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[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 2.3.0
by Benjamin POUSSIN 23 Jun '06

23 Jun '06

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version2/ifremer-simula… * passage en equation de EspecesCapturables On dispose dans l'eequation de : group de type ClassePopulation metaPop de type MetaPopulation infoSaisonMetier de type InfoSaisonMetier capturePrimaire de type boolean et toujours db qui est le DBManager. ps: c une 2.3 donc il y a changement de structure de base -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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configurer le logMonitor
by Francois.Bastardie＠ifremer.fr 13 Jun '06

13 Jun '06

Bonjour Benjamin, je souhaiterais voir les valeurs prises par les variables au cours de la simulation dans la fenêtre 'help>logMonitor>log stream'. Pour ce faire il semblerait qu'il faille lancer isis avec l'option: -Djava.util.logging.config.file=isis-logging.properties dans la ligne de commande?? par contre je ne sais pas comment configurer les log 'WARNING'? j'ai pour le moment dans le log: 9 juin 2006 15:38:41 - INFO - *=============== Mois de May annee:0 =============* 9 juin 2006 15:38:41 - INFO - UsedMem: 43904 9 juin 2006 15:38:41 - INFO - cache size: cached: 5203 calculated: 5040 9 juin 2006 15:38:41 - INFO - CallAnalyse: [catchRatePerStrategyMet calls=2016 time=7,826s(25702ns/3,882ms/476,273ms) memory=4,055Mo(-3,309Mo/2,06Ko/2,531Mo), etc. 9 juin 2006 15:38:41 - WARNING - strategy=BenthicIntermediateGuilvinec metier=nonActivite tripDuration=24.0 travelTime=58.957947 9 juin 2006 15:38:41 - WARNING - strategy=uneFleetSansEffort metier=nonActivite tripDuration=24.0 travelTime=58.957947 etc. mais dans le code java j'ai : try {if(log.isLoggable(Level.FINEST)) log.finest( 689 " strategy=" + strategy + 690 " metier=" + metier + 691 " nbTrips=" + nbTrips + 692 " fishingTime=" + fishingTime + 693 " stdEffortPerHour=" + stdEffortPerHour 694 );} catch (Exception logsE) { System.err.println("Error in Logging instructions"); logsE.printStackTrace(); } 695 mais ces infos n'apparaissent pas dans le logMonitor...pourquoi d'après toi? il semble pourtant que j'ai des variables configurées à 'FINEST' dans le fichier 'logging.properties'... Merci d'avance -- -------------------------------------------------------- François Bastardie French Research Institute for the Development of the Sea (IFREMER) Ecologie et Modèles pour l'Halieutique Rue de l'Ile d'Yeu BP 21105 44311 NANTES Cedex 03 - France Tél : 02 40 37 41 64 Fax : 02 40 37 40 75 E-mail : francois.bastardie(a)ifremer.fr

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Re: [Isis-fish-devel] bases
by Jean-Sebastien Kolusniewski 09 Jun '06

09 Jun '06

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Pb dans le calcul du temps de route
by Stephanie MAHEVAS 08 Jun '06

08 Jun '06

bonjour il semblerait que les calculs de temps de route ne soient pas corrects. Je suis allee voir la formule de plus pres. Il me semble qu'il y a une erreur. Les latitudes et longitudes sont multipliees dans la formule par 180/pi, transformation necessaire pour passer de radian en degre. Les longitudes et latitudes ne sont-elles pas deja en degre? (C'est ainsi qu'elles apparaissent dans l'interface). merci a benjamin de verifier et de faire la correction tel est le cas. bonne soiree stephanie -- ...................................................................... Stephanie MAHEVAS (Stephanie.Mahevas(a)ifremer.fr) IFREMER/EMH (Ecologie et Modèles pour l'Halieutique) Tel: 02 40 37 41 81 Fax: 02 40 37 40 75 o \ o / _ o __| \ / |__ o _ \ o / o /|\ | /\ ___\o \o | o/ o/__ /\ | /|\ / \ / \ | \ /) | ( \ /o\ / ) | (\ / | / \ / \ ......................................................................

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bases
by Jean-Sebastien Kolusniewski 08 Jun '06

08 Jun '06

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message d'erreur
by Jean-Sebastien Kolusniewski 07 Jun '06

07 Jun '06

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[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 2.2.6
by Benjamin POUSSIN 07 Jun '06

07 Jun '06

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version2/ifremer-simula… * sauvegarde des simulations directement dans un fichier compressé sans passé par une représentation DOM pour une utilisation moindre de la mémoire * getMailleSecteur retourne une liste vide si la zone pour lequelle on souhaite les mailles est null. Ca evite une Exception. Mais les resultats seront faux puisque les données sont fausses. * ajout d'un log warning si un metier n'a pas de zone pour un mois donné -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 2.2.5
by Benjamin POUSSIN 02 Jun '06

