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boucle métier dans les regles
by Sigrid LEHUTA 28 May '26

28 May '26

Hello, je simule avec une seule strategie sur les dizaines de ma base, et je m apercois (sur l exemple de la rule cantonnement) que la regle boucle sur tous les metiers de la DB meme s'ils sont pratiques par la strategie selectionnée. cela pourrait etre optimisé en ne bouclant que sur les metiers des strategies de la simu ? -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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Re: [Isis-fish-devel] 4.6 erreur modele age-longueur : matrice de croissance
by Stephanie MAHEVAS 22 Apr '26

22 Apr '26

Petit point sur la validation modele age-longueur 1)*l'implementation de CA et CG fonctionnent* (testé avec une popagelong avec M=0, Recrutement constant, une saison janavier avec uniquement CA et une saison fev-dec avec CG) 2)*groupe + marche* 3) *pb d'arrondi *à comprendre avec Sarah 4) *Reste à *proposer le choix de classes de longueur de tailles différentes 5) *Vérifier* que la longueur de classe n'est pas la longueur moyenne de l'age 6) *Améliorer l'interface : **Renommer coche changement de groupe —> changement de groupe d’age et changement de groupe (pour la matrice) —-> changement de groupe de longueur (renommage consistant avec pop en age et pop en long)* *Bonus : correction du bug de non forçage du isis-config-4 de forçage des isis- snapchot * Le 16/04/2026 à 15:56, Eric Chatellier a écrit : > Le 26/03/2026 à 19:02, Stephanie MAHEVAS a écrit : >> >> ** >> >> * >> >> 1. >> >> une longueur moyenne identique pour chaque groupe de longueur par >> age ie >> que la longueur moyenne calculée avec la relation age-taille ne >> doit pas >> etre utilisée dans cette interface >> >> 2. >> >> on ne peut que definir une meme largeur de classe pour toutes les >> classes- >> proposer à l’utilisateur de choisir entre une largeur identique >> ou saisir >> les largeurs pour chaque classe >> >> * > > Oui, c'est prévu, c'était un test rapide au début avec des longueurs > identiques > >> * >> >> 1. * >> >> Saisie de CA : Amélioration à faire dans la saisie : une valeur >> par défaut >> en verifiant qu’il n’y a que 1 mois dans la saison avec un coef = >> 0 par >> tout sauf pour les coef(age-long, a+1-long) quelque soit age et >> quelque >> soit long, sauf pour le age_max. Si groupe +, alors >> coef(age_max-long,age_max-long) = 1. >> >> * >> >> ** >> >> Fevrier 0 : en zone test1, le coef de CA s’applique sur le groupe 0-0 >> mais les individus ne passent pas en 0-1 >> >> * > > Ici, je ne comprend pas. > > La matrice de changement de groupe de "février-decembre" est une > matrice "diagonale" avec les valeurs "0.5, 0.5, 0.5, 0.4, 0.4, 0.4, > 0.3, 0.3, 0.3" > > Donc 1000.0 * 0.5 ca fait bien 500.0 mais comme c'est en diagonal sur > le groupe 0-0/0-0, ca me parait cohérent que cela reste dans le groupe > "0-0" au final. > > > Cela serait peut etre plus facile de faire cela en visio si tu as un > moment. > -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditerranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Mar '26

31 Mar '26

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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4.6 erreur modele age-longueur : matrice de croissance
by Stephanie MAHEVAS 25 Feb '26

25 Feb '26

il n'est pas possible d'ajouter une matrice de croissance (changement de groupe) dans l'interface croissance l'interface pop age/long est la meme que pop en age, alors qu'on devrait avoir celle de pop en longueur -- ex pour la pop en longueur ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditérranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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V4.6 : choix entre strategyMonthInfo et Fleet dynamic
by Sigrid LEHUTA 27 Jan '26

27 Jan '26

Hello je m'interroge sur la manière dont s'articulent les 2 onglets strategyMonthInfo et Fleet dynamic. Est ce que remplir Fleet dynamic bloque l'utilisation de la matrice de proportion par métier de l onglet strategyMonthInfo ? J ai essayé de récupérer la valeur de la matrice dans l’équation d attractivité et ça ne marche pas. Quand est ce que l'une est utilisée et pas l'autre ? Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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V4.6 calcul effort proportion
by Sigrid LEHUTA 27 Jan '26

