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Question Caparmor pour le lancement de nombreuses simulations
by Benjamin POUSSIN 07 Jul '08

07 Jul '08

Bonjour Tina, J'ai une petite question, que preferes-tu ? Ou plutot quelle est la meilleur chose pour Caparmor. J'ai 1000 simulations a faire, il vaut mieux: - ajouter dans les travaux de caparmor 1000 simulations prenant 1 CPU a chaque fois - ajouter dans les travaux de caparmor une seule tache qui va prendre 20, 40 ou 60 processeurs le temps qu'il faut pour faire les 1000 simulations ? Pour le 1er cas, je m'appuie entierement sur l'ordonnanceur de caparmor. Dans le 2eme j'ai un peu plus de travail, donc avant de faire des choses inutiles je prefere demander ce qui est le mieux. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Re: [Isis-fish-devel] Nouveau site web tout en wiki
by Stephanie.Mahevas＠ifremer.fr 27 Jun '08

27 Jun '08

----- Message transféré de smahevas(a)ifremer.fr ----- Date : Thu, 26 Jun 2008 15:21:11 +0200 De : smahevas(a)ifremer.fr Répondre à : smahevas(a)ifremer.fr Sujet : Re: [Isis-fish-devel] Nouveau site web tout en wiki À : Benjamin POUSSIN <poussin(a)codelutin.com> Salut ca me semble pas mal du tout! On pourra toujours voir à prendre un stagaire pour travailler le design. juste 2 points lancer : ca fait un peu à la poubelle, je proposerais plutôt "Executer Isis-Fish" (avec un petit drapeau blanc :-) ) dernière version : je mettrais "ISIS-Fish" à la place reste à le remplir.... stephanie Benjamin POUSSIN <poussin(a)codelutin.com> a écrit : > Salut, > > J'ai mis en place le nouveau site tout en wiki, mais j'ai pas encore > mis le contenu. > > Vous pouvez y jeter un oeil et me dire si le look et l'arborescence > vous convient. > > http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… > > -- > Benjamin > -------------------- > tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 > email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii > http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii > _______________________________________________ > Isis-fish-devel mailing list > Isis-fish-devel(a)lists.labs.libre-entreprise.org > http://lists.labs.libre-entreprise.org/mailman/listinfo/isis-fish-devel > > ----- Fin du message transféré -----

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Nouveau site web tout en wiki
by Benjamin POUSSIN 25 Jun '08

25 Jun '08

Salut, J'ai mis en place le nouveau site tout en wiki, mais j'ai pas encore mis le contenu. Vous pouvez y jeter un oeil et me dire si le look et l'arborescence vous convient. http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/wiki-moin/instance/cgi-bin/moin.… -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Resultat 1er test sur caparmor
by Benjamin POUSSIN 26 May '08

26 May '08

Salut, L'utilisation est simple (on est sur un linux). Et lorsqu'on est a l'ifremer pour aller sur la machine il suffit de faire ssh caparmor.ifremer.fr Les temps de simulation sont equivalent au temps des machines de bureau actuelles puisque de toute facon il s'agit simplement de Xeon 3Ghz. Le seul interet est donc le nombre de CPU utilisable en meme temps (64 simulations en meme temps maximum pour l'instant) Les premiers tests de parallelisation du code de simulation n'est pas vraiment concluant (pas de meilleurs performance avec le risque de deadlock ou autre). Par contre j'ai aussi teste sur caparmor les differents jdk: - 1.6_06(stable) i586 (32bits): temps de simulation 120 - 1.6_06(stable) x64 (64bits): temps de simulation 240 - 1.6_10(beta) i586 (32bits): temps de simulation 100 On voit donc que le passage en 64 est vraiment une mauvaise chose (ce qui n'est pas vraiment intuitif au depart). Par contre la nouvelle version du jdk ameliore de 20% environs les performances. (cette version en fait apporte pas mal de chose qui viennent de la version 1.7 (openJDK) -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Site Web
by Stephanie MAHEVAS 07 Apr '08

