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Re: Petit pb
by Dominique PELLETIER 01 Mar '05

01 Mar '05

Salut STéphanie et Paul J'ai le meme problème. Peut-être Benjamin peut-il nous renseigner ? A plus Dominique PS: désolée pour le retard, j'avais un pb de mail Stephanie MAHEVAS a écrit: > Salut, > > ok pour moi. > > sinon je n'ai pas reussi a utiliser la V2 d'ISIS. L'interface avec les > boutons se lance bien mais aucun des boutons ne fonctionne. > Est-ce que la version V2 qui se trouve sur logiciel/ISIS-FISH est bonne? > Si oui, arrives-tu a la lancer et a ouvrir par exemple l'interface de > saisie? > Pour l'instant j'ai resaisi sur la V1.5 et exporte au fur et a mesure > les objets. > > merci > steph > > Dominique PELLETIER a écrit: > >> Bonjour, >> >> Les 3 et 4, je suis en réunion dans mon bureau. >> Je peux libérer un peu de temps en début de matinée jeudi. Est-ce que >> 9h-9h15 vous va ? >> >> Dominique >> >> >> Jean-Christophe Soulie a écrit: >> >>> Salut à tous, >>> >>> Je réponds par mail car je ne suis pas à la fac pour très >>> longtemps... A cause d'une grippe carabinée qui m'a cloué au fond du >>> lit depuis vendredi et je viens juste de mettre le nez dehors... >>> >>> En ce qui me concerne, le 1er après-midi je suis en cours. Donc je >>> préfèrerai plutôt le jeudi 3 où je suis libre toute la journée (sauf >>> une petite réunion d'équipe à 14h00). >>> >>> Stéphane, peux-tu confirmer un horaire pour toi ? >>> >>> A+ >>> >>> JC ("ballade") >>> >> >> > > -- Dominique Pelletier Laboratoire MAERHA IFREMER BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 FRANCE E-mail: dpellet(a)ifremer.fr Tel: 33 2 40374164 Fax: 33 2 40374075 http://www.ifremer.fr/maerha/

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test du simulateur
by Benjamin POUSSIN 08 Feb '05

08 Feb '05

Salut, J'ai corrigé le bug sur l'effort (facteur std). C'etait du aux optimisations, il pensait qu'il ne devait pas refaire le calcule, alors je lui ai gentillement expliqué qu'il se trompait :) donc maintenant: effortPerZonePop: strategy=Langoustine moyen metier=métier benth simp date=0 zonePop=zone L2 result: 17.310294529619053 effortPerZonePop: strategy=Langoustine moyen metier=métier benth jum date=0 zonePop=zone L2 result: 24.06130939617049 -- Benjamin -------------------- email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Comment on peut faire ?
by Dominique PELLETIER 16 Dec '04

16 Dec '04

Bonjour Benjamin, Nous te proposons les choses suivantes : -recettage du lot 2 dès que tu veux, soit 16,17,21,ou 22 décembre -avais-tu fini de coder le modele de gravité (fait partie du lot 2)? C'est une chose que tu peux faire en attendant qu'on se reunisse. -Pour le lot 3, je n'ai pas eu de reponse de la part des economistes quant à l'élaboration d'un cahier des charges. Nous nous acheminons donc vers un changement de portage, pour utiliser cet argent afin de faire des modifs autres sur ISIS. -il faut aussi faire un planning pour janvier-février. Nous allons te téléphoner pour discuter un peu de tout celà. A tout à l'heure DOminique Dominique Pelletier Laboratoire MAERHA IFREMER BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 FRANCE E-mail: dpellet(a)ifremer.fr Tel: 33 2 40374164 Fax: 33 2 40374075 http://www.ifremer.fr/maerha/

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Reproduction
by Stephanie MAHEVAS 26 Oct '04

