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[Isis-fish-user] (sans objet)
by chirine HUSSEIN 28 Jun '07

28 Jun '07

Bonjour à tous, Nous avons toujours un certain nombre de problèmes en ce qui concerne notre règle de gestion que nous souhaitons implémenter, qui est la suivante : fermeture de tous les types de pêche dans une zone donnée (voire 2 ou plus). 1.- Suite à la réponse de Sigrid, nous avons essayé la possibilité qu’elle suggérait de ne sélectionner aucun engin de la liste déroulant de cantonnement. Nous avons essayé mais ça ne marche pas, la simulation s’arrête à janvier de l’année 0. 2- Nous avons allons essayé sa 2ème suggestion : « Si votre cantonnement concerne plusieurs engins (mais pas tous), ajoutez la règle autant de fois que nécessaire en changeant le paramètre ». Résultat : ça a bien tourné pour l’interdiction d’un engin et deux engins en même temps, mais pour l’interdiction de trois engins et plus ça n’a pas marché (la simulation s’arrête à janvier de l’année 0). 3- pour les deux cas où on a put obtenir des résultats (interdiction d’un engin et deux engins en même temps), ça a néanmoins été très fastidieux car les simulations n’aboutissent qu’environ 1 fois sur 10 ! Pour un même codage parfois ça se bloque à janvier de l’année 0 ou à décembre de l’année 0, et parfois ça marche « miraculeusement ». Nous souhaiterions savoir, si l’on vous envoie notre base de donnée, est ce que quelqu’un pourrait lancer la même simulation pour voir si il a les mêmes problèmes. ? Est ce que ça ne serait pas lié au passage de la version 2 à 3 ?. Autre point : dans le résumé des résultats, à quoi correspond exactement la valeur de abondance .java, car on obtient des valeurs d’ordre de grandeur très différent de la matrice d’abondance ? Merci pour votre aide précieuse Marion et Chirine _____________________________________________________________________________ Ne gardez plus qu'une seule adresse mail ! Copiez vos mails vers Yahoo! Mail

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[Isis-fish-user] Lancer Isis depuis le porte document sous windows
by Sigrid LEHUTA 22 Jun '07