07 Apr '08

Bonjour en faisant une mise à jour du site web ISIS côté Ifremer pour avoir un miroir du site Isis coté code-lutin (histoire d'harmoniser les supports pour les utilisateurs :-) ) nous nous sommes apercus que les liens : Wiki et Trackers du site code-lutin ne fonctionnaient pas. Pouvez-vous les remettre à jour et renvoyer à Olivier Berthele (adresse ci-dessus) les adresses? Merci. Bonne journée Stéphanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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Utilisation de la librairie commandline0.2
by Tony Chemit 19 Mar '08

19 Mar '08

Hello, Isis-Fish utilise désormais la librairie commandline 0.2 (et commandline-ui 0.2). L'évolution majeure est de permettre la génération du code sans dépendance directe au projet. Un effort a aussi été apporté sur le processus d'initialisation. Certaines adaptations sont encore à faire dans Isis pour utiliser pleinement commandline 0.2 Tony. PS: on passe au plugin de generation maven-commandline-plugin:0.3

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V3.1.2 : connexion par défaut en tant qu'anonyme
by Sigrid LEHUTA 07 Mar '08

07 Mar '08

Salut tout le monde, Je viens d installer la nouvelle version et je n ai pas eu la fenêtre qui m'aurait permis de m inscrire en tant que "sigrid". Par defaut je suis donc "anonyme" :'( et je ne peux pas commiter des choses sur le serveur (et y mettre un peu le bazar ;-) ) Comment puis je changer mon statut maintenant ?? Merci d avance Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Doctorante Département Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMER, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 Tél : +33 (0)2 40 37 81 65

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wiki: impossible d'importer des images
by Sigrid LEHUTA 07 Mar '08

07 Mar '08

Bonjour à tous, j ai besoin d un peu d aide pour l'aide d ISIS !!! j'ai voulu agrémenter le wiki de quelques illustrations. malheureusement, quelque soit l'image et le format que je tente de charger j ai le message d'erreur suivant : "Le contenu envoyé ne correspond pas à l'extension du fichier .png." :-\ Est ce que quelqu un saurait pourquoi ? en pj le fichier en question merci d avance Sigrid -- Sigrid LEHUTA ~ ><> ~ Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03

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un truc bizarre
by Hilaire DROUINEAU 26 Feb '08

26 Feb '08

Salut Benjamin (et tout le monde), Y a un truc que je trouve bizarre (ça faisait longtemps et puis fallait bien que je me fasse remarquer avant de partir!) dans la fonction computeMonth de DefaultSimulator. Il est écrit pour le changement de classe: // group change MatrixND CA = null; if (date.getDate() == 0) { CA = MatrixFactory.getInstance().matrixId(pop.sizePopulationGroup()*pop.sizePopulationZone()); } else { CA = info.getGroupChangeMatrix(month); } log.debug("CA: " + CA); Je comprends pas trop la dimension de la matrice CA au premier pas de temps (pop.sizePopulationGroup()*pop.sizePopulationZone()). Pour moi elle devrait être sizePopulationGroup()*sizePopulationGroup() ... (à la limite sizePopulationGroup()*sizePopulationGroup()*pop.sizePopulationZone() si on a une matrice spatialisée mais vue que de toute façon ils grandissent pas au premier pas de temps). Cela dit ça a l'air de marcher donc... Autre petite question: comment sont structurées les matrices de migration, immigration et émigration? elles sont apparemment en 2d alors que je pensais qu'elles étaient en trois (zone*zone*group) sauf émigration qui doit etre (zone*group). A+ Hilaire -- Hilaire Drouineau IFREMER, département EMH Centre de Nantes rue de l'ile d'Yeu - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 3 tel : +33 (0)2 40 37 42 12 - fax : +33 (0)2 40 37 40 75 email : hilaire.drouineau(a)ifremer.fr - web : http://www.ifremer.fr/emh **********************************************************************

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modificaion de isis-config pour la V3.1.2
by Stephanie MAHEVAS 26 Feb '08

26 Feb '08

Bonjour Isis 3.1.2 n'en fait qu'a sa tete : lorsque je modifie le chemin de la base isis-database-3 dans le fichier .isis-config-3, la modif n'est pas prise en compte et apres lancement d'isis, le .isis-config-3 a toujours le chemin par defaut... :-( Benjamin tu peux voir ca? merci steph ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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