l'admin. En plus ce cet modifications, il sera nécessaire de retravailler la récupération des données depuis la base de données en fonction des droits et de modifier les interfaces de listes en conséquence. La priorité est d'avoir une interface qui fonctionne. Le devis sera constitué de plusieurs points: - intégration de la vérification des droits directement en base (actuellement en Java) - utilisation de ce mécanisme pour toutes les listes de l'application - ajout des droits et des interfaces pour les administrateurs de campagne SIG --- L'idée est d'avoir: - une recherche via une sélection sur une carte (station) - une visualisation des résultats sur une carte (station) La sélection des stations s’effectuera via la sélection d'une zone et les stations incluses dans cette zone seront prises en compte dans la recherche. Étudier la possibilité d'ajouter des fond de cartes par les utilisateurs. La librairie LeafLet (http://leafletjs.com/) et les fonds de cartes OpenStreetMap semblent convenir au besoin et pourront être utilisé. Étudier la possibilité d'utiliser postgis (ou pas) pour la gestion des coordonnées GPS des stations. Ajout de tickets ---------------- Ajouter un bouton "Enregistrer et continuer la saisie" sur les tests biologiques. Lors de la saisie de beaucoup de résultats, ce bouton validerait tout ce qui a été saisit (enregistrement en base et resterait sur la page courante, sans revenir à la liste des tests biologiques comme actuellement). Ajouter un indicateur de progression de reconstruction de l'index lucene. Si une progression n'est pas possible, au moins mettre un message qui se rafraichi qui indique que la reconstruction est en cours. -- Éric Chatellier - www.codelutin.com - 02.40.50.29.28

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