27 Jan '26

re re moi Je ne m'explique pas du tout un resultat de calcul d'ISIS en V4.6. j utilise l interface fleet dynamic et la 1ere année, je force les proposrtions d'effort à 0.5 pour chacun des 2 métiers de la stratégie (le log en remoigne). Malgré cela, l'effort n est pas identique sur les 2 métiers (proportion effectives0.511833876591037 et 0.4881661234089631). Ca fait bcp pour un arrondi ... Une idee de ce qui peut causer cela ? Merci -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins :https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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V4.6 sauvegarde des equations de "strategyVariables"
by Sigrid LEHUTA 27 Jan '26

27 Jan '26

hello dans l interface fleet dynamic, le bouton "sauver" ne se degrise que quand on change les equations attractivité et effort proportion, et pas les strategyVariables. meme si je modifie attractivité en ajourtant des espace te que je sauve mes modifs sont parfois perdues (mais pas toujours). Peut on améliorer ? Merci -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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API pour l'objet StrategyVariable
by Sigrid LEHUTA 26 Jan '26

26 Jan '26

Hello 2 questions au sujet de d'un nouvel objet de la V4.6 : StrategyVariable. Je n ai pas acces a l'API pour la liste des methodes. il y a evaluate(met) et getCoefficient(met). Y a t'il aussi getName() ? A partir de la list des StrategyVariable recupérées avecstrategy.getVariables() peut on extraire une variable en particulier via son nom ou faut il passer par une boucle et un if getName().equals("toto") ? Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins :https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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4.6 question computeMonth
by Stephanie MAHEVAS 26 Jan '26

26 Jan '26

Je ne retrouve pas le contenu de computeMonth() dans defaultSimulator qui s'appelle maintenant computeMonthExtra public void computeMonthExtra(TimeStep step, Population pop, MatrixND N) throws TopiaException, IsisFishException { getSiMatrixToCall(pop).computeMonthExtra(step, pop, N); cette methode est bien définie dans SiMatrix L141 mais sans code Eric, tu peux me dire où je peux retrouver le code ? merci Steph -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS https://annuaire.ifremer.fr/cv/16343/ UMR MARBEC (MARine Biodiversity, Exploitation & Conservation) IRD, IFREMER, CNRS, Univ Montpellier IFREMER/LMH (Laboratoire Méditérranée Halieutique) Station Ifremer, avenue Jean Monnet, CS 30171, 34203 Sète cedex Tel: (33) 4 99 57 32 39 - 06 75 83 59 33 Salle de réunion personnelle ZOOM https://umontpellier-fr.zoom.us/j/8237835263?pwd=Y6VOgaGKn9c54T9i4c6bKmQ52M… o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Accès aux "observations" dans une equation
by Sigrid LEHUTA 26 Jan '26

26 Jan '26

Hello Je voudrais avoir accès à l'entité "observation" dans une equation qui a comme paramètre le simulationContext (et un objet strategy et metier). Puis je faire List<Observation> obs = context.getDB().getObservations(); je ne vais pas les modifier juste les lire. Merci ! -- /!\ Boite mail saturée (en cours de nettoyage laborieux) Pour ma santé mentale et l'environnement, merci d'éviter les pièces jointes au maximum. -- Sigrid LEHUTA ><> __/\__ ~ ><> ~ \____/ ~ Fisheries modeller IFREMER - HALGO-EMH Ecology and modeling for fisheries science DECOD Dynamics and sustainability of ecosystems: from source to sea AFH Association Française d'Halieutique (AFH) Centre Atlantique - Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 03 Tel. : 02 40 37 42 38 (8238) Participez à l'ENQUETE Réduction des captures de dauphins : https://http-proxy.cloud.codelutin.com/enquete_delmoges https://peche.ifremer.fr/Le-role-de-l-Ifremer/Recherche/Projets/Description… https://www.francefilierepeche.fr/projets/gemmbe/ https://delmoges.recherche.univ-lr.fr/presentation-du-projet/ https://www.ices.dk/advice/ESD/Pages/Bay-of-Biscay-and-the-Iberian-Coast_La… https://halgo.ifremer.fr/en https://www.umr-decod.fr/en https://www.association-francaise-halieutique.fr/

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