February 2012 - Isis-fish-devel - mailman.cloud.codelutin.com

ISIS est particulièrement lent pour récupérer les simulations depuis CAPARMOR
by Loic GASCHE 02 Mar '12

02 Mar '12

Bonjour, Voulant essayer la nouvelle version 4.0.0.3 incorporant les modification d'Eric, j'ai lancé deux AS identiques aux précédentes sur caparmor hier soir. Apparemment il y a eu un problème de connexion cette nuit pendant qu'ISIS récupérait les simulations et ce processus semblait arrêté ce matin. J'ai donc relancé ISIS et la récupération des simulations depuis caparmor a repris, mais elle sont d'une lenteur effroyable : ISIS m'indique avoir récupéré 6 simus au cours de la dernière heure... et ça correspond bien à la création de mes dernières simulations dans isis-database. Par dessus le marché on dirait que j'ai également eu un plantage de Java, si j'en crois le message d'erreur qui est apparu dans le dossier "sensitivityresults" de isis-database (en PJ). Voilà, en gros je m'interroge sur la cause possible de cette lenteur. Dans la queue de lancement des simus j'ai une simu affichée commme terminée avec le message "Recherche de la dernière simulation", et rien pour les autres. Est-ce que le fait d'avoir lancé deux AS peut créer un cafouillage au moment de récupérer les simulations et causer ce ralentissement ? Est-ce qu' arrêter les simulations qui sont dans la queue de simulation et à les relancer pourrait relancer la récupération de ces dernières ? Loïc

2 10

Caparmor n'aime pas les accents ?
by Loic GASCHE 28 Feb '12

28 Feb '12

Bonjour, En voulant relancer mon AS d'hier sur caparmor, j'ai trouvé que les noms de certaines variables de mon AS avaient été modifiés. Ca porte sur les TargetFactors, et manifestement ça vient de la présence d'accents. Par exemple, Beaming7D_Sole_janvier_dA_A_cembre__TargetFactor__targetFactorEquation (la première fois que j'ai regardé la liste j'avais même des @ ou un caractère du genre au milieu des A dans dA_A_cembre) au lieu de Beaming7D_Sole_janvier_décembre__TargetFactor__targetFactorEquation Est-ce que cela peut poser problème dans le déroulement d'une AS (surtout si je reprends une simu de l'AS avec les noms modifiés pour refaire une AS identique)? Loïc

2 7

Fwd: Demande/Question n°129734 : Mise à jour du module R sur caparmor
by Eric Chatellier 28 Feb '12

28 Feb '12

-------- Message original -------- Sujet: Demande/Question n°129734 : Mise à jour du module R sur caparmor Date : Mon, 27 Feb 2012 16:39:55 +0100 (CET) De : assistance(a)ifremer.fr Répondre à : Tina.Odaka(a)ifremer.fr Pour : noboby(a)ifremer.fr Copie à : chatellier(a)codelutin.com, dcroizef(a)ifremer.fr Bonjour, Votre demande n°129734 concernant " Mise à jour du module R sur caparmor " a été fermée. Réponse de l'assistance : ------------------------- R/patched-2.14.1-25.1-gnu is installed. version compiled by intel is beeing studied by one of our colleague,denis. he'll let you know once it is installed. tinal Bonne journée. L'assistance informatique RIC. --------------------------------------------------------- Dear user, Your question n°129734 about " Mise à jour du module R sur caparmor " has been closed. Response : -------------- R/patched-2.14.1-25.1-gnu is installed. version compiled by intel is beeing studied by one of our colleague,denis. he'll let you know once it is installed. tinal Regards.