22 Jun '07

Bonjour, Si vous souhaitez lancer ISIS depuis le porte document (c est à dire que le .bat est dans le porte document), il faut modifier le fichier .bat en ajoutant après ": start" la ligne de commande indiquant le chemin de localisation du .bat. par ex : : start C: cd "C:/Documents and Settings/Smahevas/Isis-..." java ... -- Sigrid LEHUTA stagiaire Master 2 Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 if not "%1" == "debug" goto start Set DEBUG="-server -Xdebug -Xnoagent -Djava.compiler=NONE -Xrunjdwp:transport=dt_socket,address=38000,server=y,suspend=n" shift :start c: cd "C:\Documents and Settings\smahevas\Bureau\PorteDoc\Isis_v3\isis-fish-3.0.19" java -Xmx512m -Xms256m -cp isis-fish-3.0.19.jar;lib/activation-1.0.2.jar;lib/ant-1.5.4.jar;lib/antlr-2.7.2.jar;lib/ant-optional-1.5.1.jar;lib/asm-1.5.4-snapshot.jar;lib/asm-attrs-1.5.4-snapshot.jar;lib/asm-util-1.5.4-snapshot.jar;lib/aspectwerkz-2.0.jar;lib/aspectwerkz-core-2.0.jar;lib/aspectwerkz-jdk5-2.0.jar;lib/avalon-framework-4.1.3.jar;lib/Blas-20060531.jar;lib/bsh-2.0b1.jar;lib/cglib-2.1_3.jar;lib/colt-1.1.0.0.jar;lib/commons-attributes-api-2.1.jar;lib/commons-beanutils-1.4.jar;lib/commons-beanutils-core-1.7.0.jar;lib/commons-codec-1.2.jar;lib/commons-collections-3.1.jar;lib/commons-dbcp-1.2.1.jar;lib/commons-discovery-0.2.jar;lib/commons-httpclient-3.0.jar;lib/commons-jxpath-1.2.jar;lib/commons-lang-2.1.jar;lib/commons-logging-1.1.jar;lib/commons-math-1.1.jar;lib/commons-pool-1.2.jar;lib/commons-primitives-1.0.jar;lib/cvsclient-20051129.jar;lib/dom4j-1.6.1.jar;lib/ehcache-1.2.1RC.jar;lib/h2-1.0.20070304.jar;lib/hibernate-3.2-patchevent.jar;lib/icu4j-2.6.1.jar;lib/interpreter-1.6.8.jar;lib/j2h-1.3.1.jar;lib/j2ssh-common-0.2.2.jar;lib/j2ssh-core-0.2.2.jar;lib/jaxen-1.1-beta-8.jar;lib/jaxx-runtime-1.0.3-beta2.jar;lib/jaxx-swing-1.0.3-beta2.jar;lib/jcommon-0.7.0.jar;lib/jdic-20061102.jar;lib/jdic_stub-linux-20061102.jar;lib/jdom-1.0.jar;lib/jfreechart-0.9.3.jar;lib/JRclient-RF503.jar;lib/jrexx-1.1.1.jar;lib/JRI-0.2-4-cl.jar;lib/jta-1.0.1B.jar;lib/junit-3.8.1.jar;lib/l2fprod-common-0.1.jar;lib/language-1.6.7.jar;lib/log4j-1.2.12.jar;lib/logger-1.6.4.jar;lib/logkit-1.0.1.jar;lib/looks-1.2.2.jar;lib/lucene-core-2.0.0.jar;lib/lutingenerator-0.50.jar;lib/lutinj2r-0.1.jar;lib/lutinmatrix-0.15.jar;lib/lutinutil-0.25.jar;lib/lutinutilextra-0.1.jar;lib/lutinwidget-0.9.jar;lib/lutinxml-0.7.jar;lib/mail-1.3.3.jar;lib/openmap-4.6.jar;lib/optimization-20060613.jar;lib/org.mortbay.jetty-5.1.10.jar;lib/qdox-1.4.jar;lib/sdoc-0.4.jar;lib/servlet-api-2.3.jar;lib/spring-beans-2.0.1.jar;lib/spring-core-2.0.1.jar;lib/ssj-2.0.jar;lib/stax-api-1.0.1.jar;lib/stax-utils-20040917.jar;lib/swixat-0.6.0-cl-20070305.jar;lib/swixml-1.5-144-cl-20050912.jar;lib/tagsoup-0.9.7.jar;lib/topia-2.0.24.jar;lib/topia-service-0.7.jar;lib/trove-1.0.2.jar;lib/ws-commons-util-1.0.1.jar;lib/wsdl4j-1.5.2.jar;lib/wstx-asl-3.0.1.jar;lib/xalan-2.7.0.jar;lib/xerces-1.2.3.jar;lib/xercesImpl-2.0.2.jar;lib/xfire-aegis-1.2.2.jar;lib/xfire-annotations-1.2.2.jar;lib/xfire-core-1.2.2.jar;lib/xfire-java5-1.2.2.jar;lib/xfire-jsr181-api-1.0-M1.jar;lib/xml-apis-1.0.b2.jar;lib/xmlParserAPIs-2.6.2.jar;lib/xmlrpc-2.0.jar;lib/xmlrpc-client-3.0.jar;lib/xmlrpc-common-3.0.jar;lib/xmlrpc-server-3.0.jar;lib/XmlSchema-1.1.jar;lib/xom-1.0b3.jar %DEBUG% fr.ifremer.isisfish.IsisFish %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > error.txt 2>&1

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[Isis-fish-user] Lancer ISIS depuis un porte-document sous windows
by Sigrid LEHUTA 22 Jun '07