26 Oct '04

Bonjour Benjamin, je regarde avec Hilaire comment ecrire notre equation dans la fenetre equation de reproduction. Je ne comprends pas pourquoi on n'a pas acces aux objets et méthodes dont on aurait besoin (pas de temps de debut de reproduction de l'annee courante, pas de temps courant, effectifs par classe). Hilaire m'a fait suivre vos echanges par mail dont j'avais eu echo par telephone cet ete mais je ne m'etais pas rendu compte du vide que cela entrainait. 1/ Il faut absolument que l'on puisse ecrire une relation stock-repro en ayant acces aux effectifs courants et aux effectifs anterieurs a cette date par classe d'age. Voici l'equation que nous souhaitons ecrire et sur laquelle nous bloquons Notations: t1=pas de temps de debut de reproduction de l'annee courante t=pas de temps courant i=numero du mois courant de la periode de reproduction z=zone (des zones de reproduction) S(t) = somme_{age >= age mature et z dans zone de reproduction}(effectif(t,a,z)*poids(a)) S=constante fixee R=constante fixee Equation: A chaque pas de temps t de la periode de reproduction S(t1) = somme_{age >= age mature et z dans zone de reproduction}(effectif(t1,age,z)*Poids(a)) si S(t1) < S alors Nboeufs(t,z) = somme_{age >= age mature}(fecondite(a)*effectif(t,a,z)*Poids(a)) sinon Nboeufs(t,z) = Prepro(i)*(R/(nbzonerepro*nbclasses)) 2/Il faut absolument que l'on connaisse la dimension des variables dans l'equation car on n'a uniquement effectif ou fecondite et on ne sait pas si le calcul se fait par zone, age. Voila. C'est assez urgent. Peux-tu nous proposer une solution rapidement? merci stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/MAERHA Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 (Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques et Aquacoles) rue de l'île d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 http://www.ifremer.fr/maerha o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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CR
by Stephanie MAHEVAS 23 Feb '04

23 Feb '04

voici le CR de la reunion test d'ISIS. A+ stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/MAERHA Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 (Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques et Aquacoles) rue de l'île d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 http://www.ifremer.fr/maerha o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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réunion de Lundi
by Dominique PELLETIER 30 Jan '04

30 Jan '04

Bonjour, Comme on en avait évoqué le risque qd on s'étaient vus, on nous a imposé une réunion à la noix lundi apres-midi. Je pourrai donc bosser lundi matin jusqu'à 11H50 Stéphanie pourra surement rester un peu plus longtemps (-> 13H?) A lundi, Dominique -- Dominique Pelletier Laboratoire MAERHA IFREMER BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 FRANCE E-mail: dpellet(a)ifremer.fr Tel: 33 2 40374164 Fax: 33 2 40374075 http://www.ifremer.fr/maerha/

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Re: [Isis-fish-devel] Listes des modifications
by Benjamin POUSSIN 28 Jan '04

28 Jan '04

On Tue, 27 Jan 2004 16:25:05 +0100 Dominique PELLETIER <Dominique.Pelletier(a)ifremer.fr> wrote: > Cà te convient ma réponse de ce matin sinon ? Bah, je sais pas je vais expliquer ce que je vais faire: l'âge des poissons reste partout en année, sauf lorsqu'on l'utilise dans les équations. L'âge dans les équations est passée en mois en multipliant l'âge par 12. Ceci permet de réutiliser les mêmes équations de croissance pour la simulation, et pour la création des classes en longueur avec l'équation de croissance. Donc pour l'utilisateur il n'y a pas de changement, il voit et saisie les classes en année. Pour les équations on est en mois, on perd donc mois de précision en multipliant par 12 qu'en divisant par 12. voila, l'autre solution consistait a laisser les équations en année et donc lorsque l'on souhaitait ajouté un mois à l'âge du poisson pour des calculs on ajoutait en fait 1/12 à l'âge. -- Benjamin -------------------- email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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Listes des modifications
by Benjamin POUSSIN 27 Jan '04