1 0

Impossible de modifier le TargetFactor pour un groupe dans ISIS
by Loic GASCHE 24 Feb '12

24 Feb '12

Bonjour, Comme le fait que mes TargetFactors portaient tous le même nom (null(TargetFactor)) m'empêchait de faire tourner mes AS, j'ai entrepris de les renommer. Aucun soucis pour mes groupes "sole" et "plie", mais pour mon groupe "others" la plupart du temps je ne peux pas sauvegarder mes modifications et ISIS affiche le message que j'ai mis en PJ. Quelle pourrait-être la cause de cette erreur ? Question subsidiaire : j'ai dans la liste de mes équations de TargetFactor plusieurs équations sans nom qui ne me servent à rien, est-il possible de les supprimer afin de donner un peu plus de lisibilité à ma liste ? Loïc

2 1

Re: [Isis-fish-devel] Demande/Question n°129734 : Mise à jour du module R sur caparmor
by Eric Chatellier 24 Feb '12

24 Feb '12

Bonjour, Avez vous eu le temps de traiter ce ticket ? Cordialement, Le 16/02/2012 11:18, assistance(a)ifremer.fr a écrit : > Bonjour, > > Votre demande n°129734 concernant " Mise à jour du module R sur caparmor " a bien été prise en compte. > > Nous faisons le nécessaire au plus vite. > > Bonne journée. > > --------------------------------------------------------- > Dear user, > > Your question n°129734 about " Mise à jour du module R sur caparmor " has been received. > > You will get an answer as soon as possible. > > Regards. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

1 0

MorrisClean crée un RData avec 2AS différentes ?
by Loic GASCHE 16 Feb '12

16 Feb '12

Bonjour, Après l'épopée des parenthèses de ces derniers jours, me revoilà avec encore plus de questions bizarres ! J'ai fait tourner des AS plus conséquentes pour comparer la méthode Morris avec MorrisClean, et je me retrouve avec quelque chose d'assez étrange : Pour ma première AS (Morris) j'ai bien le RData correspondant, mais pour ma seconde AS (MorrisClean) le RData contient à la fois les résultats de cette AS et ceux de l'AS précédente réalisée avec la méthode de Morris. Cela n'était pas arrivé avec mes petites AS de test de MorrisClean précédentes. Pour couronner le tout je me retrouve avec un debug de 750Mo que je n'arrive pas à ouvrir : http://upload.codelutin.com/file.php?h=R50edb0458e6dedd730679fc81f20365a Voilà... encore une fausse manip' ? Loïc -- Loïc Gasche Doctorant Unité Ecologie et Modèles pour l'Halieutique (EMH) IFREMER - Centre de Nantes

2 11

Mise à jour du module R sur caparmor
by Eric Chatellier 16 Feb '12

16 Feb '12

Bonjour, Dans le cadre de l'application IsisFish, nous allons être amenés à utiliser R sur caparmor. Nous utilisons actuellement pour cela le module déjà disponible sur caparmor: module load R/2.11.1-gnu mais la version 2.11 est un peu obsolète pour nos besoins. Serait-il possible d'ajouter un nouveau module R avec une version plus récente de R ? Idéalement R >= 2.13. Cordialement, Eric Chatellier. -- Éric Chatellier <chatellier(a)codelutin.com> Tel: 02.40.50.29.28 http://www.codelutin.com

1 0

adresse email pour la liste
by Sigrid.Lehuta＠ifremer.fr 06 Feb '12

06 Feb '12

Hello les lutins, je suis menacee d'expulsion de mon adresse mail ifremer, je souhaite donc si possible migrer les mails isis sur une autre boite. J ai voulu le faire via le site en modifiant mon compte mais j ai perdu mon mot de passe et j ai tjs pas l email de rappel (apres 4 jours). Du coup est ce que je me cree un nouveau compte ou avez vous moyen de traficoter mon ancien et de retrouver mon mot de passe? La nouvelle adresse sera sigridlehuta(a)gmail.com. Tenez moi au courant. Amities, Sigrid -- Sigrid Lehuta Post-doctorante, Institut de Recherche du Golfe du Maine, USA contact : + 1-207-228-1695 / slehuta(a)ifremer.fr / slehuta(a)gmri.org http://www.gmri.org/people/bio.asp?ID=344 Membre de l'Association Française d'Halieutique http://halieutique.agrocampus-ouest.fr/afh/index.html

3 2