22 Jun '07

Bonjour, Si vous souhaitez lancer ISIS depuis le porte document (c est à dire que le .bat est dans le porte document), il faut modifier le fichier .bat en ajoutant après ": start" la ligne de commande indiquant le chemin de localisation du .bat. par ex : : start C: cd "C:/Documents and Settings/Smahevas/Isis-..." java ... -- Sigrid LEHUTA stagiaire Master 2 Ecologie et Modèles pour l'Halieutique IFREMer, rue de l'ile d'Yeu BP 21105 44311 Nantes Cedex 03 if not "%1" == "debug" goto start Set DEBUG="-server -Xdebug -Xnoagent -Djava.compiler=NONE -Xrunjdwp:transport=dt_socket,address=38000,server=y,suspend=n" shift :start c: cd "C:\Documents and Settings\smahevas\Bureau\PorteDoc\Isis_v3\isis-fish-3.0.19" java -Xmx512m -Xms256m -cp isis-fish-3.0.19.jar;lib/activation-1.0.2.jar;lib/ant-1.5.4.jar;lib/antlr-2.7.2.jar;lib/ant-optional-1.5.1.jar;lib/asm-1.5.4-snapshot.jar;lib/asm-attrs-1.5.4-snapshot.jar;lib/asm-util-1.5.4-snapshot.jar;lib/aspectwerkz-2.0.jar;lib/aspectwerkz-core-2.0.jar;lib/aspectwerkz-jdk5-2.0.jar;lib/avalon-framework-4.1.3.jar;lib/Blas-20060531.jar;lib/bsh-2.0b1.jar;lib/cglib-2.1_3.jar;lib/colt-1.1.0.0.jar;lib/commons-attributes-api-2.1.jar;lib/commons-beanutils-1.4.jar;lib/commons-beanutils-core-1.7.0.jar;lib/commons-codec-1.2.jar;lib/commons-collections-3.1.jar;lib/commons-dbcp-1.2.1.jar;lib/commons-discovery-0.2.jar;lib/commons-httpclient-3.0.jar;lib/commons-jxpath-1.2.jar;lib/commons-lang-2.1.jar;lib/commons-logging-1.1.jar;lib/commons-math-1.1.jar;lib/commons-pool-1.2.jar;lib/commons-primitives-1.0.jar;lib/cvsclient-20051129.jar;lib/dom4j-1.6.1.jar;lib/ehcache-1.2.1RC.jar;lib/h2-1.0.20070304.jar;lib/hibernate-3.2-patchevent.jar;lib/icu4j-2.6.1.jar;lib/interpreter-1.6.8.jar;lib/j2h-1.3.1.jar;lib/j2ssh-common-0.2.2.jar;lib/j2ssh-core-0.2.2.jar;lib/jaxen-1.1-beta-8.jar;lib/jaxx-runtime-1.0.3-beta2.jar;lib/jaxx-swing-1.0.3-beta2.jar;lib/jcommon-0.7.0.jar;lib/jdic-20061102.jar;lib/jdic_stub-linux-20061102.jar;lib/jdom-1.0.jar;lib/jfreechart-0.9.3.jar;lib/JRclient-RF503.jar;lib/jrexx-1.1.1.jar;lib/JRI-0.2-4-cl.jar;lib/jta-1.0.1B.jar;lib/junit-3.8.1.jar;lib/l2fprod-common-0.1.jar;lib/language-1.6.7.jar;lib/log4j-1.2.12.jar;lib/logger-1.6.4.jar;lib/logkit-1.0.1.jar;lib/looks-1.2.2.jar;lib/lucene-core-2.0.0.jar;lib/lutingenerator-0.50.jar;lib/lutinj2r-0.1.jar;lib/lutinmatrix-0.15.jar;lib/lutinutil-0.25.jar;lib/lutinutilextra-0.1.jar;lib/lutinwidget-0.9.jar;lib/lutinxml-0.7.jar;lib/mail-1.3.3.jar;lib/openmap-4.6.jar;lib/optimization-20060613.jar;lib/org.mortbay.jetty-5.1.10.jar;lib/qdox-1.4.jar;lib/sdoc-0.4.jar;lib/servlet-api-2.3.jar;lib/spring-beans-2.0.1.jar;lib/spring-core-2.0.1.jar;lib/ssj-2.0.jar;lib/stax-api-1.0.1.jar;lib/stax-utils-20040917.jar;lib/swixat-0.6.0-cl-20070305.jar;lib/swixml-1.5-144-cl-20050912.jar;lib/tagsoup-0.9.7.jar;lib/topia-2.0.24.jar;lib/topia-service-0.7.jar;lib/trove-1.0.2.jar;lib/ws-commons-util-1.0.1.jar;lib/wsdl4j-1.5.2.jar;lib/wstx-asl-3.0.1.jar;lib/xalan-2.7.0.jar;lib/xerces-1.2.3.jar;lib/xercesImpl-2.0.2.jar;lib/xfire-aegis-1.2.2.jar;lib/xfire-annotations-1.2.2.jar;lib/xfire-core-1.2.2.jar;lib/xfire-java5-1.2.2.jar;lib/xfire-jsr181-api-1.0-M1.jar;lib/xml-apis-1.0.b2.jar;lib/xmlParserAPIs-2.6.2.jar;lib/xmlrpc-2.0.jar;lib/xmlrpc-client-3.0.jar;lib/xmlrpc-common-3.0.jar;lib/xmlrpc-server-3.0.jar;lib/XmlSchema-1.1.jar;lib/xom-1.0b3.jar %DEBUG% fr.ifremer.isisfish.IsisFish %1 %2 %3 %4 %5 %6 %7 %8 %9 > error.txt 2>&1

