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Version pour tester le nouveau getRecruitment
by Benjamin POUSSIN 28 Feb '17

28 Feb '17

Salut, Sigrid voilà une version ou il y a le changement que l'on avait discuter pour le recrutement, si tu pouvais tester et me dire que ça fonctionne :p https://forge.codelutin.com/attachments/download/4536/isis-fish-4.4.1.0-r43… Normalement le 1er mois de recrutement n'a jamais de changement d'age, les mois suivants peuvent en avoir exemples le changement d'age se fait au 1er janvier, étalement de 2, 1 mois de repro: - le recrutement commence en décembre, pas de changement d'age pour décembre, mais ceux qui arrive en janvier arriverons en age 1 - le recrutement commence en janvier, pas de changement d'age (pour aucun) - le recrutement commence en mai, pas de changement d'age (pour aucun) -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Re: [Isis-fish-devel] [Isis-fish-users] nullpointer exception au lancement d'ISIS
by smahevas 23 Feb '17

23 Feb '17

il faut supprimer tous les fichiers .svn ? si c'est ca je peux le faire, mais ce qui m'inquiete c'est plutot que cela ne soit pas solutionne de maniere plus rigoureuse. Ca fait deux fois que cela se produit dans des circonstances differentes. Il faudrait comprendre d'ou ca vient... Le 2017-02-22 16:09, Eric Chatellier a écrit : > Le 22/02/2017 à 14:38, smahevas a écrit : > >> nan.... > C'est étrange. > Tu veux que je refasse la manipulation de la dernière fois (via teamviewer) ?

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methode d'import de matrices avec semantics (benjamin)
by Sigrid Lehuta 16 Feb '17

16 Feb '17

Bonjour, je venais au nouvelles concernant la méthode de la librairie nuiton matrix qui doit permettre d'importer des matrices depui sun csv avec les semantics. Benjamin devait continuer à la modifier, je voulais savoir si elle était désormais prête et si oui s'il était possible d'avoir une doc. Merci. Sigrid

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CR reunion optim etc
by Sigrid Lehuta 19 Jan '17

19 Jan '17

A suivre !

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get recruitment : fait-il vraiment ce qu on veut ?
by Sigrid Lehuta 06 Jan '17

06 Jan '17

Hello j'ai un cas un peu special de reproduction qui me fait douter que getRecruitment fasse ce qu on avait prévu. En pj ce qu on avait etabli. Mon exemple : la sole est structurée en age avec des classes d'age allant de 1 à 11. (les ages 0 ne sont pas décrits dans le modèle group 0 = age1). La repro a lieu de février à juin et produit des oeufs qui recrutent a l age 1 à partir de janvier de l'année suivante, j'ai donc un delta entre repro et recru de 11 mois. Si je paramètre ISIS de cette facon, les recruts arrivent dans la classe 1 d'age 2 et non dans la classe 0 d'age 1. Si je mets delta = 0 ils arrivent des leur mois de ponte dans la classe 0 d'age 1. En fait, pour une pop en age, ils ne devraient pas subirent le changement de classe pendant qu'ils sont group null. Je dirais meme mais c'est plus compliqué, qu'ils doivent recruter dans la classe dont l'age correspond a delta repro-recru en tenant compte des mois de repro et changement de classe. Je crois qu on a déjà eu ces débats, et le ppt joint semble les évoquer, mais je ne parviens plus a comprendre pourquoi ils continuent à changer de classe... Steph, Eric, Merci de votre aide. Sigrid

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Ressources Isis-fish
by Postmaster ISIS-Fish 31 Dec '16

31 Dec '16

Amis utilisateurs d'ISIS-Fish, Ce mail automatique, envoyé tous les 3 mois sur les listes de diffusions du projet, a pour but de vous rappeler toutes les ressources disponibles pour toutes vos éventuelles questions et problèmes. Documentation et manuel utilisateurs ------------------------------------ La documentation d'ISIS-Fish est présente sur le site à cette adresse : http://isis-fish.org/v4/index.html. N'hésitez pas à nous remonter les parties qui ne sont pas claires ou les parties qui ne sont pas à jour, le logiciel évoluant, certaines parties de la documentation sont peut-être obsolètes. Questions et FAQ ---------------- Vous pouvez poser vos questions à cette même liste de diffusion en envoyant un mail à isis-fish-users(a)list.isis-fish.org. Toutes les personnes abonnées le recevront et pourront répondre à vos éventuelles questions. N'oubliez pas, avant de poser votre question, de rechercher parmis les archives de la liste (http://list.isis-fish.org/pipermail/isis-fish-users/) votre question a peut-être déjà été posée. Les questions les plus fréquemment posées sont regroupées sur le site sur la page FAQ : http://isis-fish.org/v4/user/FAQ.html Forge, rapports de bug, suivi des évolutions -------------------------------------------- Si vous rencontrez un bug, vous pouvez vérifier sur la forge ISIS-Fish (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/issues) si nous en avons déjà connaissance. Si nous n'en avons pas connaissance, vous pouvez nous rapporter le bug, nous l'intègrerons dans la liste des évolutions prévues (http://forge.codelutin.com/projects/isis-fish/roadmap) Pour rapporter un bug (ou une demande d'évolution), donnez nous le maximum de détails sur ce bug (comment vous l'avez obtenu ? votre base, vos paramètres et le fichier debug.txt). Plus nous avons d'informations, plus nous pourrons vous aider simplement. L'équipe ISIS-Fish