02 Jun '06

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version2/ifremer-simula… * correction bug introduit par l'optimisation (fishingMortality trop souvent recupérée dans le cache, car pas de discremination sur le metier) * sauvegarde des simulations avant la sauvegarde des resultats (si la sauvegarde des resultats echoue on conserve les parametres de lancement) * matrix ajout d'un ascenseur horizontal, ajout d'un menu contextuel (copier/coller, export/import cvs) Voila, les matrices ont maintenant un menu contextuel pour faire des imports/exports. Ils restent quelques petites erreurs qui seront corrigées la semaine prochaine: - si on importe avec des semantiques et qu'elles contiennent des chiffres cela pose probleme (sauf si vos chaine sont delimitée par ") - si on selectionne des valeurs de la colonne de semantique et que l'on exporte cela pose probleme - lorsque l'on ecrit un fichier, il faut bien mettre un retour chariot a la fin du fichier - lorsque l'on fait copie depuis un fichier texte, il faut bien prendre le retour chariot de la derniere ligne Fonctionnement: - si la matrice a coller est trop petite ou trop grosse elle est ajustée pour etre collé - il faut separer les valeurs par des ;, le ; en fin de ligne n'est pas utile (en fait, d'autre separateur doivent fonctionner aussi (espace, virgule, tabulation, ...) exemple: 3;0.6;9; 5;6;7; ou 3 0.6 9 5 6 7 autre exemple avec des semantiques "";"zone L21E8";"zone L22E6"; "nephrops 1";6.0;7.0; "nephrops 2";0.0;9.0; "nephrops 3";6.0;7.0; -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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RE: [Isis-fish-devel] [annonce] Nouvelle version d'isis-fish 2.2.5
by Jean-Sebastien Kolusniewski 02 Jun '06

02 Jun '06

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[annonce] Nouvelle version d'isis-fish 2.2.4
by Benjamin POUSSIN 23 May '06

23 May '06

Bonjour, Une nouvelle version d'isis-fish vient d'être mise en place : http://isis-fish.labs.libre-entreprise.org/download/version2/ifremer-simula… * optimization de HashMapMultiKey, Matrix (checkPos, checkDim), SiMatrice2 * utilisation de LRUMapMultiKey a la place de HashMapMultiKey * suppression de tous les caches autres que LRU * correction memory leak dans les Optimisations (il provenait de la modification du hashCode des MultiKey au cours du temps, les maps ne trouvaient plus les objets a supprimer) * ajout du support de la base de données h2 L'utilisation de la nouvelle base de donné ameliore d'un facteur 3 a 5 les performances lors de l'acces au données, mais elle ne represente que 16% du temps de simulation, donc il n'y a pas d'obligation a changer la base. Si vous souhaiez utiliser la base h2 a la place de mckoi, il faut commencer par faire une sauvegarde de sa base. ensuite il faut modifier les valeurs de dans la config de: jdbcLogin="sa" jdbcPassword="" <-- vide, rien jdbcDriver="org.h2.Driver" jdbcUrl="jdbc:h2:file://" database="/home/poussin/isis-database-2/h2data" cache="/tmp/isis-database-2/cache/h2data" database et cache ne sont que des exemples a modifier selon se que vous avez deja. Ce qui est important est de fichier par h2data (ce qui n'etait pas le cas avec mckoi) Puis relancer isis et importer la base sauvegardé Voici les résultats d'une simulation sans regles de gestion sur la pecherie (Golfe de Gascogne) de stephanie (12 Str, 20 met) 15:46:52 [INFO ] *=============== Mois de janvier annee:0 =============* 15:47:19 [INFO ] *=============== Mois de fevrier annee:0 =============* 15:47:44 [INFO ] *=============== Mois de mars annee:0 =============* 15:48:10 [INFO ] *=============== Mois de avril annee:0 =============* 15:48:34 [INFO ] *=============== Mois de mai annee:0 =============* 15:49:03 [INFO ] *=============== Mois de juin annee:0 =============* 15:49:30 [INFO ] *=============== Mois de juillet annee:0 =============* 15:49:57 [INFO ] *=============== Mois de aout annee:0 =============* 15:50:24 [INFO ] *=============== Mois de septembre annee:0 =============* 15:50:48 [INFO ] *=============== Mois de octobre annee:0 =============* 15:51:11 [INFO ] *=============== Mois de novembre annee:0 =============* 15:51:38 [INFO ] *=============== Mois de decembre annee:0 =============* 15:52:03 [INFO ] *=============== Mois de janvier annee:1 =============* ... 15:58:02 [INFO ] *=============== Mois de janvier annee:2 =============* 15:58:39 [INFO ] *=============== Mois de fevrier annee:2 =============* 15:59:17 [INFO ] *=============== Mois de mars annee:2 =============* 15:59:52 [INFO ] *=============== Mois de avril annee:2 =============* ... 16:11:23 [INFO ] *=============== Mois de janvier annee:4 =============* 16:11:48 [INFO ] *=============== Mois de fevrier annee:4 =============* ... 16:23:39 [INFO ] *=============== Mois de aout annee:5 =============* 16:24:11 [INFO ] *=============== Mois de septembre annee:5 =============* 16:24:37 [INFO ] *=============== Mois de octobre annee:5 =============* Donc en gros 30 secondes par pas de temps. en utilisant -DOptimizationCache=SimpleLRU=25000 Dans cette simulation le simulateur utilise pour un mois ~10000 et ~17000 entre du cache """15:47:19 [INFO ] cache size: cached: 10614 calculated: 16805""" <- apres le 1er mois donc mettre la taille a 25000 est raisonnable on peut la mettre a 50000 mais il faudra alors mettre plus de Ram allouer a isis (option -mx) En gros avec un cache a 25000 on utilise 100Mo de Ram, si on le passe a 50000 il faut 200Mo de Ram. Il faut pensez qu'il faut aussi laisser de la place pour les resultats. Donc pour ma simulation sur 10 ans, en mettant 25000, le cache me prend 100Mo, le simulateur a la base prend 50Mo. J'ai limite a 512Mo la taille memoire pour le simulateur, cela me laise donc 350Mo pour les resulats. En gros pour 66 pas de temps il faut 200Mo pour les resultats, ce qui fait 3 Mo par pas de temps. -- Benjamin -------------------- tél: +33 (0) 2 40 50 29 28 email: poussin(a)codelutin.com () campagne du ruban ascii http://www.codelutin.com /\ pour les mails en ascii

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