27 Jan '04

Salut, une question en premier, car moi aussi j'ai une petite tete ;) - j'ai ecrit mettre les fonctions de croissance en mois et on en annee, vous etes bien d'accord avec ca ? voici la liste que vous m'avez demandée: * Dans l'édition de la config choix de l'affichage des tooltips * correction du bug qui sauvegardait des saisons chevauchées * lorsque l'on change les dimensions de la saison, la taille de la matrice change lors de la sauvegarde) * pour la saison: dans le tableau de reproduction, les titres sont les mois de la saison * pour recrutement: dans le tableau mettre les titres sont 1er mois, 2eme mois, 3eme mois, ... * dans immigration: secteur d'arrivé ajout d'un apostrophe * dans engin: cahngement du texte Paramètre de Gamme possible -> valeurs possibles du paramètre * dans metier: correction bug avec le type du paramètre controlable * dans engin: suppression Param Continu et Quantifiable. * Pour les valeurs continues le paramètre accepte les - (5-12) pour les autres des ; (12;15;17;90) * dans strategie: suppression du bouton 'Terminer' * dans pop: passage des ages en valeur entiere et non en float (2.0 -> 2) * ajout d'un link entre region et secteur * ajout de l'upgrade automatique des données de la base * ajout de l'upgrade automatique des données xml * ajout de l'upgrade automatique de mckoi * Simplifier le DBtoXML et XMLtoDB * plus besoin de faire un unquote apres la lecture XML * correction du probleme dans le XML avec les relation n * seul les secteurs simples sont visible dans la liste des zones de la region * suppression des méthodes d'export des factories, on utilise maintenant tout le temps celle utilisant DBDescription * support pour l'upgrade automatique des résulats * suppression de Cle/taille age, maintenant qu'il y a inverse croissance * ajout d'un lien de MetaPop vers Pop * ajout d'un methode PopulationFactory.findAllByRegion * modification de toutes les utilisations de methodes depreciees * ajout support des commentaires dans les equations * refactoring de la gestion des equations (les equations sont directement conserve dans les objets) * les équations sont maintenant conservées sont forme XML dans la base * copyright plus dans l'image mais ecrit apres * ajout du support de Ln dans les equations * ajout d'équation prédéfinies * ajout d'un lien de region vers (Maille, MetaPopulation, Strategie) * creation de classe pour la verification de la coherence des infos de la base * ajout d'un bouton permettant de verifier si la saisie d'une region contient des erreurs * fenetre de modification/suppression des formules * correction du bug lors de la sélection d'une ancien simulation les effectifs restait sur les anciens * les resultats de la verification est visualisé dans une table * ajout du tri sur les resultats de la verification * correction bug de lancement et sauvegarde de simulation du a l'auto upgrade de la base * Amélioration de la présentation de la liste des objects à effacer, lors de l'effacement d'un objet * remplacement de Classepopulation.longueur en longeurMin et longueurMax * remplisage de la matrice de changement de classe pour le modele en longueur. * ajout des dernieres equations * correction du bug dans MatriceChage qui ne tennait pas compte du group plus -- Benjamin -------------------- email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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CR 19/12/03
by Stephanie MAHEVAS 20 Jan '04

20 Jan '04

-- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/MAERHA Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 (Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques et Aquacoles) rue de l'île d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 http://www.ifremer.fr/maerha o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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[Fwd: Re: [Isis-fish-devel] un petit retour sur le model en longueur et la matrice de changement de classe]
by Stephanie MAHEVAS 20 Jan '04

20 Jan '04

-------- Message d'origine -------- Sujet: Re: [Isis-fish-devel] un petit retour sur le model en longueur et la matrice de changement de classe Date: Fri, 16 Jan 2004 09:18:13 +0100 De: Stephanie MAHEVAS <Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr> Société: IFREMER CC: isis-fish-devel(a)lists.labs.libre-entreprise.org Références: <20040115160315.2c0a0f42.poussin(a)codelutin.com> Bonjour je te propose de me rappeler pour ce qui est de la 3eme question. sinon question 1, reponse: pour la matrice de changement de classe, celle que l'on fait calculer automatiquement ou que plus tard l'utilisateur pourra saisir manuellement (notee CC dans le compte-rendu du 19/12/04) ne correspond pas en effet a la matrice CA de l'ecriture matricielle du modele. CC de taille nbclasse*nbclasse, permet de remplir CA. CA est une matrice par blocs (avec nbclasse*nbclasse blocs de taille nbSecteur*nbSecteur). Lorsque l'on a une dynamique en age les blocs ne peuvent etre que la matrice identite (I) ou la matrice nulle (0) de taille nbSecteur*nbSecteur. Lorsque l'on a une dynamique en longueur, les blocs ne peuvent etre que la matrice identite (I*constante) ou la matrice nulle (0) de taille nbSecteur*nbSecteur. Les blocs non nuls sont sur la partie triangulaire supérieure. La diagonale reste identique a celle pour la dynamique en age en distinguant les 2 cas, groupe + ou pas groupe +. Le bloc i,j de CA est egal a la matrice I*CC(i,j) de taille nbSecteur*nbSecteur (CC(i,j) l'element de la matrice CC en positin (i,j)). question 2, reponse 2 oui a+ stephanie ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/MAERHA Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 (Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques et Aquacoles) rue de l'île d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 http://www.ifremer.fr/maerha o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/MAERHA Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 (Mathématiques Appliquées à l'Evaluation des Ressources Halieutiques et Aquacoles) rue de l'île d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 http://www.ifremer.fr/maerha o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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