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Site isis téléchargement de base et simulation
by Benjamin POUSSIN 14 Dec '16

14 Dec '16

Salut Stéphanie peut-être n'as tu pas eu le temps, mais tu as ajouter des liens pour télécharger des simulations, mais tu n'as pas mis les fichiers de simulations sur le serveur :( donc forcément ça marche moins bien :D Sur la page: http://isis-fish.org/download.html Il manque: http://isis-fish.org/downloads/sim_sim_STATUQUO50ANS_cantonnement_2016-05-1… http://isis-fish.org/downloads/sim_Zoe_bateau1218m_sc1_2016-05-10-22-38.zip http://isis-fish.org/downloads/sim_Zoe_bateausup18m_sc2_2016-05-10-22-47.zip http://isis-fish.org/downloads/sim_Zoe_bateauInf12msup18m_sc3_2016-05-10-22… -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Fw: bibliothèques calcul num
by Benjamin POUSSIN 25 Nov '16

25 Nov '16

Quelques librairies mathématique qui pourraient servir ou pas :D ----- Message Transféré ----- Date: Thu, 24 Nov 2016 10:12:27 +0100 De: Nicolas Dumoulin <nicolas.dumoulin(a)irstea.fr> À: "Benjamin POUSSIN" <poussin(a)codelutin.com> Sujet: bibliothèques calcul num - MOEA framework http://moeaframework.org/ On a un peu joué avec l'API pour calculer du sobol : http://moeaframework.org/javadoc/org/moeaframework/analysis/sensitivity/Sob… - scala - Breeze qui fait parti du projet scalanlp : http://www.scalanlp.org/ La syntaxe est vraiment sympa pour en avoir un peu pratiqué en scala, presque autant pratique que python/numpy ;-) https://github.com/scalanlp/breeze/wiki/Linear-Algebra-Cheat-Sheet - du code maison pour être confortable avec SSJ pour générer des nombres aléatoires et tirer dans des tables de distribution : http://trac.clermont.cemagref.fr/projets/PRIMA/browser/prima-regional-model… -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Comportement souhaitez pour le copier/coller entre région
by Benjamin POUSSIN 04 Nov '16

04 Nov '16

Salut, Je suis sur la fonctionnalité qui permet de copier/coller (en fait c'est plutôt exporter/importer) des données entre région. Bien sur cela pose forcément des problèmes :D, j'aimerais savoir ce que l'utilisateur doit avoir le droit de faire ou pas faire. Par exemple j'importe une Population: - sa Species n'existe pas: - j'importe la Species de la population ? - je propose à l'utilisateur de choisir une des Species présentes ? - je ne permet pas l'import ? - Les zones utilisées n'existent pas: - j'importe les zones manquante (se pose alors le problème des Cells) ? - je demande à l'utilisateur de choisir une zone pour chaque zone non trouvé dans la région ? - je ne permet pas l'import ? Ca c'était le cas simple, si on souhaite maintenant importer une Strategy: - la strategy peut avoir des SetOfVessels qui pointent vers des métier qui pointent vers des Gear qui pointent vers des Populations (via la sélectivité) qui pointent vers des zones qui pointent vers des cells Donc si rien n'existe dans la région cible je recrée tout ? Je coupe pour n'importer que la Strategy et l'utilisateur devra recréer les SetOfVessels ? J'importe les SetOfVessels mais que sur les métiers existants et propose de remplacer les métiers inexistant par des métiers de la région ? Donc voilà, je vous laisse un peu réfléchir sur ces problèmes, mais je pense que le mieux est qu'on en discute de vive voix. Auriez-vous une date ou je pourrais venir à l'Ifremer ? -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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Développement en cours besoin d'information
by Benjamin POUSSIN 04 Nov '16

04 Nov '16

Salut, Je suis en train d'avancer sur le dernier contrat, mais pour certains points il faut que vous me fournissiez des informations. - Export de tous les paramètres de la base dans un certain format pour pouvoir illustrer un papier. Il faudrait que vous me fournissiez le format que vous souhaitez. Le plus simple est sans doute que je vienne à l'Ifremer pour qu'on en discuter ensemble. (Quand ?) - Valeur par défaut pour les équations (Et plus globalement pour tous les paramètres). La encore, il faudrait que vous me fournissiez les valeurs par défaut à utiliser lors de la création de nouveau objet dans la base. -- Benjamin POUSSIN -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com http://www.codelutin.com

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