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[Isis-fish-user] chargement base de données
by Dominique Pelletier 13 Jun '07

13 Jun '07

Bonjour, Merci. j'ai réussi à importer la BD. Dans windowsXP, le $HOME est généralement C:\Documents and Settings\user s'il y a un seul utilisateur. SInon, j'imagine qu'il faut rajouter le nom de l'utilisateur, ex: C:\Documents and Settings\user\dpellet J'ai qqes commentaires sur l'interface que je suis en train de rédiger à part. Je suis scotchée à l'étape suivante: je suis dans saisie de la pêcherie, j'ai donc les bases (celles de Julien) que j'ai importées comme il faut, et je veux les sélectionner. En cliquant dessus, il dit qu'il charge la base (en anglais), puis le message disparait, rien ne se passe et je ne vois pas apparaitre l'arbre de la région dans la partie gauche de la fenetre. J'ai essaye d'importer une base de la V2 pour voir (ecomodlangoustine13062006). Comme ci-dessus, il dit qu'il importe la base (en anglais), puis le message disparait, rien ne se passe et celà n'apparait jamais dans la combo, meme si on ferme et on reouvre la fenetre et le logiciel. merci d'avance de votre aide, c'est dur d'être loin et de devoir attendre le lendemain pour avoir de l'aide... A plus Dominique PS: Julien, j'ai pris les deux bases que tu m'as envoyées, elle sont bien importées, mais pas moyen de les ouvrir dans ISIS. Tu peux voir avec Benjamin ? -- Dominique Pelletier IFREMER Dept EMH / IRD Research Unit CoReUs IRD, BP A5, 98848 Noumea Cedex New Caledonia Tel: (687)260791 Mail : dominique.pelletier(a)noumea.ird.nc Local time: GMT+11

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[Isis-fish-user] premiere configuration ISIS
by Dominique Pelletier 11 Jun '07

11 Jun '07

Bonjour, Question plus prosaïque: J'ai installé la V3.0.18 et j'ai dézippé le fichier isis database correspondant que j'ai mis dans le meme repertoire que le go.bat. Qd je lance ISIS pour la première fois, celà prend un temps infini à charger le contenu de ce fichier (au bout de >1h, le curseur d'avancement est bloqué à 21Mo/254 Mo et ne progresse plus. Que dois-je faire ? Merci d'avance Dominique -- Dominique Pelletier IFREMER Dept EMH / IRD Research Unit CoReUs IRD, BP A5, 98848 Noumea Cedex New Caledonia Tel: (687)260791 Mail : dominique.pelletier(a)noumea.ird.nc Local time: GMT+11

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[Isis-fish-user] [annonce] Nouvelle version d'isis-fish 3.0.19
by Benjamin POUSSIN 07 Jun '07

07 Jun '07

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-fish-3.0.… pour savoir comment installer et lancer isis-fish http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/Installation.html changelog isis-fish (3.0.19) stable; urgency=low * bug in cache for String and number in parameter * bug RuleMonitor add Rule as parameter * add extraRules field in SimulationParameter to permit Analyse Plan to add rules in parameter Il faut mettre a jour le script de simulation Il faut aussi ajouter dans ta regle sigrid public void init(AnalysePlanContext context) throws Exception { // ajout des regles qui seront utilisé dans les parametres context.getParam().addExtraRules("Cantonnement", "TACpoids"); et modifier // on enleve les regles de la simulation passé List<Rule> paramRules = nextSimulation.getParameter().getRules(); c-a-d mettre nextSimulation au lieu de context. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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[Isis-fish-user] (sans objet)
by chirine HUSSEIN 31 May '07

31 May '07

Bonjour à tous, 1er point : Dans le lanceur de simulation. Serait-il possible de pouvoir importer un fichier texte contenant les effectifs (population numbers input), pour éviter de les saisir manuellement afin d’éviter les erreurs de saisie. Aussi, tel que s'est fait actuellement on est obligé de ressaisir à la main les effectifs, chaque fois qu’on change de règle de gestion. --------------------- 2ème point : Il me semble me souvenir que dans les versions précédentes (version 2 du moins), on pouvait visualiser le code en java des regles de gestion. Dans la nouvelle version, il semble que cela ne soit plus le cas, car on n’arrive pas à visualiser le code java. Or on souhaiterait implémenter des regles de gestion particulières du genre : Fermer la réserve partielle à tout type de pêche pendant l’année (on sait faire) ET reporter l’effort de pêche en dehors de la réserve (on sait pas faire). Merci de vos conseils Marion et Chirine _____________________________________________________________________________ Ne gardez plus qu'une seule adresse mail ! Copiez vos mails vers Yahoo! Mail

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[Isis-fish-user] astuce ISIS
by Hilaire DROUINEAU 29 May '07

29 May '07

pour essayer (rien de garantie....) d'améliorer les performances d'ISIS pour les windowsiens (désolé Benjamin ;-) ): essayer de créer modifier le fichier go.bat: devant java -Xmx512m -Xms256m -cp isis-fish-3.0.18.jar;... mettre @start /abovenormal /B L'inconvénient c'est que ça devrait par contre ralentir un peu les autres applications (mais vous faites que du ISIS :-) ...) A+ Hilaire -- Hilaire Drouineau IFREMER, département EMH Centre de Nantes - BP 21105 - 44311 Nantes Cedex 3 tel : +33 (0)2 40 37 42 12 - fax : +33 (0)2 40 37 40 75 email : hilaire.drouineau(a)ifremer.fr - web : http://www.ifremer.fr/emh **********************************************************************

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[Isis-fish-user] sauvegarde automatique de isis-database-3
by Stephanie MAHEVAS 28 May '07

28 May '07

Pour ceux qui veulent sauvegarder automatiquement leur base + tous les scripts, Hilaire a propose un fichier bat qui se lance automatiquement selon son choix (tous les jours, ...) pour windows. Il suffit 1/ de modifier le fichier ci-joint en fonction de ses repertoires et disques reseau 2/ copier le fichier sur son disque dur 3/ d'aller dans le panneau de config, de lancer Tache plannifiee, de créer une nouvelle, de sélectoinner le fichier et de paramétrer la tache bon we stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ...................................................................... xcopy "c:\Documents and Settings\smahevas\isis-database-3" s:\BDIsisFish\isis-database-3-SM /D /E /Y

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[Isis-fish-user] [annonce] Nouvelle version d'isis-fish 3.0.18
by Benjamin POUSSIN 25 May '07

25 May '07

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version3/isis-fish-3.0.… pour savoir comment installer et lancer isis-fish http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/v3/user/Installation.html changelog isis-fish (3.0.18) stable; urgency=low * bug go.bat have correct DOS end of line * improve build-release.sh to send email to user and devel list after deploy * bug correction in delete simulation, remove close context at begin of clear method * bug permit simulation without SimulationControl * bug in queue model test if no more simulation to prevent Index Out of bound Exception -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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